73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0561 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0561  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 
128 aa  263  4e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1426  molydopterin dinucleotide-binding region  85.94 
 
 
128 aa  233  7e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0344  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  85.16 
 
 
128 aa  231  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0493  molydopterin dinucleotide-binding region  84.38 
 
 
128 aa  229  1e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0101  molydopterin dinucleotide-binding region  40.62 
 
 
130 aa  105  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1463  molydopterin dinucleotide-binding region  39.06 
 
 
130 aa  103  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0621  molydopterin dinucleotide-binding region  44.88 
 
 
133 aa  99.4  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270676  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1984  molydopterin dinucleotide-binding region  44.26 
 
 
133 aa  94  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2237  molydopterin dinucleotide-binding region  44.09 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.0380736 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2236  molydopterin dinucleotide-binding region  42.61 
 
 
134 aa  90.9  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.0387564 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1186  molydopterin dinucleotide-binding region  40.65 
 
 
129 aa  89  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0619924  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0243  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  42.98 
 
 
131 aa  87.4  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.208129  normal  0.212279 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1095  molydopterin dinucleotide-binding region  38.4 
 
 
123 aa  86.7  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  34.43 
 
 
574 aa  80.9  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0976  molydopterin dinucleotide-binding region  33.87 
 
 
125 aa  80.1  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1470  molydopterin dinucleotide-binding region  37.5 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2107  molydopterin dinucleotide-binding region  35.77 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0878  molydopterin dinucleotide-binding region  36.67 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0204  molydopterin dinucleotide-binding region  37.39 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0715847 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1993  molydopterin dinucleotide-binding region  35.25 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0699041  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1987  molydopterin dinucleotide-binding region  37.25 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.295284  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0373  molydopterin dinucleotide-binding region  38.24 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.827239  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  39.17 
 
 
415 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  40 
 
 
415 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  39.17 
 
 
415 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1291  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  33.85 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  34.13 
 
 
425 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0282  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  32.56 
 
 
129 aa  57.4  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1829  molydopterin dinucleotide-binding region  31.68 
 
 
587 aa  55.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2923  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  29.41 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0830145  hitchhiker  0.000724487 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  33.61 
 
 
424 aa  52.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.97 
 
 
963 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2383  nitrate reductase catalytic subunit  32.91 
 
 
831 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0655186  normal  0.338033 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1910  nitrate reductase catalytic subunit  32.91 
 
 
829 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.930767  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1936  nitrate reductase catalytic subunit  32.91 
 
 
829 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.243568  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1943  nitrate reductase catalytic subunit  32.91 
 
 
829 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.212211  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1999  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.73 
 
 
657 aa  46.2  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1770  nitrate reductase catalytic subunit  32.91 
 
 
831 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2553  nitrate reductase catalytic subunit  32.91 
 
 
829 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.4401  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0337  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  26.36 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5704  arsenite oxidase, large subunit  29.09 
 
 
829 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.342827  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1900  nitrate reductase catalytic subunit  31.65 
 
 
829 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000194918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2135  nitrate reductase catalytic subunit  31.65 
 
 
829 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411106 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1842  nitrate reductase catalytic subunit  31.65 
 
 
829 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.889762  hitchhiker  0.000540114 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1903  nitrate reductase catalytic subunit  31.65 
 
 
829 aa  44.7  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2427  nitrate reductase catalytic subunit  30.38 
 
 
829 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0968104  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2338  molybdopterin oxidoreductase  37.74 
 
 
884 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3950  arsenite oxidase large subunit  29.81 
 
 
820 aa  43.5  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.616487  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  27.73 
 
 
695 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1622  nitrate reductase catalytic subunit  31.65 
 
 
831 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0868309  normal  0.125549 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0952  nitrate reductase catalytic subunit  29.57 
 
 
837 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2680  nitrate reductase catalytic subunit  30.38 
 
 
831 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.232785  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1497  nitrate reductase catalytic subunit  30.38 
 
 
829 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1862  nitrate reductase catalytic subunit  26.32 
 
 
834 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  32.1 
 
 
687 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0438  nitrate reductase catalytic subunit  37.93 
 
 
934 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000251806  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.66 
 
 
687 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4072  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.25 
 
 
957 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0084  nitrate reductase catalytic subunit  30.51 
 
 
831 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1716  nitrate reductase catalytic subunit  37.04 
 
 
920 aa  42  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.207825  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2844  nitrate reductase catalytic subunit  31.25 
 
 
838 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0367  nitrate reductase catalytic subunit  28.7 
 
 
827 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.870731  hitchhiker  0.000366868 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2438  nitrate reductase catalytic subunit  31.25 
 
 
839 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.627702 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4696  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  35.19 
 
 
847 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0792872  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4063  nitrate reductase catalytic subunit  31.25 
 
 
831 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127996  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0724  periplasmic nitrate reductase, large subunit  39.66 
 
 
929 aa  41.2  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2333  molybdopterin oxidoreductase  33.96 
 
 
880 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.51 
 
 
686 aa  40.4  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0801  nitrate reductase catalytic subunit  30.86 
 
 
923 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.237228  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07590  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  27.93 
 
 
851 aa  40.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.676481 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0871  nitrate reductase catalytic subunit  30.86 
 
 
924 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.21 
 
 
688 aa  40  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1739  molybdopterin oxidoreductase  40.38 
 
 
854 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418465  normal  0.0195226 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>