More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2679 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2679  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 325 aa  654    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3295  LysR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 317 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0216268  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0935  LysR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 297 aa  292  7e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.675021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002469  iron-regulated virulence regulatory protein IrgB  42.28 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.332225  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0027  iron-regulated virulence regulatory protein IrgB  41.61 
 
 		 298 aa  237  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0122386  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4263  transcriptional regulator, LysR family  31.46 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.934857 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0579  LysR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 303 aa  119  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.0538028 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4517  transcriptional regulator, LysR family  32.64 
 
 		 311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.408069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4649  transcriptional regulator, LysR family  32.64 
 
 		 311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal  0.0278568 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1056  transcriptional regulator, LysR family  32.88 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1475  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3220  transcriptional regulator, LysR family  30.82 
 
 		 293 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3206  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 309 aa  116  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0604  LysR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 303 aa  116  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0873  transcriptional regulator, LysR family  30.58 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1210  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.467633  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50600  transcriptional regulator  34.03 
 
 		 304 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.857605  normal  0.0631781 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3407  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3299  transcriptional regulator, LysR family  34.68 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  28.33 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3528  transcriptional regulator, LysR family  29.03 
 
 		 299 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6079  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 294 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.929985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5843  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 294 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4604  transcriptional regulator, LysR family  29.03 
 
 		 299 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0806  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 312 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4124  LysR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 303 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.774115  decreased coverage  0.0000191033 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3968  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 303 aa  112  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  31.2 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3236  LysR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0163272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2436  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399633  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2190  transcriptional regulator, LysR family  32.3 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0283977  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0218  transcriptional regulator, LysR family  30.15 
 
 		 337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000934146  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4915  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3338  transcriptional regulator, LysR family  30.8 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0437  transcriptional regulator, LysR family  29.93 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.704934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2963  LysR, substrate-binding  28.84 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1439  transcriptional regulator, LysR family  30.56 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.267648  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02329  transcription regulator protein  33.67 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0102283 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0968  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17380  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 305 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2366  transcriptional regulator, LysR family  28.81 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0908002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0765  transcriptional regulator, LysR family  31.02 
 
 		 306 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 305 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 305 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1509  putative transcriptional regulator  31.08 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 305 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37120  LysR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 310 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0187077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2362  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 301 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0423  transcriptional regulator, LysR family  29.93 
 
 		 305 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  hitchhiker  0.000106922 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1883  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0921981  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0401  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0930057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1591  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0854  LysR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2711  LysR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0481  LysR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3844  LysR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3970  LysR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4242  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000271565  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2632  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 291 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3788  transcriptional regulator, LysR family  27.33 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0562  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.293612 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1564  transcriptional regulator, LysR family  35.11 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0571861  normal  0.229966 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0933  LysR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 453 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0523  LysR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1955  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.043876 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3219  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00312841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1219  LysR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 448 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1560  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.987371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5031  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0743  LysR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3610  LysR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 302 aa  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3100  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0216  LysR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 337 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000393101  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0451  LysR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5619  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 309 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.272511 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2503  LysR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 315 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.464672  normal  0.275989 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0498  transcriptional regulator, LysR family protein  26.94 
 
 		 312 aa  106  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.883152  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1103  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1918  LysR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06237  transcriptional regulator  32.46 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1730  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0208  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00341225  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  28.33 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01082  transcriptional regulator  32.46 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000539431  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0521  LysR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 317 aa  106  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0522  LysR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 317 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1545  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2195  LysR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 320 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0542  transcription regulator protein  29.61 
 
 		 305 aa  106  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164617  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2297  LysR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 304 aa  106  7e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000212474  hitchhiker  0.000857441 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2411  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 304 aa  105  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.410162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4121  LysR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 337 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000919638  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1239  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 323 aa  105  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 298 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2936  LysR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3029  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686925 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3189  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.77747  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>