26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2923 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2923  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  100 
 
 		 132 aa  269  8.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0830145  hitchhiker  0.000724487 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0337  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  56.15 
 
 		 132 aa  151  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0976  molydopterin dinucleotide-binding region  44.95 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1984  molydopterin dinucleotide-binding region  37.93 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0621  molydopterin dinucleotide-binding region  38.79 
 
 		 133 aa  84  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270676  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2237  molydopterin dinucleotide-binding region  35.04 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.0380736 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2236  molydopterin dinucleotide-binding region  33.33 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.0387564 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0243  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  36.21 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.208129  normal  0.212279 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0878  molydopterin dinucleotide-binding region  33.06 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0204  molydopterin dinucleotide-binding region  30.17 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0715847 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0101  molydopterin dinucleotide-binding region  31.48 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1463  molydopterin dinucleotide-binding region  31.48 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0373  molydopterin dinucleotide-binding region  33.33 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.827239  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1987  molydopterin dinucleotide-binding region  29.82 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.295284  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  34.78 
 
 		 574 aa  62.8  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1993  molydopterin dinucleotide-binding region  27.97 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0699041  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1470  molydopterin dinucleotide-binding region  28.21 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0344  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  29.41 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0561  molydopterin dinucleotide-binding region  29.41 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0493  molydopterin dinucleotide-binding region  28.43 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1426  molydopterin dinucleotide-binding region  28.43 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1095  molydopterin dinucleotide-binding region  30.4 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1186  molydopterin dinucleotide-binding region  29.59 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0619924  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2107  molydopterin dinucleotide-binding region  29.27 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0617  nitrate reductase catalytic subunit  34.38 
 
 		 829 aa  43.9  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0282  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  25.26 
 
 		 129 aa  40  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>