More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2994 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2994  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 331 aa  672    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2700  LysR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 303 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.469247  normal  0.332498 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4851  transcriptional regulator, LysR family  47.99 
 
 		 298 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204914  normal  0.243062 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2019  LysR family transcriptional regulator  49 
 
 		 309 aa  286  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2249  transcriptional regulator, LysR family  48.36 
 
 		 309 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4353  transcriptional regulator, LysR family  46.67 
 
 		 304 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5810  LysR family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 300 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6426  transcriptional regulator, LysR family  46.26 
 
 		 304 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.742586 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2398  LysR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 300 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2527  LysR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 300 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6414  LysR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 310 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5543  LysR family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 340 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21475  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5908  LysR family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 306 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5874  LysR family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 345 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6111  LysR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 310 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.450926  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3403  LysR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 304 aa  262  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.641186 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1867  LysR family transcriptional regulator  47.99 
 
 		 300 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2478  LysR family transcriptional regulator  47.99 
 
 		 300 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0310179  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2503  LysR family transcriptional regulator  47.99 
 
 		 300 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2676  transcriptional regulator, LysR family  46.46 
 
 		 300 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0871  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 313 aa  193  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00440392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1360  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  38.44 
 
 		 300 aa  189  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 297 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0939  transcriptional regulator, LysR family  34.44 
 
 		 304 aa  185  8e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.133683  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1024  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 304 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 303 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5139  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 304 aa  179  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357677  normal  0.250764 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 301 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3351  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0327  LysR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107285  normal  0.389567 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0347  transcriptional regulator, LysR family  34.19 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.102697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 297 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 297 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0148  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 307 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0156  transcriptional regulator, LysR family  33.77 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497114  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1180  LysR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 326 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3431  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0674  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2532  transcriptional regulator, LysR family  34.49 
 
 		 314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1689  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  31.23 
 
 		 300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 300 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 296 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2818  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 316 aa  172  6.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1524  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 302 aa  172  6.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551916 
 
 
-
 
NC_004310  BR0060  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 297 aa  172  7.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0520  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 299 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.749141  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0059  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 297 aa  172  9e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0632  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 299 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335341  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1295  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 340 aa  172  9e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1235  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 327 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0125113  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1430  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0549  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0269293 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  32.78 
 
 		 304 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1688  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 312 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0669222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 298 aa  170  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  33.44 
 
 		 315 aa  169  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 305 aa  169  6e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 306 aa  169  7e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  35.84 
 
 		 297 aa  169  7e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1564  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 299 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 298 aa  169  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  34.84 
 
 		 299 aa  169  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  33.56 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2818  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50081  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1461  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.580178  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2286  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4276  transcriptional regulator, LysR family  34.29 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0760  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3755  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 319 aa  166  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3565  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 298 aa  166  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  35.13 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0526  LysR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 302 aa  166  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3355  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 303 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.35672  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 300 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5274  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4317  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.135379  normal  0.740819 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  33.77 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  32.41 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1035  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4298  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  35.54 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7340  LysR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532831  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  32.41 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3098  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.210962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>