More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0620 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0620  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 437 aa  910    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.475538  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2235  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  78.9 
 
 		 437 aa  753    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.291466  normal  0.0456097 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1983  molybdopterin oxidoreductase  75.8 
 
 		 439 aa  709    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0244  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  79.82 
 
 		 438 aa  740    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.833805  normal  0.256127 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0877  molybdopterin oxidoreductase  66.9 
 
 		 461 aa  628  1e-179  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0372  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  57.21 
 
 		 456 aa  550  1e-155  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1988  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  58.54 
 
 		 443 aa  549  1e-155  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.209103  normal  0.117203 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0203  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  56.19 
 
 		 454 aa  521  1e-146  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1471  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  54.25 
 
 		 461 aa  513  1e-144  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1994  molybdopterin oxidoreductase  53.38 
 
 		 467 aa  508  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0821862  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0980  molybdopterin oxidoreductase  53.83 
 
 		 434 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0412104  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1715  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  53.83 
 
 		 437 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0966  tungsten containing formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  53.83 
 
 		 434 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0993  molybdopterin oxidoreductase  53.69 
 
 		 434 aa  491  1e-137  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0067  molybdopterin oxidoreductase  50.46 
 
 		 434 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.589018  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0100  molybdopterin oxidoreductase  50.23 
 
 		 434 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.193455  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1462  molybdopterin oxidoreductase  50 
 
 		 434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2108  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  46 
 
 		 434 aa  429  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1829  molydopterin dinucleotide-binding region  45.01 
 
 		 587 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1187  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  47.33 
 
 		 429 aa  412  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.639664  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  43.82 
 
 		 574 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1096  molybdopterin oxidoreductase  47.13 
 
 		 430 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1664  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  41.46 
 
 		 442 aa  374  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.827559  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0380  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  40.64 
 
 		 443 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1449  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  41 
 
 		 442 aa  368  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0085  molybdopterin oxidoreductase  40.77 
 
 		 447 aa  368  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1532  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  40.5 
 
 		 443 aa  366  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00478576 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0281  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  38.94 
 
 		 435 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1292  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  36.74 
 
 		 433 aa  323  5e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.646537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1763  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  36.19 
 
 		 470 aa  315  8e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1560  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  36.57 
 
 		 454 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0977  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  36.08 
 
 		 406 aa  249  9e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0336  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  34.82 
 
 		 414 aa  247  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2922  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  31.62 
 
 		 415 aa  206  6e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113805  hitchhiker  0.00114048 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0025  formylmethanofuran dehydrogenase  26.09 
 
 		 425 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2860  formylmethanofuran dehydrogenase  27.45 
 
 		 423 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.807809  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1662  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  26.88 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130611  normal  0.319857 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1999  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.54 
 
 		 657 aa  107  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2424  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.35 
 
 		 718 aa  103  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.680227 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.27 
 
 		 901 aa  100  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.89 
 
 		 879 aa  97.8  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00920  formate dehydrogenase alpha subunit  27.95 
 
 		 737 aa  97.4  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.35 
 
 		 924 aa  95.5  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.2 
 
 		 924 aa  95.5  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1457  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.49 
 
 		 657 aa  95.5  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.1 
 
 		 685 aa  95.5  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2859  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.87 
 
 		 808 aa  94  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2623  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  24.89 
 
 		 423 aa  94  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3566  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.3 
 
 		 886 aa  93.6  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0757584 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4642  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.3 
 
 		 886 aa  93.6  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0800652  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  24.6 
 
 		 715 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  24.6 
 
 		 715 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  24.6 
 
 		 715 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.6 
 
 		 715 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.7 
 
 		 959 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  24.6 
 
 		 715 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0059  molybdopterin oxidoreductase  27.78 
 
 		 949 aa  92.4  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.65892  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.6 
 
 		 715 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.56 
 
 		 960 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.86 
 
 		 898 aa  92  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.56 
 
 		 960 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.54 
 
 		 676 aa  90.5  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.05 
 
 		 900 aa  90.5  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6504  formyltransferase/hydrolase complex subunit B(FhcB)  24.32 
 
 		 469 aa  90.5  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0374331 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4391  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.87 
 
 		 886 aa  89.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4523  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.87 
 
 		 886 aa  89.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.195662  normal  0.224956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.27 
 
 		 960 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.36 
 
 		 685 aa  89.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.87 
 
 		 724 aa  89.4  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.2 
 
 		 963 aa  88.2  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.03 
 
 		 917 aa  89  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2299  Formylmethanofuran dehydrogenase subunit B-like protein  21.88 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122072  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.04 
 
 		 668 aa  88.6  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.78 
 
 		 973 aa  87.8  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.09 
 
 		 686 aa  88.2  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.21 
 
 		 676 aa  87.8  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4578  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.05 
 
 		 723 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1453  formate dehydrogenase  26.32 
 
 		 951 aa  87.4  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1796  formylmethanofuran dehydrogenase  25.81 
 
 		 440 aa  87.8  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00519016  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2721  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.45 
 
 		 716 aa  87.4  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0016187  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.17 
 
 		 674 aa  87  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.01 
 
 		 662 aa  87  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.64 
 
 		 979 aa  86.7  7e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2427  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.14 
 
 		 929 aa  86.7  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4421  molybdopterin oxidoreductase  27.19 
 
 		 949 aa  87  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.71 
 
 		 676 aa  86.7  7e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0450  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.25 
 
 		 984 aa  86.7  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.858013  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.25 
 
 		 984 aa  86.7  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.25 
 
 		 984 aa  86.7  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  25 
 
 		 986 aa  86.7  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0180  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.25 
 
 		 984 aa  86.7  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1753  formate dehydrogenase alpha subunit  26.01 
 
 		 716 aa  86.3  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0179443  hitchhiker  0.000996092 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  27.25 
 
 		 984 aa  86.3  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2902  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.25 
 
 		 984 aa  86.3  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679741  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3791  formate dehydrogenase alpha subunit  26.16 
 
 		 950 aa  86.3  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3681  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.27 
 
 		 979 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.725199  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2964  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.25 
 
 		 984 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.82 
 
 		 933 aa  86.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3367  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.33 
 
 		 979 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3331  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.33 
 
 		 979 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>