More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_1579 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1579  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 
312 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4752  transcriptional regulator, LysR family  58.56 
 
 
314 aa  319  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2533  LysR family transcriptional regulator  51.67 
 
 
340 aa  300  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4364  LysR family transcriptional regulator  51.86 
 
 
352 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1599  LysR family transcriptional regulator  49.67 
 
 
310 aa  275  6e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.145078  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5468  LysR family transcriptional regulator  53.92 
 
 
327 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0722609  normal  0.114512 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5393  LysR family transcriptional regulator  53.92 
 
 
327 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.147064  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4801  LysR family transcriptional regulator  54.05 
 
 
311 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3318  LysR family transcriptional regulator  54.14 
 
 
327 aa  268  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4810  LysR family transcriptional regulator  53.79 
 
 
327 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5351  LysR family transcriptional regulator  53.79 
 
 
327 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272634  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0186  LysR family transcriptional regulator  54.14 
 
 
327 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.142233 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2950  LysR family transcriptional regulator  54.79 
 
 
336 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.29372  normal  0.491589 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3059  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3657  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5125  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 
304 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3066  LysR family transcriptional regulator  33.23 
 
 
313 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0517  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
307 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2122  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
293 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
302 aa  155  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1499  transcriptional regulator, LysR family  37.79 
 
 
296 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456019 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  36.61 
 
 
299 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5829  transcriptional regulator, LysR family  38.81 
 
 
306 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.438872  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4434  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2218  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
298 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.42945 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2811  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
351 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0279  transcriptional regulator, LysR family  29.93 
 
 
297 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2270  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
351 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520231  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0138  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
351 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0153  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
351 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2347  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
351 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0342  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
351 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0145  transcriptional regulator  32.54 
 
 
351 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0279  transcriptional regulator, LysR family  29.93 
 
 
297 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0124  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
351 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3131  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
349 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154836  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3147  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
349 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.315246 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2518  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
349 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6482  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
349 aa  148  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.833038 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0104  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1072  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.165542  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1541  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0122  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1264  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2671  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3069  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3186  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651713  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
294 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3128  LysR family transcriptional regulator  32.01 
 
 
349 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2818  transcriptional regulator  33.79 
 
 
301 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1591  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 
313 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245083  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
309 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  34.03 
 
 
305 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2087  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0306399  normal  0.33817 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5034  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 
308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3100  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
300 aa  146  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4420  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
367 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0287989 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0305  transcriptional regulator, LysR family  32.88 
 
 
367 aa  145  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0031  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
362 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0549  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
322 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4923  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.44 
 
 
300 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2440  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
313 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.407075  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0406  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 
305 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1510  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 
312 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.451093  normal  0.28121 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0783  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
301 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4963  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 
296 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2663  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
328 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1233  HTH-type transcriptional regulator, LysR family  30.38 
 
 
311 aa  142  5e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.573429  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1448  LysR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
302 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0364851  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0988  LysR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
302 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29091  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1470  LysR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
302 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0801  LysR family transcriptional regulator  26.28 
 
 
298 aa  142  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30990  Transcriptional regulator LysR family protein  32.31 
 
 
309 aa  142  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0583  transcriptional regulator, LysR family  35.42 
 
 
319 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1958  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
307 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1872  transcriptional regulator, LysR family  34.02 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1542  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 
315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00182355  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3852  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 
313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463671  normal  0.50732 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1439  transcriptional regulator, LysR family  32.78 
 
 
300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.267648  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7100  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 
294 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1971  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
355 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3669  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
313 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 
299 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4694  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
313 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5036  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 
303 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.617167 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3610  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 
302 aa  139  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1871  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 
310 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2115  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
302 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.477701  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  32.04 
 
 
298 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  32.04 
 
 
298 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2936  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
292 aa  139  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1136  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
306 aa  139  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  30.39 
 
 
307 aa  139  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>