48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1186 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1186  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 		 129 aa  266  7e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0619924  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2107  molydopterin dinucleotide-binding region  48.84 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  39.84 
 
 		 574 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1095  molydopterin dinucleotide-binding region  42.02 
 
 		 123 aa  99.4  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1426  molydopterin dinucleotide-binding region  41.8 
 
 		 128 aa  91.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0344  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  39.84 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0561  molydopterin dinucleotide-binding region  40.65 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0493  molydopterin dinucleotide-binding region  39.84 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1829  molydopterin dinucleotide-binding region  37.3 
 
 		 587 aa  83.6  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0101  molydopterin dinucleotide-binding region  43.64 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1463  molydopterin dinucleotide-binding region  43.64 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0621  molydopterin dinucleotide-binding region  38.6 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270676  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0243  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  35.34 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.208129  normal  0.212279 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1993  molydopterin dinucleotide-binding region  34.17 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0699041  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2237  molydopterin dinucleotide-binding region  36.8 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.0380736 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0373  molydopterin dinucleotide-binding region  34.68 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.827239  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1984  molydopterin dinucleotide-binding region  33.62 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0878  molydopterin dinucleotide-binding region  35.16 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2236  molydopterin dinucleotide-binding region  37.5 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.0387564 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1470  molydopterin dinucleotide-binding region  33.87 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1987  molydopterin dinucleotide-binding region  34.65 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.295284  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1291  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  32.17 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0204  molydopterin dinucleotide-binding region  36.29 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0715847 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0976  molydopterin dinucleotide-binding region  27.64 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  34.78 
 
 		 415 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  34.78 
 
 		 415 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  33.91 
 
 		 415 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  32.14 
 
 		 425 aa  57  0.00000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  31.86 
 
 		 424 aa  53.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2923  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  29.59 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0830145  hitchhiker  0.000724487 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0282  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  30.77 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.21 
 
 		 687 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3772  molybdopterin oxidoreductase  27.93 
 
 		 708 aa  45.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.914443 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1999  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.03 
 
 		 657 aa  44.7  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4072  formate dehydrogenase, alpha subunit  30 
 
 		 957 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1312  molybdopterin oxidoreductase  30.09 
 
 		 738 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000067691 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.7 
 
 		 959 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1457  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.14 
 
 		 657 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2346  molybdopterin oxidoreductase  26.6 
 
 		 879 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.951225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  24.8 
 
 		 695 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4171  molybdopterin oxidoreductase  32.95 
 
 		 776 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0561971  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1147  molybdopterin oxidoreductase  28.21 
 
 		 933 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000889263  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  25 
 
 		 689 aa  40.8  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2897  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.55 
 
 		 959 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0839  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.19 
 
 		 946 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.331727  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1746  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  25.86 
 
 		 704 aa  40.4  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.647009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2813  molybdopterin oxidoreductase  26.5 
 
 		 899 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4258  molybdopterin oxidoreductase  28.32 
 
 		 714 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.650398  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>