More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1710 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1710  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 305 aa  607  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2284  transcriptional regulator, LysR family  81.64 
 
 		 305 aa  485  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.487329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1408  LysR family transcriptional regulator  65.9 
 
 		 310 aa  403  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.349325 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1087  LysR family transcriptional regulator  63.7 
 
 		 316 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0873  transcriptional regulator, LysR family  62.05 
 
 		 306 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6112  transcriptional regulator  61.06 
 
 		 307 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5229  transcriptional regulator, LysR family  60.53 
 
 		 304 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23572  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1714  LysR family transcriptional regulator  63.7 
 
 		 306 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3568  LysR family transcriptional regulator  62.62 
 
 		 307 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.318176  normal  0.117537 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0765  transcriptional regulator, LysR family  60.07 
 
 		 306 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0822  LysR family transcriptional regulator  58.22 
 
 		 304 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2087  LysR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0306399  normal  0.33817 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1439  transcriptional regulator, LysR family  35.37 
 
 		 300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.267648  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2961  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 292 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2711  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 292 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1682  putative transcriptional regulator  34.23 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177927  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  29.49 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  29.49 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1296  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0517  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 307 aa  166  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0743  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 310 aa  165  9e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4923  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.04 
 
 		 300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3530  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  30.38 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2449  transcriptional regulator, LysR family  34.35 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00856544  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3059  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 310 aa  162  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5252  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1448  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0364851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0988  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29091  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1470  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5638  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 302 aa  162  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.360222  hitchhiker  0.00205655 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 300 aa  162  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2938  transcriptional regulator, LysR family  32.3 
 
 		 293 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2297  LysR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000212474  hitchhiker  0.000857441 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5125  transcriptional regulator, LysR family  31.99 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3835  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0791  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 314 aa  159  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1704  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.743789  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1116  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 316 aa  159  5e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3280  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 303 aa  159  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39900  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 303 aa  159  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1833  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 294 aa  159  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2617  transcriptional regulator, LysR family  34.72 
 
 		 301 aa  158  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000166311  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2603  LysR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 555 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3236  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0163272  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2531  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3985  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5396  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  0.350527 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  29.11 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2957  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014906 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1545  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 301 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1103  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 301 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1883  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 333 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0921981  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0208  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 301 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00341225  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1730  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 301 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 309 aa  155  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6189  transcriptional regulator, LysR family  34.38 
 
 		 329 aa  155  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2393  transcriptional regulator, LysR family  30.42 
 
 		 304 aa  155  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340015 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3304  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0406781  hitchhiker  0.00949003 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0783  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4581  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2357  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.67 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.673893  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4637  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.416318  normal  0.0807289 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1356  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  31.74 
 
 		 335 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2122  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 293 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  32.64 
 
 		 315 aa  153  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 303 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 303 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0321  transcriptional regulator, LysR family  34.34 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3498  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 298 aa  152  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00180927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4992  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.79 
 
 		 304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170896  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7085  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1541  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.827921  normal  0.805114 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0801  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 298 aa  152  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2733  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 300 aa  152  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 305 aa  152  8e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0279  transcriptional regulator, LysR family  28.81 
 
 		 297 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0279  transcriptional regulator, LysR family  28.81 
 
 		 297 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1434  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 301 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325668  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2411  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 304 aa  152  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.410162  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5166  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1442  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.53 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2339  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6558  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6239  LysR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2063  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.656887 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1518  transcriptional regulator, LysR family  37.29 
 
 		 317 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3762  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1355  LysR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1395  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.465042  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>