More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1453 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1453  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  619  1e-176  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245506  normal  0.0938109 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1056  LysR family transcriptional regulator  79.53 
 
 		 299 aa  507  1e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000324577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1406  LysR family transcriptional regulator  79.87 
 
 		 299 aa  508  1e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.475015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0702  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0727527 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2206  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000518708  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0810  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01500  putative transcriptional regulator  35.93 
 
 		 302 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.621412 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0198  putative transcriptional regulator  34.92 
 
 		 296 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4524  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 325 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4121  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000919638  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0216  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 337 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000393101  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4242  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 333 aa  178  9e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000271565  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0218  transcriptional regulator, LysR family  34.8 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000934146  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3930  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 320 aa  176  5e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0309903  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2198  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599935 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3502  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 342 aa  169  7e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000578298  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1317  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00079533 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.88 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  32.75 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  31.69 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2868  transcriptional regulator, LysR family protein  33.67 
 
 		 313 aa  159  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0376307  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 309 aa  158  9e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3048  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 313 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0118588  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3191  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 313 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0504852  normal  0.2192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1330  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 		 313 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00626709  hitchhiker  0.000619665 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4580  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 302 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3034  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 313 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3906  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 307 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1324  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.230209 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1128  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1344  transcriptional regulator, LysR family  32.39 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00247694  normal  0.0669225 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1296  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 301 aa  153  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3363  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 312 aa  153  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0953  transcriptional regulator, LysR family  31.19 
 
 		 300 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1113  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 313 aa  152  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.800719  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1186  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1256  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00128178  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 295 aa  152  8e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1185  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 313 aa  152  8e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0305189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3351  transcriptional regulator, substrate-binding, LysR family protein  30.54 
 
 		 306 aa  152  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.545822  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02329  transcription regulator protein  32.66 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0102283 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3086  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3117  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.396466  normal  0.0204094 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2485  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 313 aa  151  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.434999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1224  carbonate dehydratase  31.99 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000421173  normal  0.31799 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2693  LysR, substrate-binding  32.32 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.426832  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3062  transcriptional regulator, LysR family  32.54 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2666  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 299 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3280  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 303 aa  149  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  29.04 
 
 		 309 aa  149  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3230  regulatory protein, LysR  31.99 
 
 		 298 aa  149  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.796191 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1872  transcriptional regulator, LysR family  31.69 
 
 		 297 aa  149  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2122  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 293 aa  149  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5286  transcriptional regulator, LysR family  30.54 
 
 		 302 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0180264  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 296 aa  149  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3101  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 303 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2695  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 337 aa  148  9e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.933352  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1305  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  30.43 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2663  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0779415  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3221  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.078712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0783  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0833  transcriptional regulator, LysR family  30.51 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1271  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 324 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658069  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1850  transcriptional regulator, LysR family  29.97 
 
 		 331 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0195634 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0934  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 298 aa  145  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 298 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2674  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5653  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5829  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 306 aa  145  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.438872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 298 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4204  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 322 aa  145  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3059  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0596  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 336 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0872  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 336 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3094  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473286  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0517  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1839  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 336 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1328  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.277671 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2393  transcriptional regulator, LysR family  33.7 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340015 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0579  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.0538028 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3150  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 303 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 307 aa  144  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4487  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 307 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 301 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2700  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 303 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.469247  normal  0.332498 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2223  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 310 aa  143  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.499839  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>