More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0871 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_3165  nitrate reductase catalytic subunit  48.65 
 
 
831 aa  837    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02133  nitrate reductase, periplasmic, large subunit  50.86 
 
 
828 aa  865    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.976817  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1453  periplasmic nitrate reductase, large subunit  50.86 
 
 
828 aa  863    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2344  nitrate reductase catalytic subunit  50.86 
 
 
828 aa  864    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5180  nitrate reductase catalytic subunit  49.03 
 
 
834 aa  836    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.727522 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1928  nitrate reductase catalytic subunit  76.03 
 
 
926 aa  1488    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3343  nitrate reductase catalytic subunit  50.97 
 
 
828 aa  865    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.139665  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1057  nitrate reductase catalytic subunit  50.7 
 
 
832 aa  863    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3206  nitrate reductase catalytic subunit  49.62 
 
 
827 aa  856    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0871  nitrate reductase catalytic subunit  100 
 
 
924 aa  1928    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0848  nitrate reductase catalytic subunit  50.11 
 
 
826 aa  853    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2602  nitrate reductase catalytic subunit  50.65 
 
 
828 aa  862    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.475066 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2427  nitrate reductase catalytic subunit  51.13 
 
 
829 aa  897    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0968104  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0623  nitrate reductase catalytic subunit  49.95 
 
 
826 aa  852    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.729608  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0847  nitrate reductase catalytic subunit  49.73 
 
 
831 aa  835    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.22751 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3515  nitrate reductase catalytic subunit  51.95 
 
 
837 aa  900    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0949945  hitchhiker  0.00218526 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4763  nitrate reductase catalytic subunit  52.16 
 
 
831 aa  918    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2791  nitrate reductase catalytic subunit  49.73 
 
 
830 aa  868    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0978398 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3486  nitrate reductase catalytic subunit  49.78 
 
 
828 aa  857    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.125149  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4009  nitrate reductase catalytic subunit  51.62 
 
 
848 aa  887    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2438  nitrate reductase catalytic subunit  53.5 
 
 
839 aa  930    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.627702 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1387  nitrate reductase catalytic subunit  49.73 
 
 
830 aa  868    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3957  nitrate reductase catalytic subunit  49.84 
 
 
826 aa  846    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00831972 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4116  nitrate reductase catalytic subunit  49.03 
 
 
831 aa  842    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.568266  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4205  nitrate reductase catalytic subunit  51.19 
 
 
834 aa  875    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153264  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2938  nitrate reductase catalytic subunit  49.89 
 
 
835 aa  858    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4110  nitrate reductase catalytic subunit  50.11 
 
 
826 aa  850    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2499  nitrate reductase catalytic subunit  50.65 
 
 
828 aa  862    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.444552  hitchhiker  0.00117092 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1514  nitrate reductase catalytic subunit  67.23 
 
 
940 aa  1278    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.0000000749729  n/a   
 
 
 
NC_010468  EcolC_1444  nitrate reductase catalytic subunit  50.86 
 
 
828 aa  864    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2485  nitrate reductase catalytic subunit  50.54 
 
 
828 aa  860    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1770  nitrate reductase catalytic subunit  51.67 
 
 
831 aa  886    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1019  nitrate reductase catalytic subunit  47.14 
 
 
838 aa  810    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02092  hypothetical protein  50.86 
 
 
828 aa  865    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.961372  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1716  nitrate reductase catalytic subunit  77.71 
 
 
920 aa  1513    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.207825  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0859  nitrate reductase catalytic subunit  49.84 
 
 
831 aa  852    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2505  nitrate reductase catalytic subunit  50.76 
 
 
828 aa  863    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000513  periplasmic nitrate reductase precursor  50.43 
 
 
829 aa  864    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1910  nitrate reductase catalytic subunit  51.24 
 
 
829 aa  880    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.930767  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2383  nitrate reductase catalytic subunit  51.24 
 
 
831 aa  880    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0655186  normal  0.338033 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0084  nitrate reductase catalytic subunit  49.57 
 
 
831 aa  848    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1943  nitrate reductase catalytic subunit  51.13 
 
 
829 aa  877    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.212211  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2394  nitrate reductase catalytic subunit  50.65 
 
 
828 aa  862    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0952  nitrate reductase catalytic subunit  51.08 
 
 
837 aa  880    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2715  nitrate reductase catalytic subunit  50 
 
 
828 aa  855    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1018  nitrate reductase catalytic subunit  88.64 
 
 
924 aa  1733    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3990  nitrate reductase catalytic subunit  49.27 
 
 
831 aa  828    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.214468  normal  0.774592 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0367  nitrate reductase catalytic subunit  51.52 
 
 
827 aa  882    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.870731  hitchhiker  0.000366868 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1497  nitrate reductase catalytic subunit  50.7 
 
