34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1984 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1984  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 		 133 aa  273  5e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0243  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  69.77 
 
 		 131 aa  193  5.000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.208129  normal  0.212279 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2237  molydopterin dinucleotide-binding region  68.18 
 
 		 134 aa  192  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.0380736 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0621  molydopterin dinucleotide-binding region  67.44 
 
 		 133 aa  192  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270676  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2236  molydopterin dinucleotide-binding region  66.17 
 
 		 134 aa  189  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.0387564 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1470  molydopterin dinucleotide-binding region  53.97 
 
 		 136 aa  137  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0878  molydopterin dinucleotide-binding region  50 
 
 		 136 aa  137  7e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0204  molydopterin dinucleotide-binding region  50.41 
 
 		 137 aa  133  8e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0715847 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1987  molydopterin dinucleotide-binding region  50 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.295284  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0373  molydopterin dinucleotide-binding region  47.9 
 
 		 129 aa  120  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.827239  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1463  molydopterin dinucleotide-binding region  40.48 
 
 		 130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0101  molydopterin dinucleotide-binding region  39.68 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1993  molydopterin dinucleotide-binding region  46.61 
 
 		 134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0699041  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0493  molydopterin dinucleotide-binding region  45 
 
 		 128 aa  100  7e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1426  molydopterin dinucleotide-binding region  46.28 
 
 		 128 aa  99.4  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0344  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  44.17 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0561  molydopterin dinucleotide-binding region  44.26 
 
 		 128 aa  94  7e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2923  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  37.93 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0830145  hitchhiker  0.000724487 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1095  molydopterin dinucleotide-binding region  38.98 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  33.06 
 
 		 425 aa  80.5  0.000000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1291  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  38.71 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0976  molydopterin dinucleotide-binding region  30.89 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1186  molydopterin dinucleotide-binding region  33.62 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0619924  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  31.9 
 
 		 574 aa  66.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0337  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  28.95 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0282  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  30.89 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  34.75 
 
 		 415 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2107  molydopterin dinucleotide-binding region  31.71 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.9 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  32.76 
 
 		 424 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  33.9 
 
 		 415 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.14 
 
 		 886 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.91 
 
 		 1110 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.91 
 
 		 1111 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>