37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0243 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0243  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  100 
 
 		 131 aa  267  2.9999999999999997e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.208129  normal  0.212279 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0621  molydopterin dinucleotide-binding region  75.4 
 
 		 133 aa  203  8e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270676  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2237  molydopterin dinucleotide-binding region  72.87 
 
 		 134 aa  202  9e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.0380736 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2236  molydopterin dinucleotide-binding region  72.09 
 
 		 134 aa  202  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.0387564 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1984  molydopterin dinucleotide-binding region  69.77 
 
 		 133 aa  193  5.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0878  molydopterin dinucleotide-binding region  52.76 
 
 		 136 aa  143  7.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1470  molydopterin dinucleotide-binding region  51.54 
 
 		 136 aa  136  8.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0204  molydopterin dinucleotide-binding region  50.39 
 
 		 137 aa  128  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0715847 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1987  molydopterin dinucleotide-binding region  49.21 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.295284  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1463  molydopterin dinucleotide-binding region  41.41 
 
 		 130 aa  114  5e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0373  molydopterin dinucleotide-binding region  46.34 
 
 		 129 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.827239  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0101  molydopterin dinucleotide-binding region  40.62 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1993  molydopterin dinucleotide-binding region  41.46 
 
 		 134 aa  103  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0699041  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1426  molydopterin dinucleotide-binding region  48.28 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0493  molydopterin dinucleotide-binding region  46.96 
 
 		 128 aa  96.7  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0344  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  46.09 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0561  molydopterin dinucleotide-binding region  42.98 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2923  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  36.21 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0830145  hitchhiker  0.000724487 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1095  molydopterin dinucleotide-binding region  37.19 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1186  molydopterin dinucleotide-binding region  35.34 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0619924  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0976  molydopterin dinucleotide-binding region  32.71 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  35.78 
 
 		 574 aa  69.3  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1291  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  37.7 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  38.33 
 
 		 415 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2107  molydopterin dinucleotide-binding region  34.31 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  36.67 
 
 		 415 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  30.25 
 
 		 425 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  37.5 
 
 		 415 aa  63.9  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0282  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  35.83 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  31.62 
 
 		 424 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0337  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  27.83 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1631  formate dehydrogenase  31.03 
 
 		 647 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.89 
 
 		 1111 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0958  molybdopterin oxidoreductase  32.46 
 
 		 752 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0908  periplasmic nitrate reductase subunit NapA apoprotein  32.46 
 
 		 752 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0961  molybdopterin oxidoreductase  32.46 
 
 		 752 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.27 
 
 		 1110 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>