More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2135 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3511  nitrate reductase catalytic subunit  72.38 
 
 		 831 aa  1237    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02133  nitrate reductase, periplasmic, large subunit  71.53 
 
 		 828 aa  1271    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.976817  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1453  periplasmic nitrate reductase, large subunit  71.53 
 
 		 828 aa  1272    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0824  nitrate reductase catalytic subunit  72.01 
 
 		 831 aa  1250    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4009  nitrate reductase catalytic subunit  68.68 
 
 		 848 aa  1238    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1343  nitrate reductase catalytic subunit  70.48 
 
 		 851 aa  1254    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.511379 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1936  nitrate reductase catalytic subunit  95.66 
 
 		 829 aa  1635    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.243568  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1943  nitrate reductase catalytic subunit  96.14 
 
 		 829 aa  1645    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.212211  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1057  nitrate reductase catalytic subunit  77.59 
 
 		 832 aa  1353    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3486  nitrate reductase catalytic subunit  72.26 
 
 		 828 aa  1280    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.125149  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0871  nitrate reductase catalytic subunit  51.08 
 
 		 924 aa  899    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0848  nitrate reductase catalytic subunit  72.1 
 
 		 826 aa  1255    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3165  nitrate reductase catalytic subunit  70.17 
 
 		 831 aa  1231    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1739  molybdopterin oxidoreductase  44.77 
 
 		 854 aa  687    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418465  normal  0.0195226 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2499  nitrate reductase catalytic subunit  71.65 
 
 		 828 aa  1270    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.444552  hitchhiker  0.00117092 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0868  nitrate reductase catalytic subunit  50.32 
 
 		 926 aa  875    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2505  nitrate reductase catalytic subunit  71.41 
 
 		 828 aa  1269    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2344  nitrate reductase catalytic subunit  71.65 
 
 		 828 aa  1274    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000513  periplasmic nitrate reductase precursor  74.55 
 
 		 829 aa  1313    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3515  nitrate reductase catalytic subunit  73.66 
 
 		 837 aa  1296    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0949945  hitchhiker  0.00218526 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4763  nitrate reductase catalytic subunit  76.24 
 
 		 831 aa  1364    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1716  nitrate reductase catalytic subunit  50.7 
 
 		 920 aa  891    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.207825  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0623  nitrate reductase catalytic subunit  72.74 
 
 		 826 aa  1238    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.729608  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0735  nitrate reductase catalytic subunit  71.41 
 
 		 828 aa  1269    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0438  nitrate reductase catalytic subunit  51.78 
 
 		 934 aa  897    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000251806  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2844  nitrate reductase catalytic subunit  75.48 
 
 		 838 aa  1353    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4116  nitrate reductase catalytic subunit  73.58 
 
 		 831 aa  1303    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.568266  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0724  periplasmic nitrate reductase, large subunit  50.97 
 
 		 929 aa  887    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2394  nitrate reductase catalytic subunit  71.65 
 
 		 828 aa  1270    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1444  nitrate reductase catalytic subunit  71.65 
 
 		 828 aa  1274    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2485  nitrate reductase catalytic subunit  71.65 
 
 		 828 aa  1271    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3206  nitrate reductase catalytic subunit  71.77 
 
 		 827 aa  1251    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2680  nitrate reductase catalytic subunit  89.49 
 
 		 831 aa  1582    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.232785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1514  nitrate reductase catalytic subunit  49.31 
 
 		 940 aa  864    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.0000000749729  n/a   
 
 
 
NC_009997  Sbal195_0859  nitrate reductase catalytic subunit  72.5 
 
 		 831 aa  1259    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1273  nitrate reductase catalytic subunit  70.81 
 
 		 830 aa  1266    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234589  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0801  nitrate reductase catalytic subunit  51.29 
 
 		 923 aa  897    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.237228  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2411  nitrate reductase catalytic subunit  71.29 
 
 		 828 aa  1262    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0617  nitrate reductase catalytic subunit  74.55 
 
 		 829 aa  1324    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2715  nitrate reductase catalytic subunit  71.08 
 
 		 828 aa  1261    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3957  nitrate reductase catalytic subunit  72.38 
 
 		 826 aa  1238    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00831972 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1056  periplasmic nitrate reductase, large subunit  49.34 
 
 		 770 aa  809    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2443  nitrate reductase catalytic subunit  71.65 
 
 		 828 aa  1270    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.556235 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1770  nitrate reductase catalytic subunit  90.22 
 
 		 831 aa  1578    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05377  nitrate reductase catalytic subunit  72.74 
 
 		 829 aa  1296    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02092  hypothetical protein  71.53 
 
 		 828 aa  1271    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.961372  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0084  nitrate reductase catalytic subunit  76.36 
 
 		 831 aa  1343    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2981  nitrate reductase catalytic subunit  73.49 
 
 		 834 aa  1298    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237893  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1019  nitrate reductase catalytic subunit  71.05 
 
 		 838 aa  1277    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0952  nitrate reductase catalytic subunit  74.91 
 
