136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1531 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  94.94 
 
 		 415 aa  789    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  100 
 
 		 415 aa  829    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  96.14 
 
 		 415 aa  803    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  72.53 
 
 		 424 aa  616  1e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  45.65 
 
 		 425 aa  354  2e-96  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  50.92 
 
 		 301 aa  258  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0283  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  49.45 
 
 		 269 aa  238  2e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.363907  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  41.01 
 
 		 272 aa  182  7e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  44.65 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  40.29 
 
 		 272 aa  176  6e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  40.14 
 
 		 272 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  36.23 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  38.29 
 
 		 268 aa  163  7e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0201  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  42.34 
 
 		 307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0127762  normal  0.0655916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  40.54 
 
 		 304 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0875  formylmethanofuran dehydrogenase  38.16 
 
 		 266 aa  152  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.118005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0370  formylmethanofuran dehydrogenase  40.79 
 
 		 266 aa  145  9e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1473  formylmethanofuran dehydrogenase  38.29 
 
 		 275 aa  145  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1990  formylmethanofuran dehydrogenase  37.72 
 
 		 266 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114316  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  42.17 
 
 		 257 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0282  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  52 
 
 		 129 aa  139  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  33.6 
 
 		 266 aa  136  8e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  34.09 
 
 		 254 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  37.91 
 
 		 332 aa  133  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  35.39 
 
 		 270 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1291  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  48 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  36.26 
 
 		 256 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  34.57 
 
 		 255 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32.3 
 
 		 286 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.37 
 
 		 268 aa  113  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2626  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  32.59 
 
 		 269 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  35.86 
 
 		 276 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  34.18 
 
 		 269 aa  107  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.49 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0022  formylmethanofuran dehydrogenase  31.75 
 
 		 272 aa  101  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  29.06 
 
 		 281 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3133  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32.08 
 
 		 281 aa  97.1  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.27 
 
 		 265 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2159  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32.59 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0901303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5773  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32.37 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1824  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32.22 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0523  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32.38 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300278  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1793  glutamate synthase alpha subunit  35.44 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607708  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1421  glutamate synthase alpha subunit domain protein  32 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5997  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  35.27 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0878  molydopterin dinucleotide-binding region  40 
 
 		 136 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1470  molydopterin dinucleotide-binding region  37.19 
 
 		 136 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0243  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  37.5 
 
 		 131 aa  63.9  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.208129  normal  0.212279 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0561  molydopterin dinucleotide-binding region  39.17 
 
 		 128 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1762  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  49.32 
 
 		 105 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0101  molydopterin dinucleotide-binding region  33.9 
 
 		 130 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0344  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  38.33 
 
 		 128 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1463  molydopterin dinucleotide-binding region  33.05 
 
 		 130 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1426  molydopterin dinucleotide-binding region  36.15 
 
 		 128 aa  60.5  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2107  molydopterin dinucleotide-binding region  29.51 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0373  molydopterin dinucleotide-binding region  39.09 
 
 		 129 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.827239  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0493  molydopterin dinucleotide-binding region  37.5 
 
 		 128 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0621  molydopterin dinucleotide-binding region  36.36 
 
 		 133 aa  57.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270676  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1186  molydopterin dinucleotide-binding region  34.78 
 
 		 129 aa  57.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0619924  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  45.07 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  40.38 
 
 		 568 aa  57.8  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  40.38 
 
 		 568 aa  57.4  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  29.88 
 
 		 553 aa  57.4  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1984  molydopterin dinucleotide-binding region  33.9 
 
 		 133 aa  57.4  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  33.64 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2237  molydopterin dinucleotide-binding region  38.39 
 
 		 134 aa  56.2  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.0380736 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  33.64 
 
 		 228 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  33.64 
 
 		 228 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  29.51 
 
 		 225 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0204  molydopterin dinucleotide-binding region  36.97 
 
 		 137 aa  55.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0715847 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  34.72 
 
 		 250 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  33.64 
 
 		 228 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1083  glutamate synthase alpha subunit  34.41 
 
 		 320 aa  55.1  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.386486  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0168  glutamate synthase alpha subunit  31.06 
 
 		 229 aa  54.7  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1993  molydopterin dinucleotide-binding region  35.19 
 
 		 134 aa  54.3  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0699041  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.91 
 
 		 572 aa  54.3  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2236  molydopterin dinucleotide-binding region  37.38 
 
 		 134 aa  53.9  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.0387564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1943  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  35.19 
 
 		 227 aa  53.9  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513232 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1574  glutamate synthase alpha subunit domain protein  36.19 
 
 		 229 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1939  glutamate synthase alpha subunit domain protein  36.19 
 
 		 229 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  26.27 
 
 		 264 aa  53.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4696  glutamate synthase family protein  33.96 
 
 		 235 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.917164 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1657  glutamate synthase alpha subunit  36.19 
 
 		 229 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4809  glutamate synthase alpha subunit  34.92 
 
 		 229 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453145  hitchhiker  0.00411559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1298  glutamate synthase alpha subunit  37.33 
 
 		 227 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.186101  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0458  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.16 
 
 		 230 aa  51.2  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951315  normal  0.387952 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  32 
 
 		 312 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  27.27 
 
 		 232 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  26.4 
 
 		 574 aa  50.8  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5262  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  37.33 
 
 		 238 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.221211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4805  glutamate synthase alpha subunit domain protein  40.62 
 
 		 247 aa  50.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4894  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  36 
 
 		 238 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1198  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C (tungsten)  44.93 
 
 		 152 aa  49.3  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4983  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  36 
 
 		 238 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5511  glutamate synthase alpha subunit  34.67 
 
 		 228 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21487 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  31 
 
 		 312 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2584  hypothetical protein  31.85 
 
 		 227 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2275  glutamate synthase, alpha subunit, C-terminal  31.85 
 
 		 227 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225316  hitchhiker  0.00959584 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1987  molydopterin dinucleotide-binding region  33.9 
 
 		 137 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.295284  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  30.59 
 
 		 670 aa  48.5  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>