More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3568 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3568  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  593  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.318176  normal  0.117537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1408  LysR family transcriptional regulator  66.12 
 
 		 310 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.349325 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0873  transcriptional regulator, LysR family  67 
 
 		 306 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0765  transcriptional regulator, LysR family  66.34 
 
 		 306 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5229  transcriptional regulator, LysR family  64.69 
 
 		 304 aa  394  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23572  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1087  LysR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 316 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6112  transcriptional regulator  64.71 
 
 		 307 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0822  LysR family transcriptional regulator  63.7 
 
 		 304 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1714  LysR family transcriptional regulator  67.11 
 
 		 306 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2284  transcriptional regulator, LysR family  61.31 
 
 		 305 aa  354  1e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.487329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1710  transcriptional regulator, LysR family  62.62 
 
 		 305 aa  346  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1852  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275595 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4063  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4303  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2449  transcriptional regulator, LysR family  37.58 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00856544  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1439  transcriptional regulator, LysR family  38.78 
 
 		 300 aa  189  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.267648  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3459  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 		 324 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0517  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 302 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5638  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 302 aa  186  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.360222  hitchhiker  0.00205655 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3456  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 340 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.695325 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1985  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 330 aa  185  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4923  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.15 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3963  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0279  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0279  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5252  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 295 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  35.52 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 302 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1271  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 324 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658069  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3530  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 296 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2938  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 293 aa  175  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3059  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 310 aa  175  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2711  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1305  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5125  transcriptional regulator, LysR family  34.88 
 
 		 304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 302 aa  172  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1370  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 300 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1116  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 316 aa  172  9e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2087  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0306399  normal  0.33817 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2297  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000212474  hitchhiker  0.000857441 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4537  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 307 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3094  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473286  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0791  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 314 aa  169  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2393  transcriptional regulator, LysR family  32.86 
 
 		 304 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340015 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  34.87 
 
 		 312 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 309 aa  169  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5396  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 304 aa  168  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  0.350527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 300 aa  168  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  31.65 
 
 		 307 aa  168  9e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4623  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 315 aa  168  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.570776 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1394  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5286  transcriptional regulator, LysR family  35.03 
 
 		 302 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0180264  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0912  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.990881  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1372  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0864691 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2719  transcriptional regulator, LysR family  35.96 
 
 		 300 aa  167  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0212  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00206756  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00201  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.11 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0488817  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1434  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325668  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1066  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.567936  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4560  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.788363  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2063  transcriptional regulator, LysR family  37.41 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.656887 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3457  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.451664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00206  hypothetical protein  33.11 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0328  transcriptional regulator, LysR family  35 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1682  putative transcriptional regulator  35.43 
 
 		 308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177927  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2666  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0203  transcriptional regulator, LysR family  33.44 
 
 		 304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.181175 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3400  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0212  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0221  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0884179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0339  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 312 aa  166  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.541519 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0219  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0947098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1399  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 296 aa  166  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  31.96 
 
 		 302 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 306 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0225  transcriptional regulator, LysR family  35.84 
 
 		 309 aa  165  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0260  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.026779 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5821  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  30.45 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0187  LysR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  36.73 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2050  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.777492  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6027  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1296  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5604  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6523  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.714407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2082  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4334  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4637  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.416318  normal  0.0807289 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1649  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0254834 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3066  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2812  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 305 aa  162  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.110516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1743  carbonate dehydratase  35.84 
 
 		 310 aa  162  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  34.62 
 
 		 300 aa  162  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>