More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02983 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  80.72 
 
 		 784 aa  813    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  80.72 
 
 		 784 aa  813    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1294  endopeptidase La  68.81 
 
 		 805 aa  703    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346664 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1351  ATP-dependent protease La  70.88 
 
 		 808 aa  714    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.183525 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  80.6 
 
 		 786 aa  837    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2302  ATP-dependent protease La  68.64 
 
 		 798 aa  704    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235792  hitchhiker  0.000494744 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0531  ATP-dependent protease La  65.89 
 
 		 809 aa  717    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680151  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  63.45 
 
 		 807 aa  657    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  70.62 
 
 		 806 aa  719    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  79.72 
 
 		 785 aa  831    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3783  ATP-dependent protease La  77.49 
 
 		 782 aa  809    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.417007  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1106  ATP-dependent protease La  60.94 
 
 		 812 aa  650    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521594  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  76.09 
 
 		 785 aa  830    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3724  ATP-dependent protease La  67.94 
 
 		 798 aa  703    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.639562  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  61.77 
 
 		 806 aa  664    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3494  Lon protease  69.86 
 
 		 798 aa  717    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.935461  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1725  ATP-dependent protease La  62.78 
 
 		 814 aa  688    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000125978  decreased coverage  0.00323118 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1463  ATP-dependent protease La  70.88 
 
 		 805 aa  717    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114197  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1827  hypothetical protein  66.94 
 
 		 816 aa  696    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1823  hypothetical protein  66.94 
 
 		 816 aa  695    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1749  peptidase S16, ATP-dependent protease La  68.35 
 
 		 798 aa  704    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0163826 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2052  ATP-dependent protease La  70.33 
 
 		 798 aa  718    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155836  normal  0.0687597 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1716  Lon-A peptidase  65.09 
 
 		 804 aa  705    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.390297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1382  Lon-A peptidase  71.22 
 
 		 803 aa  721    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.154392  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0754  ATP-dependent endopeptidase Lon  63.92 
 
 		 817 aa  669    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.261769  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1675  Lon-A peptidase  60.27 
 
 		 805 aa  696    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0439877 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  63.25 
 
 		 808 aa  658    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2479  ATP-dependent protease La  70.88 
 
 		 805 aa  717    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.71727  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1674  peptidase S16, ATP-dependent protease La  68.1 
 
 		 812 aa  708    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37162  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3695  Lon-A peptidase  69.35 
 
 		 798 aa  706    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  60.47 
 
 		 802 aa  638    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2363  ATP-dependent protease La  70.88 
 
 		 805 aa  717    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  61.23 
 
 		 801 aa  638    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2955  ATP-dependent protease La  67.66 
 
 		 809 aa  690    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0653516 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5222  Lon-A peptidase  70.48 
 
 		 807 aa  711    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  61.23 
 
 		 805 aa  635    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  65.79 
 
 		 813 aa  670    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  80.12 
 
 		 784 aa  812    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  63.86 
 
 		 805 aa  662    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  79.52 
 
 		 785 aa  828    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  80.72 
 
 		 784 aa  813    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3467  ATP-dependent protease La  68.43 
 
 		 798 aa  702    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.895403  hitchhiker  0.000510926 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1230  ATP-dependent protease La  70.88 
 
 		 805 aa  717    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2338  ATP-dependent protease La  65.09 
 
 		 803 aa  703    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0304727  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1552  Lon-A peptidase  66.67 
 
 		 806 aa  691    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  80.32 
 
 		 781 aa  833    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2122  ATP-dependent protease La  71.08 
 
 		 806 aa  719    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2647  ATP-dependent protease La  64.27 
 
 		 804 aa  682    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272722 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  79.52 
 
 		 785 aa  826    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000848642  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  63.86 
 
 		 812 aa  665    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01419  ATP-dependent protease  78.92 
 
 		 783 aa  823    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  64.27 
 
 		 818 aa  686    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  79.92 
 
 		 785 aa  833    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  79.28 
 
 		 784 aa  818    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1556  ATP-dependent protease La  63.75 
 
 		 813 aa  682    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0601  ATP-dependent protease La  67.31 
 
 		 820 aa  709    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273158  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1610  Lon-A peptidase  66.79 
 
 		 805 aa  700    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000614629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2394  ATP-dependent protease La  64.17 
 
 		 823 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118165 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  67.45 
 
 		 811 aa  725    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2032  Lon-A peptidase  64.78 
 
 		 809 aa  682    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.914021  decreased coverage  0.00112725 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2293  Lon-A peptidase  70.68 
 
 		 807 aa  720    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.441771 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2493  ATP-dependent protease La  80.12 
 
 		 783 aa  833    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000146156  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2892  ATP-dependent protease La  63.65 
 
 		 812 aa  663    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.169901 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2044  Lon-A peptidase  67.34 
 
 		 802 aa  698    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  62.45 
 
 		 807 aa  650    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  60.27 
 
 		 802 aa  636    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1883  Lon-A peptidase  68.74 
 
 		 803 aa  719    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0263  DNA-binding ATP-dependent protease La  73.24 
 
 		 784 aa  798    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1065  ATP-dependent protease La  60.94 
 
 		 812 aa  652    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677641  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4373  ATP-dependent protease La  63.11 
 
 		 816 aa  681    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574007  normal  0.577886 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1457  Lon-A peptidase  65.22 
 
 		 808 aa  693    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  79.72 
 
 		 784 aa  826    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  59.77 
 
 		 802 aa  641    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0798  ATP-dependent protease La  59.59 
 
 		 798 aa  639    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.595986  normal  0.028237 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6158  ATP-dependent protease La  70.68 
 
 		 807 aa  712    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3134  ATP-dependent protease La  84.91 
 
 		 788 aa  870    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000324341  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  60.75 
 
 		 804 aa  640    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3350  ATP-dependent protease La  70.88 
 
 		 805 aa  717    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00464678  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1955  ATP-dependent protease La  70.88 
 
 		 805 aa  717    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1211  Lon-A peptidase  66.35 
 
 		 806 aa  703    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.451263 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0489  Lon-A peptidase  69.2 
 
 		 803 aa  721    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  76.09 
 
 		 785 aa  830    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  76.09 
 
 		 785 aa  830    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  70.6 
 
 		 816 aa  720    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2594  ATP-dependent protease La  78.51 
 
 		 783 aa  824    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000142236  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  80.72 
 
 		 784 aa  813    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1340  ATP-dependent protease La  65.04 
 
 		 802 aa  655    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0924778 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1909  ATP-dependent protease La  70.48 
 
 		 807 aa  711    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41220  Lon protease  69.86 
 
 		 798 aa  718    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.238701 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1921  ATP-dependent protease La  70.68 
 
 		 807 aa  712    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  77.91 
 
 		 784 aa  807    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2321  ATP-dependent protease La  70.88 
 
 		 805 aa  717    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00784653  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3640  Lon-A peptidase  62.87 
 
 		 812 aa  649    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0005782  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  76.28 
 
 		 785 aa  829    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0936  ATP-dependent protease La  68.79 
 
 		 810 aa  693    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  79.72 
 
 		 785 aa  831    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  75.71 
 
 		 785 aa  832    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1467  ATP-dependent protease La  74.35 
 
 		 785 aa  779    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.635914  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1838  ATP-dependent protease La  61.07 
 
 		 805 aa  666    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203387  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2204  ATP-dependent protease La  64.71 
 
 		 812 aa  659    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>