More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2071 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2071  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 302 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.152611  normal  0.829047 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4012  LysR family transcriptional regulator  85.76 
 
 		 302 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4354  LysR family transcriptional regulator  85.76 
 
 		 302 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.294193  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3512  LysR family transcriptional regulator  84.77 
 
 		 302 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807403 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6189  transcriptional regulator, LysR family  59.53 
 
 		 329 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3835  LysR family transcriptional regulator  57.24 
 
 		 329 aa  348  8e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6523  LysR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 307 aa  315  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.714407 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6239  LysR family transcriptional regulator  50.83 
 
 		 307 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6558  LysR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 301 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6559  LysR family transcriptional regulator  44.15 
 
 		 304 aa  268  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.882993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2961  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3059  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2711  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 292 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0309  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 299 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765891  normal  0.171881 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 302 aa  165  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0104  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1072  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.165542  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1264  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2671  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1541  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0122  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2818  transcriptional regulator  33.79 
 
 		 301 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3236  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 299 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0163272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5041  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.401985 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3712  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 304 aa  156  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5229  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 304 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23572  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5078  transcriptional regulator, LysR family  30.95 
 
 		 306 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0909939  hitchhiker  0.00473765 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0406  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 305 aa  155  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.38 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48770  putative transcriptional regulator  33.67 
 
 		 304 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120965  hitchhiker  0.00000153166 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2719  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 300 aa  153  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  31.38 
 
 		 297 aa  152  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  32.12 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3413  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2899  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0977536  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1833  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2440  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.407075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7085  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 295 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2592  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.786682 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4177  transcriptional regulator  33.11 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2087  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 318 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0306399  normal  0.33817 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2223  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 310 aa  148  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.499839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16720  transcriptional regulator  34.63 
 
 		 300 aa  148  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2930  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 301 aa  148  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1408  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.349325 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3570  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3214  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00397323 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3568  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.318176  normal  0.117537 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5389  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4992  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.82 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170896  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0822  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1087  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3572  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.439946  hitchhiker  0.00313021 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3852  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 313 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463671  normal  0.50732 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4694  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 313 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3669  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 313 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 304 aa  145  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2632  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 291 aa  145  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5416  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2063  transcriptional regulator, LysR family  30.8 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.656887 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4752  transcriptional regulator, LysR family  31.83 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0028  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.391462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1682  putative transcriptional regulator  32.99 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3610  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3053  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1294  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 310 aa  142  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37953  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  30.62 
 
 		 315 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1453  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 301 aa  142  5e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245506  normal  0.0938109 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3873  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 300 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  32.55 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6112  transcriptional regulator  32.3 
 
 		 307 aa  142  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 303 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1714  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2666  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4716  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276631  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3647  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3220  transcriptional regulator, LysR family  30.95 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4138  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5139  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357677  normal  0.250764 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0187  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0783  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2375  transcriptional regulator, LysR family  32.77 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00507322  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5166  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1523  transcriptional regulator, LysR family  30.29 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.072714  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2734  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2586  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0277024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0927  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.503807  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0065  transcription regulator protein  30.58 
 
 		 312 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>