More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2700 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2700  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  619  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.469247  normal  0.332498 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2019  LysR family transcriptional regulator  71.24 
 
 		 309 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2249  transcriptional regulator, LysR family  70.23 
 
 		 309 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4353  transcriptional regulator, LysR family  61.79 
 
 		 304 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5874  LysR family transcriptional regulator  61.59 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6111  LysR family transcriptional regulator  61.72 
 
 		 310 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.450926  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6426  transcriptional regulator, LysR family  60.75 
 
 		 304 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.742586 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4851  transcriptional regulator, LysR family  55.89 
 
 		 298 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204914  normal  0.243062 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6414  LysR family transcriptional regulator  59.93 
 
 		 310 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5543  LysR family transcriptional regulator  60.94 
 
 		 340 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21475  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5908  LysR family transcriptional regulator  60.94 
 
 		 306 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3403  LysR family transcriptional regulator  58.67 
 
 		 304 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.641186 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2676  transcriptional regulator, LysR family  58.25 
 
 		 300 aa  340  2e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2398  LysR family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 300 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5810  LysR family transcriptional regulator  50.84 
 
 		 300 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2527  LysR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 300 aa  316  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2503  LysR family transcriptional regulator  51.17 
 
 		 300 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1867  LysR family transcriptional regulator  50.84 
 
 		 300 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2478  LysR family transcriptional regulator  50.84 
 
 		 300 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0310179  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2994  LysR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 331 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2368  LysR family transcriptional regulator  40.92 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1360  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 303 aa  221  9e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5139  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 304 aa  219  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357677  normal  0.250764 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 298 aa  219  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  41.52 
 
 		 300 aa  218  8.999999999999998e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0760  LysR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 306 aa  216  5e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  35.81 
 
 		 304 aa  211  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6256  LysR family transcriptional regulator  39 
 
 		 304 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5951  LysR family transcriptional regulator  39 
 
 		 305 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0939  transcriptional regulator, LysR family  37.29 
 
 		 304 aa  209  6e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.133683  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  38.23 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2017  LysR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.304165  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09910  putative transcriptional regulator  38.28 
 
 		 307 aa  205  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0871  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00440392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1024  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 304 aa  203  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 296 aa  202  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5274  LysR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 321 aa  202  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5596  transcriptional regulator, LysR family  37.42 
 
 		 308 aa  202  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5481  transcriptional regulator LysR family  33.45 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0288918  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  38.85 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  38.85 
 
 		 298 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0674  transcriptional regulator, LysR family  35.14 
 
 		 315 aa  198  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2818  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4276  transcriptional regulator, LysR family  35.64 
 
 		 307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1356  transcriptional regulator, LysR family  37 
 
 		 314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2592  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 299 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.786682 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1688  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 312 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0669222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0784  LysR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  38.26 
 
 		 335 aa  193  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 304 aa  193  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 309 aa  193  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 303 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3226  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 309 aa  191  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3431  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  39.26 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 298 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4901  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 303 aa  189  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.795056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 298 aa  188  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3918  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 299 aa  188  9e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3355  transcriptional regulator, LysR family  34.13 
 
 		 303 aa  188  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.35672  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1871  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 310 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0322  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.844631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3098  transcriptional regulator, LysR family  34.13 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  34.01 
 
 		 315 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1637  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 310 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0953  transcriptional regulator, LysR family  37.46 
 
 		 300 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0556  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 304 aa  186  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0441  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 313 aa  186  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 311 aa  186  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2286  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 303 aa  186  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3913  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 304 aa  186  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 303 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 303 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3618  transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 		 301 aa  185  7e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1614  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 310 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3565  transcriptional regulator, LysR family  37.46 
 
 		 298 aa  185  7e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  37.02 
 
 		 297 aa  185  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6165  transcriptional regulator, LysR family  38.08 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516449  normal  0.771556 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  34.03 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  35.29 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3657  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0850  transcriptional regulator, LysR family  35 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.840067  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3413  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0187  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3280  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4869  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00123263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06550  transcriptional regulator, LysR family  34.77 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>