More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0943 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0943  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  593  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10320  putative transcriptional regulator  88.18 
 
 		 296 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.548241  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3086  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 289 aa  205  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1271  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658069  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1305  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0187  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0912  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.990881  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1394  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1372  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0864691 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4537  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0810  LysR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 295 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4752  transcriptional regulator, LysR family  35.04 
 
 		 314 aa  162  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2435  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.512011  normal  0.0184042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1652  LysR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3094  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473286  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1560  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.987371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 296 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  34.67 
 
 		 297 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1169  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 308 aa  149  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0622  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 300 aa  149  8e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.815272  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1872  transcriptional regulator, LysR family  34.67 
 
 		 297 aa  148  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2449  transcriptional regulator, LysR family  31.83 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00856544  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4932  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  hitchhiker  0.000452081 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 302 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4350  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0406  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 305 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0643  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1390  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0980  LysR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 304 aa  146  5e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.926396 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 295 aa  145  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0806  LysR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 312 aa  145  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5286  transcriptional regulator, LysR family  34.31 
 
 		 302 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0180264  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2533  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 340 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1729  transcription regulator protein  33.82 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3549  LyrR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0198  putative transcriptional regulator  31.44 
 
 		 296 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4504  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6421  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1599  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 310 aa  143  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.145078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01500  putative transcriptional regulator  31.54 
 
 		 302 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.621412 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2063  transcriptional regulator, LysR family  32.47 
 
 		 295 aa  142  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.656887 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0104  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 301 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1072  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 301 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.165542  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2818  transcriptional regulator  32.47 
 
 		 301 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2671  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 301 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1541  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 301 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0122  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 301 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1264  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 301 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 299 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3214  transcriptional regulator, LysR family  33.81 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00397323 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4242  LysR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 333 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000271565  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0218  transcriptional regulator, LysR family  33.71 
 
 		 337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000934146  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2429  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404715 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0743  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5041  LysR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.401985 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4121  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000919638  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0968  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.564507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3222  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4938  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4334  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3299  transcriptional regulator, LysR family  37.96 
 
 		 307 aa  139  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 297 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5917  LysR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 305 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0216  LysR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 337 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000393101  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5552  LysR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 305 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5774  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 305 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3692  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4992  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.36 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170896  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5534  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  33.45 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4524  LysR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2152  LysR substrate-binding  32.54 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0841975  normal  0.836129 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2440  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.407075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1430  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2112  transcriptional regulator, LysR family  32.88 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.920378 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4777  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 299 aa  136  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4604  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0632  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335341  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3528  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0235  LysR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 454 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.920099  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0520  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.749141  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5078  transcriptional regulator, LysR family  31.79 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0909939  hitchhiker  0.00473765 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  30.83 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2761  transcriptional regulator, LysR family  34.02 
 
 		 302 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.434624 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 302 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1235  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 327 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0125113  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2532  transcriptional regulator, LysR family  35.74 
 
 		 314 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000458  transcriptional regulator  30.5 
 
 		 330 aa  136  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1116  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 316 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2818  LysR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 299 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50081  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 298 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3690  transcriptional regulator, LysR family  29.93 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0786  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0324  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 320 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>