More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002469 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002469  iron-regulated virulence regulatory protein IrgB  100 
 
 		 297 aa  614  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.332225  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0027  iron-regulated virulence regulatory protein IrgB  53.69 
 
 		 298 aa  325  6e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0122386  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2679  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3295  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 317 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0216268  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0935  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.675021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0401  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 313 aa  112  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0930057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1339  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.150488 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1475  LysR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 325 aa  102  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1973  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 307 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0522  LysR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1564  transcriptional regulator, LysR family  27.37 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0571861  normal  0.229966 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0521  LysR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3643  transcriptional regulator, LysR family  28.23 
 
 		 309 aa  99.8  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8248  transcriptional regulator, LysR family  26.95 
 
 		 301 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4814  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 302 aa  99  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0523  LysR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 310 aa  98.2  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3788  transcriptional regulator, LysR family  27 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3844  LysR family transcriptional regulator  27 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0481  LysR family transcriptional regulator  27 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3970  LysR family transcriptional regulator  27 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3099  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3510  LysR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 317 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0498  transcriptional regulator, LysR family protein  26.6 
 
 		 312 aa  96.7  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.883152  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0968  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 302 aa  95.9  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0187  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 325 aa  95.5  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0999  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3100  LysR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5648  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0909  transcriptional regulator, LysR family  28.87 
 
 		 308 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.984815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2362  LysR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6890  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2963  LysR, substrate-binding  25.45 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0968  LysR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.564507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0604  LysR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 303 aa  93.6  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  27.36 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  26.44 
 
 		 302 aa  93.2  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3428  LysR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 311 aa  92.8  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3610  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 302 aa  92.8  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0773  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 315 aa  92.8  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00220265  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0579  LysR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 303 aa  92.8  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.0538028 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2297  LysR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 304 aa  92.8  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000212474  hitchhiker  0.000857441 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1442  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.91 
 
 		 315 aa  92.4  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0952  LysR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 299 aa  92.4  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.102057  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1056  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 299 aa  92.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199163  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0104  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2671  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1072  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.165542  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1434  LysR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325668  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1541  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0122  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1264  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2818  transcriptional regulator  28.28 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2961  LysR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2006  LysR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.126264  normal  0.0111016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3473  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4929  transcriptional regulator, LysR family  28.2 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00665073  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1129  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1657  LysR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 306 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0706  LysR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0218  transcriptional regulator, LysR family  27.93 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000934146  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1277  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.927239  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2226  LysR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539476  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4649  transcriptional regulator, LysR family  33.71 
 
 		 311 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal  0.0278568 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 306 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3549  LyrR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 299 aa  90.1  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4517  transcriptional regulator, LysR family  33.71 
 
 		 311 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.408069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0604  LysR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 312 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1210  LysR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.467633  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1721  LysR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 312 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1157  LysR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 307 aa  90.1  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1928  LysR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 312 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3808  transcriptional regulator LysR family  25.76 
 
 		 309 aa  89.7  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3551  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 299 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0451  LysR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 309 aa  89.4  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1091  LysR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 307 aa  89.7  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0547  transcriptional regulator, LysR family protein  25.51 
 
 		 303 aa  89.4  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444887  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3727  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.97 
 
 		 309 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107486 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3558  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.97 
 
 		 309 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3439  LysR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 303 aa  89.4  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0327434  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3559  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.97 
 
 		 309 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3665  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.97 
 
 		 309 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.99326 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0736  LysR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 306 aa  89  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637437  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3630  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.97 
 
 		 309 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.75458  normal  0.0429881 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0695  LysR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 303 aa  89.4  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000273507  normal  0.730196 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1955  LysR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 310 aa  89  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.043876 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3153  LysR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 305 aa  89  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1317  LysR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 301 aa  89  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00079533 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2309  transcriptional regulator  26.82 
 
 		 312 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3354  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 299 aa  89  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 296 aa  89  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0463  transcriptional regulator, LysR family  23.63 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01787  transcription regulator protein  26.21 
 
 		 297 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.933146 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0156  transcriptional regulator, LysR family  30.36 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497114  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3432  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.63 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3426  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0463  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.63 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0846  LysR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.579018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0148  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>