32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0878 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0878  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 		 136 aa  284  2.9999999999999996e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2237  molydopterin dinucleotide-binding region  60.63 
 
 		 134 aa  163  9e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.0380736 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2236  molydopterin dinucleotide-binding region  56.69 
 
 		 134 aa  158  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.0387564 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0621  molydopterin dinucleotide-binding region  57.14 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270676  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0204  molydopterin dinucleotide-binding region  55.04 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0715847 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1470  molydopterin dinucleotide-binding region  51.15 
 
 		 136 aa  145  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0243  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  52.76 
 
 		 131 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.208129  normal  0.212279 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1987  molydopterin dinucleotide-binding region  50.39 
 
 		 137 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.295284  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1984  molydopterin dinucleotide-binding region  50 
 
 		 133 aa  137  7e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0373  molydopterin dinucleotide-binding region  51.59 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.827239  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1993  molydopterin dinucleotide-binding region  43.65 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0699041  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0101  molydopterin dinucleotide-binding region  40.16 
 
 		 130 aa  103  9e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1463  molydopterin dinucleotide-binding region  39.37 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1426  molydopterin dinucleotide-binding region  40.83 
 
 		 128 aa  86.7  9e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0344  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  41.6 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0493  molydopterin dinucleotide-binding region  39.17 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0561  molydopterin dinucleotide-binding region  36.67 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2107  molydopterin dinucleotide-binding region  37.21 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  40 
 
 		 415 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  40 
 
 		 415 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  39.2 
 
 		 415 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2923  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  33.06 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0830145  hitchhiker  0.000724487 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1186  molydopterin dinucleotide-binding region  35.16 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0619924  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1095  molydopterin dinucleotide-binding region  33.9 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  30 
 
 		 574 aa  63.2  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0976  molydopterin dinucleotide-binding region  30.63 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  29.66 
 
 		 425 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  32.52 
 
 		 424 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0282  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  29.91 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1291  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  31.97 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0337  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  23.68 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  36.51 
 
 		 753 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>