33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1470 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1470  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 		 136 aa  281  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0204  molydopterin dinucleotide-binding region  80.3 
 
 		 137 aa  226  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0715847 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1987  molydopterin dinucleotide-binding region  72.59 
 
 		 137 aa  205  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.295284  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0373  molydopterin dinucleotide-binding region  68.22 
 
 		 129 aa  183  7e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.827239  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1993  molydopterin dinucleotide-binding region  61.11 
 
 		 134 aa  158  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0699041  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0878  molydopterin dinucleotide-binding region  51.15 
 
 		 136 aa  145  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2237  molydopterin dinucleotide-binding region  51.59 
 
 		 134 aa  137  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.0380736 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1984  molydopterin dinucleotide-binding region  53.97 
 
 		 133 aa  137  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0243  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  51.54 
 
 		 131 aa  136  8.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.208129  normal  0.212279 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2236  molydopterin dinucleotide-binding region  50.79 
 
 		 134 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.0387564 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0621  molydopterin dinucleotide-binding region  51.22 
 
 		 133 aa  130  9e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270676  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1463  molydopterin dinucleotide-binding region  37.3 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0101  molydopterin dinucleotide-binding region  36.51 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0344  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  41.03 
 
 		 128 aa  84.7  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0493  molydopterin dinucleotide-binding region  41.03 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1426  molydopterin dinucleotide-binding region  40.17 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0561  molydopterin dinucleotide-binding region  37.5 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  38.02 
 
 		 415 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  37.19 
 
 		 415 aa  67  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  37.19 
 
 		 415 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1186  molydopterin dinucleotide-binding region  33.87 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0619924  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1291  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  33.91 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  33.33 
 
 		 424 aa  61.2  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1095  molydopterin dinucleotide-binding region  29.17 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  29.66 
 
 		 425 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2107  molydopterin dinucleotide-binding region  33.33 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2923  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  28.21 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0830145  hitchhiker  0.000724487 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  29.17 
 
 		 574 aa  54.7  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0282  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  28.89 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0976  molydopterin dinucleotide-binding region  27.62 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0337  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  24.17 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1457  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.81 
 
 		 657 aa  43.9  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1631  formate dehydrogenase  35.63 
 
 		 647 aa  41.2  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>