More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1958 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1958  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  608  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4131  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  54.28 
 
 		 304 aa  348  6e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1328  LysR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 307 aa  316  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.277671 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4487  LysR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 307 aa  315  7e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4614  LysR family transcriptional regulator  49.01 
 
 		 314 aa  306  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0515888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0835  LysR family transcriptional regulator  52.65 
 
 		 307 aa  303  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3332  LysR family transcriptional regulator  46.69 
 
 		 307 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0789426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2090  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 300 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000497433  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1588  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 300 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0535581  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2615  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 300 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3222  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 300 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1996  LysR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 327 aa  223  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0901826  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2526  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 300 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1363  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 327 aa  222  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659256  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2473  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 327 aa  222  7e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1952  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.514142 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5359  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.409076  normal  0.253591 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 301 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.181175 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  42.91 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2050  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.777492  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6027  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  41.36 
 
 		 299 aa  218  7.999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2082  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 		 300 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 306 aa  212  7e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1649  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 300 aa  212  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0254834 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1370  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  38.31 
 
 		 309 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  40.26 
 
 		 335 aa  210  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.59 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  40.56 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4164  LysR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 310 aa  206  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0153  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 351 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0138  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 351 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0342  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 351 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2270  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 351 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520231  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0145  transcriptional regulator  38.91 
 
 		 351 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2347  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 351 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2811  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 351 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0124  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 351 aa  205  9e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 301 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3094  LysR family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 301 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473286  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0339  LysR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 312 aa  202  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.541519 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1300  transcriptional regulator, LysR family  39.74 
 
 		 309 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0123787  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1234  transcriptional regulator, LysR family  39.74 
 
 		 309 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.628194 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4493  LysR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.708471  normal  0.878724 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0328  transcriptional regulator, LysR family  37.3 
 
 		 312 aa  202  8e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2289  transcriptional regulator, LysR family  38.44 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0666  LysR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550126 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1859  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.348315  normal  0.130903 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0157  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 304 aa  199  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3131  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 349 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154836  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0409  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0305  transcriptional regulator, LysR family  37.74 
 
 		 367 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1971  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 355 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4420  LysR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 367 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0287989 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3147  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 349 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.315246 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2518  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 349 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1434  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 301 aa  199  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325668  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6482  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 349 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.833038 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5286  transcriptional regulator, LysR family  41.81 
 
 		 302 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0180264  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1953  LysR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0031  LysR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1388  LysR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 362 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0522975  normal  0.825805 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1360  transcription regulator protein  40.07 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.508448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3128  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3069  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 349 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3186  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 349 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651713  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3657  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 342 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  39.79 
 
 		 293 aa  196  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1119  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 304 aa  195  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.503847  normal  0.113213 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2957  transcriptional regulator, LysR family  39.39 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014906 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1039  transcriptional regulator, LysR family  39.38 
 
 		 304 aa  193  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1403  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34329 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1305  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 307 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 298 aa  192  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1271  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 324 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658069  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1394  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2733  transcriptional regulator, LysR family  38.62 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0912  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.990881  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1372  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0864691 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2456  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.161377  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4537  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6389  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 318 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2499  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 320 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.374965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1833  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 294 aa  189  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3100  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3304  transcriptional regulator, LysR family  39.39 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0406781  hitchhiker  0.00949003 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5391  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 347 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09910  putative transcriptional regulator  34.33 
 
 		 307 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280275  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>