More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0935 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0935  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  618  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.675021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2679  LysR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 325 aa  292  6e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3295  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 317 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0216268  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0027  iron-regulated virulence regulatory protein IrgB  34.02 
 
 		 298 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0122386  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002469  iron-regulated virulence regulatory protein IrgB  32.19 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.332225  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  25.42 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1239  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 323 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00906  transcription regulator protein  29.63 
 
 		 292 aa  112  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.440828 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2006  LysR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 290 aa  112  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.126264  normal  0.0111016 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3610  LysR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0187  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0939  transcriptional regulator, LysR family  26.6 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.133683  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1475  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2017  LysR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.304165  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3064  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 296 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  29.05 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6256  LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5951  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  26.69 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1024  LysR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 304 aa  105  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2989  LysR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 301 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.061408 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5139  LysR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 304 aa  105  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357677  normal  0.250764 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 298 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6327  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 291 aa  105  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2605  LysR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 302 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.983354  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0760  LysR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 306 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50600  transcriptional regulator  29.83 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.857605  normal  0.0631781 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 299 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1557  transcriptional regulator, LysR family  28.82 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1366  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.47 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4725  LysR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0493  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09910  putative transcriptional regulator  25.25 
 
 		 307 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2368  LysR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 313 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 298 aa  102  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0934  LysR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1124  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1509  putative transcriptional regulator  27.43 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0943  putative transcriptional regulator  25.27 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4649  transcriptional regulator, LysR family  25.42 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal  0.0278568 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4517  transcriptional regulator, LysR family  25.42 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.408069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0616  transcriptional regulator, LysR family  27.3 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3747  LysR, substrate-binding  26.49 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17380  LysR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6125  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  24.92 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479061  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4263  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0437  transcriptional regulator, LysR family  26.51 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.704934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16470  transcriptional regulator, LysR family  27.21 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4915  LysR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 300 aa  99.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1536  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 309 aa  99.8  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000458  transcriptional regulator  25 
 
 		 330 aa  99.4  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0542  transcription regulator protein  26.51 
 
 		 305 aa  99.4  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164617  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 299 aa  99.4  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04988  transcriptional regulator  26.26 
 
 		 309 aa  99.4  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1390  LysR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 322 aa  99.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  25.75 
 
 		 307 aa  99  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1119  LysR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 301 aa  99  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1169  LysR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 298 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695965 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0551  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 299 aa  99  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0083  LysR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 300 aa  99  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.670509  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2865  LysR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0451  LysR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0522  transcriptional regulator, LysR family  27.34 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1564  transcriptional regulator, LysR family  31.15 
 
 		 343 aa  98.2  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0571861  normal  0.229966 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  25.91 
 
 		 299 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0423  transcriptional regulator, LysR family  26.51 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  hitchhiker  0.000106922 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5274  LysR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 321 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2575  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2824  LysR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  25.6 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2366  transcriptional regulator, LysR family  24.83 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0908002 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10320  putative transcriptional regulator  24.54 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.548241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1763  HTH-type transcriptional regulator  24.92 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1266  LysR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.50212  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5596  transcriptional regulator, LysR family  24.66 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4357  transcriptional regulator, LysR family  25.74 
 
 		 301 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1543  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 299 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3551  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0909  transcriptional regulator, LysR family  26.46 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.984815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0968  LysR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 313 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1428  LysR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 313 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0670  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 303 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1450  LysR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 313 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4060  LysR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3680  transcriptional regulator, LysR family  27.6 
 
 		 302 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2458  LysR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115527  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0927  LysR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 313 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.503807  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1192  LysR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0952  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.102057  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0463  transcriptional regulator, LysR family  24.17 
 
 		 309 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1056  transcriptional regulator, LysR family  25.94 
 
 		 299 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0463  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.17 
 
 		 309 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001199  transcriptional regulator  25.93 
 
 		 309 aa  96.7  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.862431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>