More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3295 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3295  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 317 aa  650    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0216268  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2679  LysR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0935  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 297 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.675021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0027  iron-regulated virulence regulatory protein IrgB  39.73 
 
 		 298 aa  231  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0122386  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002469  iron-regulated virulence regulatory protein IrgB  38.38 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.332225  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4517  transcriptional regulator, LysR family  32.64 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.408069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4649  transcriptional regulator, LysR family  32.64 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal  0.0278568 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1714  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3610  LysR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 302 aa  122  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1475  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0873  transcriptional regulator, LysR family  29.21 
 
 		 306 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3220  transcriptional regulator, LysR family  29.62 
 
 		 293 aa  119  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3788  transcriptional regulator, LysR family  26 
 
 		 314 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3970  LysR family transcriptional regulator  26 
 
 		 314 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3844  LysR family transcriptional regulator  26 
 
 		 314 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0481  LysR family transcriptional regulator  26 
 
 		 314 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3571  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 317 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368621  normal  0.292883 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4814  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0984  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0542  transcription regulator protein  30.84 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164617  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0401  LysR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0930057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  27.08 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3428  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0773  LysR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00220265  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3510  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 317 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5229  transcriptional regulator, LysR family  29.79 
 
 		 304 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23572  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0765  transcriptional regulator, LysR family  28.12 
 
 		 306 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0187  LysR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 325 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0521  LysR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2006  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.126264  normal  0.0111016 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3059  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2666  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4263  transcriptional regulator, LysR family  27.69 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.934857 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1107  transcriptional regulator, LysR family  27.53 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0522  LysR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0702  LysR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0727527 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002880  putative transcriptional regulator LysR family  26.67 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1715  transcriptional regulator, LysR family  29.66 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4510  LysR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172827  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4261  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.902003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16470  transcriptional regulator, LysR family  26.39 
 
 		 291 aa  110  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3100  LysR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 300 aa  109  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0437  transcriptional regulator, LysR family  29.71 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.704934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4915  LysR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0028  LysR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.391462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0243  LysR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0822  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2691  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.993609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3568  LysR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.318176  normal  0.117537 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03092  transcriptional regulator  25.96 
 
 		 291 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2375  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00507322  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_003296  RS00906  transcription regulator protein  27.74 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.440828 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0463  LysR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.417526 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0423  transcriptional regulator, LysR family  29.71 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  hitchhiker  0.000106922 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  31.32 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0249  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5041  LysR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 317 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.401985 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1872  transcriptional regulator, LysR family  29.11 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1564  transcriptional regulator, LysR family  26.49 
 
 		 343 aa  106  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0571861  normal  0.229966 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1439  transcriptional regulator, LysR family  28.19 
 
 		 300 aa  106  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.267648  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1408  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 310 aa  106  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.349325 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1087  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 316 aa  106  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0523  LysR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 310 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0854  LysR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 313 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  28.37 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6112  transcriptional regulator  28.03 
 
 		 307 aa  105  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5420  transcriptional regulator, LysR family  29.8 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3870  putative transcriptional regulator  28.42 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  0.618692 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3236  LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0163272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06550  transcriptional regulator, LysR family  27.83 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213986  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2223  LysR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.499839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0498  transcriptional regulator, LysR family protein  25.25 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.883152  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4725  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4339  transcriptional regulator, LysR family  29.41 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.411983 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17380  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4138  transcriptional regulator, LysR family  28.86 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1081  transcriptional regulator AphB  27.09 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1894  LysR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0418  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.68 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03103  predicted DNA-binding transcriptional regulator, efflux system  26.03 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0463  transcriptional regulator, LysR family  26.03 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4560  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.03 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3726  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.03 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0463  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.03 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3432  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.03 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2393  transcriptional regulator, LysR family  26.42 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340015 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0451  LysR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03054  hypothetical protein  26.03 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3407  LysR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3539  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.03 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1509  putative transcriptional regulator  28.62 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>