More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2533 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2533  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 340 aa  672    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2950  LysR family transcriptional regulator  68.44 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.29372  normal  0.491589 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4364  LysR family transcriptional regulator  60 
 
 		 352 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4752  transcriptional regulator, LysR family  61.2 
 
 		 314 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1599  LysR family transcriptional regulator  56.69 
 
 		 310 aa  357  1.9999999999999998e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.145078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5468  LysR family transcriptional regulator  57.28 
 
 		 327 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0722609  normal  0.114512 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5393  LysR family transcriptional regulator  57.28 
 
 		 327 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.147064  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4801  LysR family transcriptional regulator  55.35 
 
 		 311 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4810  LysR family transcriptional regulator  56.35 
 
 		 327 aa  316  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5351  LysR family transcriptional regulator  56.35 
 
 		 327 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0186  LysR family transcriptional regulator  56.19 
 
 		 327 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.142233 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3318  LysR family transcriptional regulator  56.59 
 
 		 327 aa  309  5e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1579  transcriptional regulator, LysR family  52.58 
 
 		 312 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1470  LysR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1448  LysR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0364851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0988  LysR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29091  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 302 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3059  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 310 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 304 aa  176  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1295  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5125  transcriptional regulator, LysR family  34.19 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2087  LysR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 318 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0306399  normal  0.33817 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.96 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0517  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  34.3 
 
 		 301 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4052  putative LysR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 300 aa  169  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0519  LysR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.84589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0279  transcriptional regulator, LysR family  30.84 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0279  transcriptional regulator, LysR family  30.84 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1355  LysR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1872  transcriptional regulator, LysR family  35.55 
 
 		 297 aa  166  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1395  LysR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 301 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.465042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2017  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.304165  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2122  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1439  transcriptional regulator, LysR family  34.27 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.267648  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3770  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4923  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.81 
 
 		 300 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6890  LysR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  33.99 
 
 		 305 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 299 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3066  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 313 aa  162  6e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3100  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 300 aa  162  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6256  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 304 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 303 aa  162  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5951  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5829  transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.438872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2938  transcriptional regulator, LysR family  32.04 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  34.43 
 
 		 299 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3098  transcriptional regulator, LysR family  30.36 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3355  transcriptional regulator, LysR family  30.36 
 
 		 303 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.35672  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3431  LysR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0760  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  30.03 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0065  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2603  LysR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 555 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1883  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0921981  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 303 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 303 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 302 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1871  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 310 aa  159  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2072  LysR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 308 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2818  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 316 aa  159  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 303 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 303 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1103  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 301 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1545  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 301 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0208  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 301 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00341225  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1730  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 301 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0783  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0674  transcriptional regulator, LysR family  31.33 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0871  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00440392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1704  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.743789  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5846  LysR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 294 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2040  LysR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 301 aa  157  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.141509  normal  0.369183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5229  transcriptional regulator, LysR family  34.29 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23572  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1187  LysR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 301 aa  157  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1116  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 316 aa  156  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1182  LysR family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815774  normal  0.250883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5139  LysR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 304 aa  156  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357677  normal  0.250764 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2818  LysR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50081  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0322  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 305 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.844631 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 298 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3762  LysR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2368  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 313 aa  155  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 298 aa  155  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 294 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1164  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376229  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0246  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1521  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0939  transcriptional regulator, LysR family  31.17 
 
 		 304 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.133683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4434  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1198  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3267  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.995202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  34.77 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0632  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>