More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3950 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5704  arsenite oxidase, large subunit  49.4 
 
 		 829 aa  821    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.342827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3084  arsenate reductase (azurin)  47.69 
 
 		 827 aa  779    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4427  arsenate reductase (azurin)  80.49 
 
 		 820 aa  1399    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3950  arsenite oxidase large subunit  100 
 
 		 820 aa  1703    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.616487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5678  arsenite oxidase, large subunit  49.88 
 
 		 829 aa  826    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0377  arsenite oxidase, large subunit  38.95 
 
 		 861 aa  512  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.103982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0382  arsenite oxidase, large subunit  36.77 
 
 		 854 aa  501  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000386632  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2365  arsenite oxidase, large subunit  36.01 
 
 		 853 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1369  molydopterin dinucleotide-binding region  31.03 
 
 		 1026 aa  259  1e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.408174 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  27.55 
 
 		 1171 aa  196  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2370  molybdopterin oxidoreductase  26.04 
 
 		 954 aa  182  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  27.79 
 
 		 906 aa  177  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4523  molybdopterin oxidoreductase  28.08 
 
 		 885 aa  176  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0739  molybdopterin oxidoreductase family protein  27 
 
 		 951 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1488  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.86 
 
 		 951 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2917  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.86 
 
 		 951 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3132  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.86 
 
 		 951 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0101  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.86 
 
 		 951 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0571  nitrate reductase  26.86 
 
 		 951 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.46294  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2841  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  26.43 
 
 		 952 aa  174  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.951842 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4167  Nitrate reductase  25.19 
 
 		 915 aa  173  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4279  Nitrate reductase  25.19 
 
 		 915 aa  173  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49754 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0462  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.72 
 
 		 951 aa  172  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0556  nitrate reductase  26.72 
 
 		 951 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2330  molybdopterin oxidoreductase  26.29 
 
 		 952 aa  172  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.505479  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  26.06 
 
 		 727 aa  171  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.8 
 
 		 686 aa  169  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2105  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  26.78 
 
 		 986 aa  169  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568723  normal  0.887876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  25.69 
 
 		 746 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  25.9 
 
 		 695 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3530  molybdopterin oxidoreductase  27.65 
 
 		 931 aa  165  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1752  molybdopterin oxidoreductase  27.85 
 
 		 897 aa  164  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0232031 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2493  molybdopterin oxidoreductase  27.26 
 
 		 880 aa  163  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  24.93 
 
 		 689 aa  162  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  27.53 
 
 		 1173 aa  162  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  25.4 
 
 		 746 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  28.83 
 
 		 1396 aa  160  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1159  molybdopterin oxidoreductase  26.65 
 
 		 907 aa  159  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.03 
 
 		 688 aa  159  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  24.18 
 
 		 724 aa  158  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1078  molybdopterin oxidoreductase  26.45 
 
 		 897 aa  158  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0000348039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  27.43 
 
 		 1405 aa  158  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  26.28 
 
 		 1180 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2595  molybdopterin oxidoreductase  25.78 
 
 		 953 aa  155  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1404  molybdopterin oxidoreductase  26.39 
 
 		 955 aa  155  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.931787 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  23.86 
 
 		 734 aa  155  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.55 
 
 		 668 aa  154  5e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0590  nitrate reductase  27.8 
 
 		 879 aa  154  8.999999999999999e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2380  molybdopterin oxidoreductase  25.66 
 
 		 1188 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.291899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3462  molybdopterin oxidoreductase  24.25 
 
 		 757 aa  150  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4821  assimilatory nitrate reductase (NADH) large subunit  27.27 
 
 		 915 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0576788  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.67 
 
 		 920 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1219  nitrate reductase large subunit oxidoreductase protein  24.39 
 
 		 913 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.557498  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  25.38 
 
 		 958 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4449  molybdopterin oxidoreductase  26.79 
 
 		 870 aa  149  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1779  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  24.14 
 
 		 904 aa  149  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1002  molybdopterin oxidoreductase  26.17 
 
 		 946 aa  148  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  26.52 
 
 		 908 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  25.07 
 
 		 729 aa  147  6e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2310  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  27.3 
 
 		 894 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3749  nitrate reductase  27.53 
 
 		 910 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.391081  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1627  molybdopterin oxidoreductase  27.6 
 
 		 885 aa  147  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169804  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2823  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  28.38 
 
 		 897 aa  146  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  24.93 
 
 		 1338 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2729  molybdopterin oxidoreductase  25.83 
 
 		 902 aa  146  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  25.79 
 
 		 908 aa  146  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3718  molybdopterin oxidoreductase  25.64 
 
 		 896 aa  146  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.59 
 
 		 674 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2099  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  25.47 
 
 		 906 aa  145  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090203 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0178  molybdopterin oxidoreductase  25.04 
 
 		 891 aa  145  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4662  molybdopterin oxidoreductase  25.35 
 
 		 818 aa  144  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.690498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.56 
 
 		 677 aa  144  9e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1545  molybdopterin oxidoreductase  25.94 
 
 		 902 aa  143  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1450  molybdopterin oxidoreductase  27.86 
 
 		 885 aa  144  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16865  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.53 
 
 		 676 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2094  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  27.24 
 
 		 905 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0428437  normal  0.0964557 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  25.39 
 
 		 1357 aa  142  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.02 
 
 		 766 aa  142  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3279  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  24.21 
 
 		 1003 aa  142  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.63 
 
 		 676 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1833  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.8 
 
 		 687 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00515495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2680  molybdopterin oxidoreductase  25.69 
 
 		 933 aa  142  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2954  molybdopterin oxidoreductase  26.4 
 
 		 901 aa  141  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1909  molybdopterin oxidoreductase  24.79 
 
 		 744 aa  140  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  25.96 
 
 		 1176 aa  140  7.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5892  nitrate reductase large subunit  27.75 
 
 		 885 aa  140  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32137  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  27.18 
 
 		 1405 aa  140  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  25 
 
 		 676 aa  139  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1442  molybdopterin oxidoreductase  26.35 
 
 		 882 aa  139  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.056801  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0961  molybdopterin oxidoreductase  24.86 
 
 		 752 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2865  molybdopterin oxidoreductase  26.59 
 
 		 894 aa  139  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734148  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  26 
 
 		 662 aa  139  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  25.32 
 
 		 1341 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  26.15 
 
 		 906 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.13 
 
 		 688 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0958  molybdopterin oxidoreductase  25.04 
 
 		 752 aa  139  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2319  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  25.47 
 
 		 929 aa  138  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00502256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2905  molybdopterin oxidoreductase  24.59 
 
 		 883 aa  138  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0670  molybdopterin oxidoreductase  26.13 
 
 		 896 aa  138  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.611773  normal  0.0334973 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.28 
 
 		 674 aa  137  8e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>