59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0336 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0336  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  100 
 
 
414 aa  854    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2922  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  59.52 
 
 
415 aa  514  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113805  hitchhiker  0.00114048 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0977  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  48.18 
 
 
406 aa  397  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1829  molydopterin dinucleotide-binding region  35.82 
 
 
587 aa  266  7e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1096  molybdopterin oxidoreductase  36.26 
 
 
430 aa  261  2e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  34.75 
 
 
574 aa  257  3e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2235  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  34.92 
 
 
437 aa  250  4e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.291466  normal  0.0456097 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0620  molybdopterin oxidoreductase  34.82 
 
 
437 aa  247  2e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.475538  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1187  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  36.19 
 
 
429 aa  247  4e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.639664  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0244  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  34.35 
 
 
438 aa  244  3e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.833805  normal  0.256127 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2108  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  33.81 
 
 
434 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0980  molybdopterin oxidoreductase  33.64 
 
 
434 aa  237  2e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0412104  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0966  tungsten containing formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  33.88 
 
 
434 aa  237  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0067  molybdopterin oxidoreductase  35.51 
 
 
434 aa  237  3e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.589018  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0100  molybdopterin oxidoreductase  34.6 
 
 
434 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.193455  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1715  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  33.57 
 
 
437 aa  235  8e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1983  molybdopterin oxidoreductase  32.55 
 
 
439 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1462  molybdopterin oxidoreductase  35.78 
 
 
434 aa  230  3e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0993  molybdopterin oxidoreductase  32.86 
 
 
434 aa  224  2e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0372  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  33.64 
 
 
456 aa  219  5e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1988  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  32.86 
 
 
443 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.209103  normal  0.117203 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0877  molybdopterin oxidoreductase  31.52 
 
 
461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138974  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1994  molybdopterin oxidoreductase  32.15 
 
 
467 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0821862  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0203  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  32.78 
 
 
454 aa  211  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1292  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  33.9 
 
 
433 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.646537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1763  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  33.66 
 
 
470 aa  203  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0281  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  33.74 
 
 
435 aa  200  5e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1471  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  30.47 
 
 
461 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1560  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  32.43 
 
 
454 aa  192  7e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264444  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0085  molybdopterin oxidoreductase  30.15 
 
 
447 aa  182  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1449  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  31.62 
 
 
442 aa  176  7e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0380  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  31.62 
 
 
443 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1532  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  31.13 
 
 
443 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00478576 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1664  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  30.39 
 
 
442 aa  173  5e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.827559  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2299  Formylmethanofuran dehydrogenase subunit B-like protein  25.35 
 
 
427 aa  112  8.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122072  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2860  formylmethanofuran dehydrogenase  23.79 
 
 
423 aa  90.1  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.807809  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0025  formylmethanofuran dehydrogenase  22.42 
 
 
425 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2623  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  24.76 
 
 
423 aa  84.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6504  formyltransferase/hydrolase complex subunit B(FhcB)  24.64 
 
 
469 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0374331 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1662  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  24.76 
 
 
434 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130611  normal  0.319857 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2461  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  23 
 
 
466 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1796  formylmethanofuran dehydrogenase  23.34 
 
 
440 aa  60.5  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00519016  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3067  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  22.84 
 
 
410 aa  51.2  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5935  formylmethanofuran dehydrogenase  20.74 
 
 
446 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.911434  normal  0.0527378 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0178  molybdopterin oxidoreductase  22.17 
 
 
891 aa  49.7  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2400  tungsten-containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  24.66 
 
 
369 aa  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1405  molybdopterin oxidoreductase  22.42 
 
 
720 aa  47.4  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0169  molybdopterin oxidoreductase  22.11 
 
 
720 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3136  formylmethanofuran dehydrogenase  22.33 
 
 
433 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2321  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  22.88 
 
 
835 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.269586  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1331  NADH dehydrogenase subunit G  22.63 
 
 
872 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.21 
 
 
715 aa  43.5  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  23.21 
 
 
715 aa  43.5  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.21 
 
 
715 aa  43.5  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  23.21 
 
 
715 aa  43.5  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  23.21 
 
 
715 aa  43.1  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  23.21 
 
 
715 aa  43.1  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1975  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.08 
 
 
769 aa  43.1  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0281  formate dehydrogenase alpha subunit  23.68 
 
 
559 aa  43.1  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.276647 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>