 
829 aa  877    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1903  nitrate reductase catalytic subunit  50.91 
 
 
829 aa  877    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3511  nitrate reductase catalytic subunit  49.51 
 
 
831 aa  835    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1862  nitrate reductase catalytic subunit  51.72 
 
 
834 aa  875    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4063  nitrate reductase catalytic subunit  52.48 
 
 
831 aa  929    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127996  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0438  nitrate reductase catalytic subunit  73.43 
 
 
934 aa  1424    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000251806  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1913  nitrate reductase catalytic subunit  49.46 
 
 
829 aa  855    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000463649  normal  0.796386 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2680  nitrate reductase catalytic subunit  51.45 
 
 
831 aa  900    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.232785  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0824  nitrate reductase catalytic subunit  49.84 
 
 
831 aa  847    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3148  nitrate reductase catalytic subunit  50.22 
 
 
826 aa  856    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0801  nitrate reductase catalytic subunit  99.57 
 
 
923 aa  1917    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.237228  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0868  nitrate reductase catalytic subunit  75.92 
 
 
926 aa  1501    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0724  periplasmic nitrate reductase, large subunit  70.61 
 
 
929 aa  1390    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1508  nitrate reductase catalytic subunit  49.19 
 
 
827 aa  845    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0704  nitrate reductase catalytic subunit  50.32 
 
 
826 aa  842    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1842  nitrate reductase catalytic subunit  50.91 
 
 
829 aa  878    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.889762  hitchhiker  0.000540114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2135  nitrate reductase catalytic subunit  50.91 
 
 
829 aa  878    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411106 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3318  nitrate reductase catalytic subunit  50.22 
 
 
826 aa  841    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0617  nitrate reductase catalytic subunit  50.54 
 
 
829 aa  876    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0553  nitrate reductase catalytic subunit  49.73 
 
 
827 aa  842    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2411  nitrate reductase catalytic subunit  50.65 
 
 
828 aa  862    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2553  nitrate reductase catalytic subunit  51.13 
 
 
829 aa  896    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.4401  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1273  nitrate reductase catalytic subunit  49.73 
 
 
830 aa  868    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234589  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2443  nitrate reductase catalytic subunit  50.65 
 
 
828 aa  862    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.556235 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49250  nitrate reductase catalytic subunit  51.4 
 
 
834 aa  879    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.562968  normal  0.0276876 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2354  nitrate reductase catalytic subunit  50.86 
 
 
828 aa  863    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2844  nitrate reductase catalytic subunit  53.66 
 
 
838 aa  933    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1591  nitrate reductase catalytic subunit  49.11 
 
 
837 aa  835    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1900  nitrate reductase catalytic subunit  50.81 
 
 
829 aa  877    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000194918 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3430  nitrate reductase catalytic subunit  50.11 
 
 
826 aa  839    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1161  nitrate reductase catalytic subunit  76.86 
 
 
925 aa  1510    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00142269  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1343  nitrate reductase catalytic subunit  51.34 
 
 
851 aa  872    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.511379 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4721  nitrate reductase catalytic subunit  48.11 
 
 
831 aa  825    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.068762  normal  0.0333447 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05377  nitrate reductase catalytic subunit  50.32 
 
 
829 aa  865    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1936  nitrate reductase catalytic subunit  51.13 
 
 
829 aa  879    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.243568  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1622  nitrate reductase catalytic subunit  50.91 
 
 
831 aa  868    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0868309  normal  0.125549 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2983  nitrate reductase catalytic subunit  49.14 
 
 
827 aa  831    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0735  nitrate reductase catalytic subunit  50.86 
 
 
828 aa  862    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2174  nitrate reductase catalytic subunit  51.19 
 
 
831 aa  878    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.642457  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3222  nitrate reductase catalytic subunit  50.27 
 
 
828 aa  861    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497822  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2981  nitrate reductase catalytic subunit  50.75 
 
 
834 aa  866    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237893  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1739  molybdopterin oxidoreductase  38.29 
 
 
854 aa  583  1.0000000000000001e-165  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418465  normal  0.0195226 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07590  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  37.7 
 
 
851 aa  579  1e-164  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.676481 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1056  periplasmic nitrate reductase, large subunit  46.02 
 
 
770 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0413  molybdopterin oxidoreductase  33.91 
 
 
762 aa  347  5e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.535153  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2841  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  28.01 
 
 
952 aa  232  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.951842 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0908  periplasmic nitrate reductase subunit NapA apoprotein  44.07 
 
 
752 aa  228  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0961  molybdopterin oxidoreductase  43.39 
 
 
752 aa  225  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  28.69 
 
 
746 aa  225  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0958  molybdopterin oxidoreductase  43.39 
 
 
752 aa  224  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2330  molybdopterin oxidoreductase  27.79 
 
 
952 aa  223  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.505479  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  29.05 
 
 
734 aa  213  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>