31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1993 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1993  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 
134 aa  278  2e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0699041  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1987  molydopterin dinucleotide-binding region  64.29 
 
 
137 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.295284  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1470  molydopterin dinucleotide-binding region  61.11 
 
 
136 aa  158  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0204  molydopterin dinucleotide-binding region  59.52 
 
 
137 aa  155  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0715847 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0373  molydopterin dinucleotide-binding region  57.94 
 
 
129 aa  147  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.827239  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0878  molydopterin dinucleotide-binding region  43.65 
 
 
136 aa  111  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1984  molydopterin dinucleotide-binding region  46.61 
 
 
133 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0243  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  41.46 
 
 
131 aa  103  7e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.208129  normal  0.212279 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2237  molydopterin dinucleotide-binding region  44.07 
 
 
134 aa  98.2  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.0380736 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2236  molydopterin dinucleotide-binding region  44.07 
 
 
134 aa  98.2  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.0387564 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0621  molydopterin dinucleotide-binding region  41.53 
 
 
133 aa  98.2  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270676  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1463  molydopterin dinucleotide-binding region  37.82 
 
 
130 aa  96.7  9e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0101  molydopterin dinucleotide-binding region  36.97 
 
 
130 aa  95.9  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0344  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  37.7 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0561  molydopterin dinucleotide-binding region  35.25 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1426  molydopterin dinucleotide-binding region  36 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0493  molydopterin dinucleotide-binding region  37.7 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1186  molydopterin dinucleotide-binding region  34.17 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0619924  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2923  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  27.97 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0830145  hitchhiker  0.000724487 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0976  molydopterin dinucleotide-binding region  28.81 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1095  molydopterin dinucleotide-binding region  31.93 
 
 
123 aa  57.4  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  36.11 
 
 
415 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  27.87 
 
 
425 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  38.18 
 
 
415 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2107  molydopterin dinucleotide-binding region  31.62 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  35.19 
 
 
415 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  27.68 
 
 
574 aa  53.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  33.64 
 
 
424 aa  52.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0337  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  24.62 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0282  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  29.17 
 
 
129 aa  47  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1291  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  29.46 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.75311 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>