More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_10410 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_10410  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 370 aa  751    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.232549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0863  peptide chain release factor 2  75.41 
 
 		 369 aa  577  1e-164  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1034  peptide chain release factor 2  75.69 
 
 		 370 aa  574  1.0000000000000001e-162  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1243  peptide chain release factor 2  75.48 
 
 		 371 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20340  peptide chain release factor 2  74.32 
 
 		 371 aa  570  1e-161  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2401  peptide chain release factor 2  73.61 
 
 		 371 aa  567  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0455309 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  72.13 
 
 		 374 aa  559  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.777287 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25200  peptide chain release factor 2  73.7 
 
 		 372 aa  556  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0337024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2666  peptide chain release factor 2  70.92 
 
 		 371 aa  557  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07580  peptide chain release factor 2  72.75 
 
 		 373 aa  553  1e-156  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.932102  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  66.94 
 
 		 367 aa  520  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  63.64 
 
 		 378 aa  510  1e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  63.76 
 
 		 373 aa  506  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0942  peptide chain release factor 2  64.95 
 
 		 374 aa  502  1e-141  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0440008  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  64.31 
 
 		 368 aa  503  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  64.46 
 
 		 373 aa  504  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1233  peptide chain release factor 2  67.76 
 
 		 370 aa  498  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1264  peptide chain release factor 2  67.21 
 
 		 375 aa  488  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111402  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  64.36 
 
 		 368 aa  488  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  64.38 
 
 		 371 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  63.46 
 
 		 378 aa  485  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  64.11 
 
 		 371 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  64.38 
 
 		 371 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4451  peptide chain release factor 2  63.29 
 
 		 372 aa  482  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1637  peptide chain release factor 2  62.87 
 
 		 369 aa  481  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154678  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  63.09 
 
 		 367 aa  481  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  61.41 
 
 		 372 aa  473  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  61.52 
 
 		 369 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  61.1 
 
 		 375 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  60.16 
 
 		 368 aa  459  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1865  peptide chain release factor 2  64.11 
 
 		 376 aa  453  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00679931  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3025  peptide chain release factor 2  60 
 
 		 371 aa  452  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  58.15 
 
 		 372 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  57.49 
 
 		 378 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13122  peptide chain release factor 2  61.73 
 
 		 378 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.44652 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3456  peptide chain release factor 2  59.73 
 
 		 371 aa  439  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  56.76 
 
 		 366 aa  425  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5798  peptide chain release factor 2  57.57 
 
 		 386 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  48.08 
 
 		 383 aa  354  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  47.8 
 
 		 367 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  46.82 
 
 		 372 aa  334  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  49.31 
 
 		 366 aa  330  3e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  45.71 
 
 		 377 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  42.86 
 
 		 366 aa  324  1e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  45.71 
 
 		 367 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  43.52 
 
 		 373 aa  324  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  45.7 
 
 		 357 aa  323  3e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  44.48 
 
 		 362 aa  323  3e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  46.2 
 
 		 356 aa  323  4e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  44.48 
 
 		 368 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  44.63 
 
 		 366 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  44.19 
 
 		 364 aa  320  3e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  45.74 
 
 		 371 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  47.18 
 
 		 356 aa  316  3e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  45 
 
 		 362 aa  316  4e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  46.15 
 
 		 357 aa  316  5e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  45.91 
 
 		 356 aa  315  9e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  46.46 
 
 		 372 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  44.38 
 
 		 372 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3345  peptide chain release factor 2  50.32 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.219994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  47.84 
 
 		 330 aa  310  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  44.2 
 
 		 369 aa  310  2e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  46.15 
 
 		 372 aa  310  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01981  peptide chain release factor 2  44.9 
 
 		 354 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0513147  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0182  peptide chain release factor 2  44.31 
 
 		 354 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02001  peptide chain release factor 2  44.31 
 
 		 354 aa  309  5.9999999999999995e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  43.82 
 
 		 356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  45.91 
 
 		 375 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  43.09 
 
 		 369 aa  306  3e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  47.27 
 
 		 369 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  44.76 
 
 		 364 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4596  peptide chain release factor 2  46.05 
 
 		 372 aa  304  1.0000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  44.6 
 
 		 367 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4162  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 317 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.155408 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  44.9 
 
 		 375 aa  303  3.0000000000000004e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  44.92 
 
 		 402 aa  303  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  44.61 
 
 		 360 aa  303  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  43.05 
 
 		 367 aa  302  8.000000000000001e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  45.68 
 
 		 330 aa  301  9e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  45.76 
 
 		 374 aa  301  9e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  44.51 
 
 		 371 aa  300  2e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  47.55 
 
 		 340 aa  300  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  43.18 
 
 		 367 aa  300  2e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  43.66 
 
 		 365 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  43.66 
 
 		 375 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  43.73 
 
 		 332 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  46.18 
 
 		 343 aa  300  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  44.69 
 
 		 379 aa  300  4e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  42.11 
 
 		 361 aa  299  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  41.78 
 
 		 380 aa  298  7e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  49.38 
 
 		 330 aa  298  7e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  43.18 
 
 		 376 aa  298  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  42.74 
 
 		 367 aa  296  3e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  44.14 
 
 		 329 aa  296  3e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  46.22 
 
 		 369 aa  297  3e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  41.5 
 
 		 380 aa  296  5e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  40.06 
 
 		 372 aa  295  7e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  41.78 
 
 		 380 aa  295  8e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  45.43 
 
 		 378 aa  295  8e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1805  peptide chain release factor 2  44.41 
 
 		 358 aa  295  9e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.361195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>