17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0641 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0641  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 417 aa  865    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.193028  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.71 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  28.57 
 
 		 762 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  28.57 
 
 		 762 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  34.95 
 
 		 308 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0126  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 		 313 aa  47  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  25.19 
 
 		 682 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  25.17 
 
 		 2145 aa  46.2  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 748 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 927 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  24.18 
 
 		 1044 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.86 
 
 		 875 aa  43.9  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  22.44 
 
 		 887 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  36.25 
 
 		 540 aa  43.5  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3075  TPR repeat-containing protein  36.47 
 
 		 602 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320155  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0604  sporulation domain-containing protein  46.3 
 
 		 397 aa  43.5  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1564  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 		 199 aa  43.1  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>