30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1987 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1987  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 		 137 aa  284  2.9999999999999996e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.295284  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0204  molydopterin dinucleotide-binding region  74.26 
 
 		 137 aa  212  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0715847 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1470  molydopterin dinucleotide-binding region  72.59 
 
 		 136 aa  205  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0373  molydopterin dinucleotide-binding region  72.87 
 
 		 129 aa  194  3e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.827239  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1993  molydopterin dinucleotide-binding region  64.29 
 
 		 134 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0699041  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0878  molydopterin dinucleotide-binding region  50.39 
 
 		 136 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1984  molydopterin dinucleotide-binding region  50 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2237  molydopterin dinucleotide-binding region  50.81 
 
 		 134 aa  123  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.0380736 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2236  molydopterin dinucleotide-binding region  49.19 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.0387564 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0243  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  49.21 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.208129  normal  0.212279 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0621  molydopterin dinucleotide-binding region  48.76 
 
 		 133 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270676  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1463  molydopterin dinucleotide-binding region  37.19 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0101  molydopterin dinucleotide-binding region  36.36 
 
 		 130 aa  98.6  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0344  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  39.22 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1426  molydopterin dinucleotide-binding region  38.24 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0493  molydopterin dinucleotide-binding region  38.18 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0561  molydopterin dinucleotide-binding region  37.25 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1186  molydopterin dinucleotide-binding region  34.65 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0619924  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2923  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  29.82 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0830145  hitchhiker  0.000724487 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0976  molydopterin dinucleotide-binding region  26.4 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2107  molydopterin dinucleotide-binding region  33.93 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  27.12 
 
 		 425 aa  53.5  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  35.59 
 
 		 415 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1095  molydopterin dinucleotide-binding region  29.75 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  34.75 
 
 		 415 aa  51.2  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  33.9 
 
 		 415 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1291  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  28.07 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0282  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  28.16 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0337  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  21.01 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  28.81 
 
 		 424 aa  42  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>