 		 837 aa  1334    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07590  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  42.26 
 
 		 851 aa  655    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.676481 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4110  nitrate reductase catalytic subunit  73.1 
 
 		 826 aa  1248    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0367  nitrate reductase catalytic subunit  74.07 
 
 		 827 aa  1315    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.870731  hitchhiker  0.000366868 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1497  nitrate reductase catalytic subunit  89.73 
 
 		 829 aa  1552    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1862  nitrate reductase catalytic subunit  75.03 
 
 		 834 aa  1332    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2427  nitrate reductase catalytic subunit  89.61 
 
 		 829 aa  1585    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0968104  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3343  nitrate reductase catalytic subunit  71.65 
 
 		 828 aa  1273    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.139665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4063  nitrate reductase catalytic subunit  76.24 
 
 		 831 aa  1362    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1928  nitrate reductase catalytic subunit  51.13 
 
 		 926 aa  876    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1910  nitrate reductase catalytic subunit  95.78 
 
 		 829 aa  1638    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.930767  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1913  nitrate reductase catalytic subunit  72.14 
 
 		 829 aa  1286    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000463649  normal  0.796386 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2938  nitrate reductase catalytic subunit  71.65 
 
 		 835 aa  1286    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3990  nitrate reductase catalytic subunit  73.58 
 
 		 831 aa  1289    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.214468  normal  0.774592 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2791  nitrate reductase catalytic subunit  70.81 
 
 		 830 aa  1266    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0978398 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2354  nitrate reductase catalytic subunit  71.77 
 
 		 828 aa  1275    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1508  nitrate reductase catalytic subunit  69.24 
 
 		 827 aa  1211    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0704  nitrate reductase catalytic subunit  71.38 
 
 		 826 aa  1229    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1842  nitrate reductase catalytic subunit  100 
 
 		 829 aa  1736    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.889762  hitchhiker  0.000540114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2135  nitrate reductase catalytic subunit  100 
 
 		 829 aa  1736    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411106 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3318  nitrate reductase catalytic subunit  71.5 
 
 		 826 aa  1229    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0553  nitrate reductase catalytic subunit  71.17 
 
 		 827 aa  1234    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2553  nitrate reductase catalytic subunit  91.43 
 
 		 829 aa  1588    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.4401  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2383  nitrate reductase catalytic subunit  95.66 
 
 		 831 aa  1637    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0655186  normal  0.338033 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2438  nitrate reductase catalytic subunit  75.51 
 
 		 839 aa  1349    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627702 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49250  nitrate reductase catalytic subunit  73.85 
 
 		 834 aa  1312    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.562968  normal  0.0276876 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2602  nitrate reductase catalytic subunit  71.53 
 
 		 828 aa  1269    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.475066 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5180  nitrate reductase catalytic subunit  72.5 
 
 		 834 aa  1289    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.727522 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0847  nitrate reductase catalytic subunit  72.62 
 
 		 831 aa  1241    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.22751 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3222  nitrate reductase catalytic subunit  71.86 
 
 		 828 aa  1254    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1591  nitrate reductase catalytic subunit  71.09 
 
 		 837 aa  1216    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1900  nitrate reductase catalytic subunit  98.79 
 
 		 829 aa  1720    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000194918 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3430  nitrate reductase catalytic subunit  71.38 
 
 		 826 aa  1228    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1161  nitrate reductase catalytic subunit  51.13 
 
 		 925 aa  876    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00142269  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1018  nitrate reductase catalytic subunit  51.45 
 
 		 924 aa  892    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1903  nitrate reductase catalytic subunit  96.86 
 
 		 829 aa  1656    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4721  nitrate reductase catalytic subunit  71.17 
 
 		 831 aa  1234    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.068762  normal  0.0333447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4205  nitrate reductase catalytic subunit  73.97 
 
 		 834 aa  1314    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153264  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1622  nitrate reductase catalytic subunit  88.77 
 
 		 831 aa  1548    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0868309  normal  0.125549 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2983  nitrate reductase catalytic subunit  73.1 
 
 		 827 aa  1273    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3148  nitrate reductase catalytic subunit  72.1 
 
 		 826 aa  1263    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1387  nitrate reductase catalytic subunit  70.81 
 
 		 830 aa  1266    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2174  nitrate reductase catalytic subunit  73.73 
 
 		 831 aa  1304    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.642457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1289  molybdopterin oxidoreductase  39 
 
 		 758 aa  615  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0908  periplasmic nitrate reductase subunit NapA apoprotein  39.07 
 
 		 752 aa  568  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0961  molybdopterin oxidoreductase  39.29 
 
 		 752 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0958  molybdopterin oxidoreductase  39.64 
 
 		 752 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0616  molybdopterin oxidoreductase  36.45 
 
 		 755 aa  522  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.241812  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0413  molybdopterin oxidoreductase  36.86 
 
 		 762 aa  503  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.535153  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1909  molybdopterin oxidoreductase  30.98 
 
 		 744 aa  364  3e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  31.45 
 
 		 1180 aa  364  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>