35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0621 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0621  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 		 133 aa  273  7e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270676  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2237  molydopterin dinucleotide-binding region  78.29 
 
 		 134 aa  221  4e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.0380736 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2236  molydopterin dinucleotide-binding region  75.19 
 
 		 134 aa  214  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.0387564 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0243  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  75.4 
 
 		 131 aa  203  8e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.208129  normal  0.212279 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1984  molydopterin dinucleotide-binding region  67.44 
 
 		 133 aa  192  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0878  molydopterin dinucleotide-binding region  57.14 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0204  molydopterin dinucleotide-binding region  53.66 
 
 		 137 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0715847 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1470  molydopterin dinucleotide-binding region  51.22 
 
 		 136 aa  130  9e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1987  molydopterin dinucleotide-binding region  48.76 
 
 		 137 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.295284  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0373  molydopterin dinucleotide-binding region  51.26 
 
 		 129 aa  116  7.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.827239  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1463  molydopterin dinucleotide-binding region  42.74 
 
 		 130 aa  114  5e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0101  molydopterin dinucleotide-binding region  41.94 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1426  molydopterin dinucleotide-binding region  49.61 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0493  molydopterin dinucleotide-binding region  47.62 
 
 		 128 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0344  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  46.83 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0561  molydopterin dinucleotide-binding region  44.88 
 
 		 128 aa  99.4  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1993  molydopterin dinucleotide-binding region  41.53 
 
 		 134 aa  98.2  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0699041  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2923  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  38.79 
 
 		 132 aa  84  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0830145  hitchhiker  0.000724487 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1095  molydopterin dinucleotide-binding region  37.6 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2107  molydopterin dinucleotide-binding region  34.43 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1186  molydopterin dinucleotide-binding region  38.6 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0619924  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  33.04 
 
 		 574 aa  73.2  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1291  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  35.71 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0976  molydopterin dinucleotide-binding region  31.86 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0282  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  32.52 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  29.17 
 
 		 425 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  36.36 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0337  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  28.7 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  36.36 
 
 		 415 aa  57.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  36.36 
 
 		 415 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  35.29 
 
 		 424 aa  53.9  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3349  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  32.95 
 
 		 828 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.407234  normal  0.217544 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  32.23 
 
 		 695 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1829  molydopterin dinucleotide-binding region  26.4 
 
 		 587 aa  41.2  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0590  nitrate reductase  34.52 
 
 		 879 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>