More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3835 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3835  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 329 aa  661    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6189  transcriptional regulator, LysR family  77.81 
 
 		 329 aa  521  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3512  LysR family transcriptional regulator  59.6 
 
 		 302 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807403 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4012  LysR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 302 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4354  LysR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 302 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.294193  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2071  LysR family transcriptional regulator  57.24 
 
 		 302 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.152611  normal  0.829047 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6523  LysR family transcriptional regulator  50.84 
 
 		 307 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.714407 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6239  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 307 aa  322  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6559  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 		 304 aa  259  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.882993 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6558  LysR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 301 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3059  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 310 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0406  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1541  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2671  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2818  transcriptional regulator  35.42 
 
 		 301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0104  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1072  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.165542  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1264  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0122  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0309  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765891  normal  0.171881 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0822  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5229  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23572  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1408  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.349325 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5041  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.401985 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0873  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 306 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 302 aa  156  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1087  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 316 aa  156  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2440  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.407075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2087  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0306399  normal  0.33817 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4052  putative LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 300 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1833  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 294 aa  152  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3568  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 307 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.318176  normal  0.117537 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5416  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 312 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0765  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 306 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1743  carbonate dehydratase  33.12 
 
 		 310 aa  152  8e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3572  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 312 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.439946  hitchhiker  0.00313021 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2284  transcriptional regulator, LysR family  35.15 
 
 		 305 aa  152  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.487329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2062  transcriptional regulator, LysR family  33.12 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  hitchhiker  0.00696993 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1729  transcription regulator protein  35.07 
 
 		 306 aa  150  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1682  putative transcriptional regulator  33.45 
 
 		 308 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177927  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1710  transcriptional regulator, LysR family  35.66 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4752  transcriptional regulator, LysR family  30.85 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  31.42 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1070  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.651506  decreased coverage  0.00634214 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6112  transcriptional regulator  32.86 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3852  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463671  normal  0.50732 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6890  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3669  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4694  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1599  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.145078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5078  transcriptional regulator, LysR family  30.85 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0909939  hitchhiker  0.00473765 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2223  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 310 aa  145  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.499839  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1296  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3220  transcriptional regulator, LysR family  34.59 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1474  transcriptional regulator, LysR family  31.76 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0906205  hitchhiker  0.00000000107366 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2961  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 292 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2719  transcriptional regulator, LysR family  32.51 
 
 		 300 aa  144  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2936  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 292 aa  143  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1199  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  31.27 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5166  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2711  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 292 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2666  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 299 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1523  transcriptional regulator, LysR family  32.12 
 
 		 308 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.072714  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 293 aa  142  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3770  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 301 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 302 aa  142  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 301 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.181175 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1649  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0254834 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0187  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1439  transcriptional regulator, LysR family  32.21 
 
 		 300 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.267648  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3236  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0163272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1852  LysR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275595 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  31.03 
 
 		 300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5359  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.409076  normal  0.253591 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5323  transcriptional regulator, LysR family  31.08 
 
 		 313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3230  regulatory protein, LysR  28.67 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.796191 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  34.36 
 
 		 299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6027  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2050  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.777492  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  30.74 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2550  transcriptional regulator, LysR family  34.25 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.673699 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2082  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3583  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.23323  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.98 
 
 		 299 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 304 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2711  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5139  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 304 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357677  normal  0.250764 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 313 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 303 aa  139  7e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 294 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5120  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 299 aa  139  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 334 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1952  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 301 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.514142 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3356  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1714  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2774  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>