More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3391 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3391  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 
297 aa  603  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0564115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3690  transcriptional regulator, LysR family  92.93 
 
 
297 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316859  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3808  transcriptional regulator LysR family  72.64 
 
 
309 aa  467  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2773  LysR family transcriptional regulator  73.47 
 
 
304 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0098  LysR family transcriptional regulator  59.32 
 
 
297 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4247  LysR family transcriptional regulator  59.66 
 
 
297 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2713  LysR family transcriptional regulator  57.43 
 
 
302 aa  344  8.999999999999999e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  40.96 
 
 
305 aa  223  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
303 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3230  regulatory protein, LysR  36.49 
 
 
298 aa  208  7e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.796191 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4209  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
304 aa  208  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0831  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
296 aa  206  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1390  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 
322 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 
313 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1344  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 
296 aa  202  8e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00247694  normal  0.0669225 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 
307 aa  199  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0783  LysR, substrate-binding  36.3 
 
 
303 aa  199  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2979  transcriptional regulator, LysR family  38.85 
 
 
306 aa  198  9e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438714  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
298 aa  195  7e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 
306 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 
296 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1682  putative transcriptional regulator  36.7 
 
 
308 aa  193  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177927  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
304 aa  193  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 
301 aa  192  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 
298 aa  192  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2632  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
291 aa  192  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
300 aa  192  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
295 aa  190  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0783  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 
301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  35.81 
 
 
297 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02101  probable transcriptional regulator, LysR family protein  33.55 
 
 
301 aa  189  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0550958  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  37.11 
 
 
335 aa  189  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.01 
 
 
299 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3280  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
303 aa  189  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1670  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
295 aa  188  8e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.969341  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2002  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
301 aa  187  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00230596  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2223  LysR family transcriptional regulator  38.35 
 
 
310 aa  187  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.499839  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1129  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
298 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 
298 aa  186  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3528  transcriptional regulator, LysR family  34.81 
 
 
299 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4604  transcriptional regulator, LysR family  34.81 
 
 
299 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0137  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 
302 aa  185  7e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
297 aa  185  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  34.14 
 
 
302 aa  185  8e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2375  transcriptional regulator, LysR family  35.49 
 
 
301 aa  185  9e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00507322  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
298 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 
298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3498  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00180927  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4334  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2575  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 
301 aa  183  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0931431  normal  0.61434 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1295  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
340 aa  183  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
296 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  34.14 
 
 
307 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
304 aa  182  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
301 aa  182  6e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
299 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
313 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
294 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  36.27 
 
 
299 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6245  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
294 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1859  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
300 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.348315  normal  0.130903 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
302 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  35.69 
 
 
299 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2674  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
294 aa  180  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3221  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
303 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.078712  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  35.23 
 
 
298 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  34.95 
 
 
298 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3117  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.396466  normal  0.0204094 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  36.64 
 
 
302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 
305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4311  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 
303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3062  transcriptional regulator, LysR family  35.69 
 
 
303 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2456  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
313 aa  179  7e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.161377  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0927  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 
313 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.503807  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2987  LysR family transcriptional regulator  38.8 
 
 
320 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2967  LysR family transcriptional regulator  38.8 
 
 
320 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2353  LysR family transcriptional regulator  38.8 
 
 
320 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884603  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1199  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  34.01 
 
 
300 aa  177  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
299 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 
292 aa  178  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1871  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 
310 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3918  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 
299 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228486  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1244  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 
293 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 
301 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1228  transcriptional regulator, LysR family  36.7 
 
 
305 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 
307 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 
307 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2586  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 
301 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0277024  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1689  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  32.53 
 
 
300 aa  176  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0260  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 
302 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.026779 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  33.45 
 
 
289 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0953  transcriptional regulator, LysR family  36.12 
 
 
300 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255638  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6316  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
320 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  34.23 
 
 
298 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1210  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 
298 aa  176  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.467633  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  34.95 
 
 
295 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3220  transcriptional regulator, LysR family  34.24 
 
 
293 aa  176  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>