More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2435 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2435  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 292 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.512011  normal  0.0184042 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3086  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0005  LysR, substrate-binding  33.67 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0104  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1072  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.165542  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0122  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1541  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1264  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2671  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0406  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1390  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 322 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2818  transcriptional regulator  35.04 
 
 		 301 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  35.44 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0783  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 301 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 295 aa  156  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0588  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0943  putative transcriptional regulator  28.91 
 
 		 296 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3572  LysR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 312 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.439946  hitchhiker  0.00313021 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3669  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 313 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3852  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 313 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463671  normal  0.50732 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4694  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 313 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0556  LysR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 304 aa  155  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5416  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1682  putative transcriptional regulator  33.45 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177927  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001225  transcriptional regulator LysR family  32.98 
 
 		 299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338504  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0810  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 309 aa  152  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 298 aa  152  8e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2700  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 303 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.469247  normal  0.332498 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2440  LysR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.407075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  32.98 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5078  transcriptional regulator, LysR family  33.81 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0909939  hitchhiker  0.00473765 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1083  transcriptional regulator, LysR family  30.21 
 
 		 305 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2697  transcriptional regulator, LysR family  31.21 
 
 		 300 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2663  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 328 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0600  LysR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 305 aa  149  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 299 aa  149  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10320  putative transcriptional regulator  27.3 
 
 		 296 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.548241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000421  transcriptional regulator  32.22 
 
 		 328 aa  149  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.423035  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5041  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 317 aa  148  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.401985 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1729  transcription regulator protein  31.7 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4691  LysR family substrate binding transcriptional regulator  30.63 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4166  LysR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0833  transcriptional regulator, LysR family  32.14 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 299 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0257  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 298 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2366  transcriptional regulator, LysR family  31.23 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0908002 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4936  LysR family substrate binding transcriptional regulator  31.05 
 
 		 299 aa  145  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 289 aa  145  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2249  transcriptional regulator, LysR family  31.71 
 
 		 309 aa  145  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6327  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 291 aa  145  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4056  LysR family substrate binding transcriptional regulator  33.09 
 
 		 299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  31.19 
 
 		 297 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0325  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1324  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 313 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.230209 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2006  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.126264  normal  0.0111016 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3098  transcriptional regulator, LysR family  30.55 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0953  transcriptional regulator, LysR family  31.82 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2957  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3355  transcriptional regulator, LysR family  29.09 
 
 		 303 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.35672  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0702  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 307 aa  142  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0727527 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1434  LysR family substrate binding transcriptional regulator  30.8 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0138  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 351 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0342  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 351 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0153  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 351 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 306 aa  143  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2347  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 351 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6414  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 310 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2270  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 351 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520231  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2811  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 351 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0145  transcriptional regulator  31.51 
 
 		 351 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0183  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2019  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 309 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1185  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0305189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3128  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 349 aa  142  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1366  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.93 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  32.09 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0830  transcriptional regulator, LysR family  29.53 
 
 		 302 aa  142  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.588944  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1557  transcriptional regulator, LysR family  31.27 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1128  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 313 aa  142  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5908  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 306 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2773  LysR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 304 aa  142  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2297  LysR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 304 aa  142  8e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000212474  hitchhiker  0.000857441 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3853  LysR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 306 aa  142  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134116  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2521  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 303 aa  142  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.26667  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1499  transcriptional regulator, LysR family  33.21 
 
 		 296 aa  142  9e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456019 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5543  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 340 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21475  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1672  LysR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.255647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1689  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  30.71 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  28.91 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>