82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0126 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0126  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 313 aa  651    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 1005 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2888  type IV pilus biogenesis protein PilF, putative  33.75 
 
 		 255 aa  52.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.05 
 
 		 1034 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.69 
 
 		 747 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02816  TPR domain protein  32.14 
 
 		 604 aa  51.2  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.36083  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 643 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 3145 aa  49.7  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1114  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  31.63 
 
 		 261 aa  49.7  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22274  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 		 3560 aa  49.3  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  34.12 
 
 		 391 aa  49.3  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 		 587 aa  49.3  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  33.33 
 
 		 587 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.75 
 
 		 689 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1238  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 		 377 aa  48.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1421 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 		 718 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1760  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 392 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1213  putative type 4 fimbrial biogenesis protein  31.52 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.543413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0727  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilF  35.29 
 
 		 253 aa  47  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 1184 aa  47  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0641  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.12 
 
 		 417 aa  47  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.193028  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1297  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.45 
 
 		 262 aa  46.2  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.276388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2987  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 266 aa  46.2  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.5 
 
 		 397 aa  46.2  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 697 aa  46.2  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1226  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.45 
 
 		 262 aa  46.2  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0380935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  35.96 
 
 		 725 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 909 aa  45.8  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 612 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  29.89 
 
 		 630 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0484  DEAD/DEAH box helicase-like protein  29.9 
 
 		 941 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0368983  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 465 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1217  putative fimbrial biogenesis and twitching motility protein  31.11 
 
 		 237 aa  45.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.544829  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1736  glycosyl transferase family 2  32.18 
 
 		 392 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  27.27 
 
 		 733 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1812  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 189 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1166  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  30.11 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.327307 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 		 927 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  29.03 
 
 		 875 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 808 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  29.67 
 
 		 569 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.73 
 
 		 367 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  28.06 
 
 		 706 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 		 3035 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1227  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  26.53 
 
 		 262 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.023902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1965  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 595 aa  43.9  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.546614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  33.75 
 
 		 734 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1246  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 252 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.619631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.56 
 
 		 571 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  30.93 
 
 		 864 aa  43.9  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.61 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02983  ATP-dependent protease La  28.92 
 
 		 809 aa  43.9  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00208912  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  32.1 
 
 		 540 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7095  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.93 
 
 		 354 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.524118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.7 
 
 		 277 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.31 
 
 		 466 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 374 aa  43.5  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 602 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 		 356 aa  43.1  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 4079 aa  43.1  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 750 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 311 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  30.86 
 
 		 545 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.37 
 
 		 632 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2367  fimbrial biogenesis and twitching motility protein, putative  26.47 
 
 		 262 aa  43.1  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000000700104  normal  0.549255 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 686 aa  43.1  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.27 
 
 		 416 aa  42.7  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1430  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  23.08 
 
 		 262 aa  43.1  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.14258  normal  0.202712 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1371  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  24.17 
 
 		 262 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.503899  normal  0.0591536 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 878 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3314  fimbrial biogenesis and twitching motility protein, putative  26.53 
 
 		 262 aa  42.7  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3594  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.38 
 
 		 1100 aa  42.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29124  hitchhiker  0.0000227347 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2992  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  24.17 
 
 		 262 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00509234  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3007  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  24.17 
 
 		 262 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000355185  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3150  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  24.17 
 
 		 262 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0633925  hitchhiker  0.00734203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 667 aa  42.7  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 706 aa  42.7  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1542  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  24.14 
 
 		 262 aa  42.7  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.364125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 637 aa  42.4  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 637 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>