140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1663 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  100 
 
 		 424 aa  853    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  72.77 
 
 		 415 aa  619  1e-176  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  72.53 
 
 		 415 aa  616  1e-175  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  72.53 
 
 		 415 aa  615  1e-175  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  44 
 
 		 425 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  48.91 
 
 		 301 aa  254  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0283  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  47.23 
 
 		 269 aa  231  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.363907  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  42.09 
 
 		 272 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  41.37 
 
 		 272 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  39.93 
 
 		 272 aa  186  8e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  45.28 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  39.21 
 
 		 289 aa  178  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  37.13 
 
 		 268 aa  160  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  36.59 
 
 		 304 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0201  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  36.24 
 
 		 307 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0127762  normal  0.0655916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0875  formylmethanofuran dehydrogenase  35.63 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.118005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  41.98 
 
 		 257 aa  145  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  37.16 
 
 		 254 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1990  formylmethanofuran dehydrogenase  37.72 
 
 		 266 aa  138  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114316  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0370  formylmethanofuran dehydrogenase  35.96 
 
 		 266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  33.09 
 
 		 266 aa  136  5e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  35.68 
 
 		 270 aa  134  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1473  formylmethanofuran dehydrogenase  33.46 
 
 		 275 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  39 
 
 		 256 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0282  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  47.24 
 
 		 129 aa  127  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1291  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  48.82 
 
 		 129 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  38.16 
 
 		 332 aa  124  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  36.51 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2626  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  29.66 
 
 		 269 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  34.15 
 
 		 276 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.04 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.6 
 
 		 286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  30.66 
 
 		 269 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0022  formylmethanofuran dehydrogenase  28.3 
 
 		 272 aa  104  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.21 
 
 		 268 aa  102  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3133  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.66 
 
 		 281 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  24.7 
 
 		 281 aa  94  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5773  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.16 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32.04 
 
 		 265 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1421  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.52 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0523  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.44 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300278  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2159  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.53 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0901303 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1824  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.53 
 
 		 265 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5997  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.88 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  31.71 
 
 		 553 aa  65.1  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1793  glutamate synthase alpha subunit  32.04 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607708  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1083  glutamate synthase alpha subunit  40 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.386486  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1470  molydopterin dinucleotide-binding region  33.33 
 
 		 136 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  30.3 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0373  molydopterin dinucleotide-binding region  35.19 
 
 		 129 aa  60.5  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.827239  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0344  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  33.08 
 
 		 128 aa  60.5  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  31.61 
 
 		 568 aa  59.7  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  38.64 
 
 		 312 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2107  molydopterin dinucleotide-binding region  28.07 
 
 		 129 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0243  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  31.62 
 
 		 131 aa  58.9  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.208129  normal  0.212279 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1762  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  46.58 
 
 		 105 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1984  molydopterin dinucleotide-binding region  32.76 
 
 		 133 aa  57.4  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0168  glutamate synthase alpha subunit  30.3 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  35.77 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  30.32 
 
 		 568 aa  57.4  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  30.77 
 
 		 251 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  35.81 
 
 		 251 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  32.41 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1426  molydopterin dinucleotide-binding region  31.54 
 
 		 128 aa  57  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0663  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  34.01 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.358325 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  34.21 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0493  molydopterin dinucleotide-binding region  31.54 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  34.82 
 
 		 228 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  36.36 
 
 		 312 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  34.45 
 
 		 572 aa  55.5  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  36.11 
 
 		 256 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1607  tungsten containing formylmethanofruran dehydrogenase subunit C-related protein  37.5 
 
 		 313 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  36.11 
 
 		 256 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  31.18 
 
 		 264 aa  55.1  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  31.33 
 
 		 256 aa  54.7  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1198  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C (tungsten)  36.72 
 
 		 152 aa  54.3  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0101  molydopterin dinucleotide-binding region  29.57 
 
 		 130 aa  54.3  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  35.35 
 
 		 228 aa  53.9  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0621  molydopterin dinucleotide-binding region  35.29 
 
 		 133 aa  53.9  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270676  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1080  glutamate synthase alpha subunit  35.19 
 
 		 263 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  33.65 
 
 		 228 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1574  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.68 
 
 		 229 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1345  glutamate synthase, alpha subunit-like  27.47 
 
 		 227 aa  53.5  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  36.22 
 
 		 245 aa  53.9  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1463  molydopterin dinucleotide-binding region  29.57 
 
 		 130 aa  53.9  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0878  molydopterin dinucleotide-binding region  32.52 
 
 		 136 aa  53.5  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  36.22 
 
 		 245 aa  53.9  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1186  molydopterin dinucleotide-binding region  31.86 
 
 		 129 aa  53.5  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0619924  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1939  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.68 
 
 		 229 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2237  molydopterin dinucleotide-binding region  32.31 
 
 		 134 aa  53.1  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.0380736 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1657  glutamate synthase alpha subunit  28.68 
 
 		 229 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1993  molydopterin dinucleotide-binding region  33.64 
 
 		 134 aa  52.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0699041  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5511  glutamate synthase alpha subunit  33.98 
 
 		 228 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21487 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0561  molydopterin dinucleotide-binding region  33.61 
 
 		 128 aa  52.8  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  33.33 
 
 		 228 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0204  molydopterin dinucleotide-binding region  32.77 
 
 		 137 aa  51.2  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0715847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1298  glutamate synthase alpha subunit  32.04 
 
 		 227 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.186101  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  33.33 
 
 		 228 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2236  molydopterin dinucleotide-binding region  31.78 
 
 		 134 aa  51.6  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.0387564 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4809  glutamate synthase alpha subunit  26.36 
 
 		 229 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453145  hitchhiker  0.00411559 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>