More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_10320 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_10320  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.548241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0943  putative transcriptional regulator  88.18 
 
 		 296 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3086  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 289 aa  190  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1305  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1271  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 324 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658069  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0187  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 325 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0810  LysR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 295 aa  159  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4537  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1394  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0912  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.990881  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1372  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0864691 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4932  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 322 aa  152  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  hitchhiker  0.000452081 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0806  LysR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 312 aa  149  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2435  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 292 aa  149  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.512011  normal  0.0184042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1560  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.987371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3094  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 301 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473286  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1652  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4752  transcriptional regulator, LysR family  32.85 
 
 		 314 aa  145  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4524  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  33.94 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3214  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00397323 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4242  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000271565  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0198  putative transcriptional regulator  31.77 
 
 		 296 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1169  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0218  transcriptional regulator, LysR family  32.21 
 
 		 337 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000934146  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0216  LysR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 337 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000393101  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2449  transcriptional regulator, LysR family  30.2 
 
 		 300 aa  142  9e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00856544  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4121  LysR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 337 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000919638  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0980  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.926396 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3930  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0309903  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5286  transcriptional regulator, LysR family  34.31 
 
 		 302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0180264  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0406  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0968  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.564507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0622  transcriptional regulator, LysR family  30.21 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.815272  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0743  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 310 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 295 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0235  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 454 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.920099  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3299  transcriptional regulator, LysR family  37.63 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  33.11 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1872  transcriptional regulator, LysR family  32.72 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6421  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1729  transcription regulator protein  32.26 
 
 		 306 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1687  LysR family regulatory protein  30.11 
 
 		 453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0643  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01500  putative transcriptional regulator  30.07 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.621412 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0324  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 320 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544566  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2429  transcriptional regulator, LysR family  32.54 
 
 		 313 aa  136  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404715 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 313 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1918  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2195  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 320 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0104  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2671  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0122  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1072  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.165542  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1264  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1541  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0234  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 448 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2818  transcriptional regulator  31.36 
 
 		 301 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1390  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 322 aa  135  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1219  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 448 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3690  transcriptional regulator, LysR family  31.87 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0933  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 453 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4350  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 311 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3549  LyrR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4777  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0231  transcriptional regulator, LysR family  29.79 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5917  LysR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0434  transcriptional regulator, LysR family  34.56 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5552  LysR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0934  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0359  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475438  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4334  LysR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 302 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1373  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.260945  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1192  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 299 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4153  transcriptional regulator, LysR family  31.77 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2458  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 299 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115527  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3391  transcriptional regulator, LysR family  31.5 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0564115 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4581  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 315 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4265  transcriptional regulator, LysR family  31.77 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.562442 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0637  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2152  LysR substrate-binding  31.86 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0841975  normal  0.836129 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2533  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1266  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.50212  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 298 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2112  transcriptional regulator, LysR family  31.86 
 
 		 313 aa  132  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.920378 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  29.93 
 
 		 298 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5774  LysR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 305 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1284  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 315 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.821306  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2043  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 310 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1599  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 310 aa  132  9e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.145078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 306 aa  132  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 298 aa  132  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>