More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_01981 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  100 
 
 
356 aa  726    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  79.21 
 
 
356 aa  598  1e-170  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  78.93 
 
 
356 aa  588  1e-167  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02001  peptide chain release factor 2  71.31 
 
 
354 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01981  peptide chain release factor 2  71.59 
 
 
354 aa  538  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0513147  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0182  peptide chain release factor 2  71.31 
 
 
354 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02561  peptide chain release factor 2  81.03 
 
 
313 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.686331  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1548  peptide chain release factor 2  80.06 
 
 
313 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475132  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27381  peptide chain release factor 2  81.19 
 
 
319 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  72.43 
 
 
361 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02091  peptide chain release factor 2  70.74 
 
 
354 aa  511  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  69.59 
 
 
360 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  69.91 
 
 
365 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  69.91 
 
 
375 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0404  peptide chain release factor 2  71.92 
 
 
304 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.660682  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2784  peptide chain release factor 2  75.63 
 
 
292 aa  444  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2120  peptide chain release factor 2  76.36 
 
 
288 aa  425  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  49.56 
 
 
366 aa  347  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  49.54 
 
 
383 aa  347  2e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  47.79 
 
 
357 aa  347  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  49.56 
 
 
372 aa  340  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  47.37 
 
 
367 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  49.56 
 
 
378 aa  335  9e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  49.27 
 
 
372 aa  334  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  47.79 
 
 
362 aa  333  2e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  47.79 
 
 
364 aa  333  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  45.8 
 
 
373 aa  332  5e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  50 
 
 
329 aa  332  6e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  49.84 
 
 
332 aa  329  6e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  46.47 
 
 
378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  47.85 
 
 
377 aa  327  3e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  49.12 
 
 
367 aa  325  5e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  46.55 
 
 
367 aa  325  7e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15725  predicted protein  57.04 
 
 
278 aa  325  1e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0450714 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  46.55 
 
 
367 aa  325  1e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  46.76 
 
 
378 aa  323  3e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  48.25 
 
 
366 aa  322  5e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  48.5 
 
 
375 aa  322  7e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  45.99 
 
 
369 aa  322  8e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  47.08 
 
 
373 aa  321  9.999999999999999e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  45.77 
 
 
366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  50.46 
 
 
330 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  48.63 
 
 
364 aa  318  6e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 
331 aa  318  6e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  45.91 
 
 
367 aa  318  7e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0942  peptide chain release factor 2  47.92 
 
 
374 aa  318  7.999999999999999e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0440008  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  47.06 
 
 
368 aa  318  9e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  47.35 
 
 
366 aa  317  2e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  45.4 
 
 
365 aa  317  2e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  47.95 
 
 
332 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  49.53 
 
 
369 aa  317  3e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  49.69 
 
 
371 aa  316  4e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  46.8 
 
 
362 aa  315  6e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  46.06 
 
 
380 aa  315  6e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  46.65 
 
 
375 aa  315  6e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  46.78 
 
 
373 aa  315  8e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  45.77 
 
 
372 aa  315  9e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  45.98 
 
 
368 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21873  predicted protein  48.12 
 
 
406 aa  313  1.9999999999999998e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  45.99 
 
 
372 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  46.11 
 
 
367 aa  313  2.9999999999999996e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  47.65 
 
 
330 aa  313  2.9999999999999996e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  47.99 
 
 
369 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  46.06 
 
 
380 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  47.06 
 
 
367 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  48.11 
 
 
327 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  45.77 
 
 
380 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  45.32 
 
 
372 aa  311  6.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0209  peptide chain release factor 2  46.61 
 
 
381 aa  312  6.999999999999999e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  48.11 
 
 
326 aa  311  9e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  48.11 
 
 
326 aa  311  9e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  48.11 
 
 
326 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  47.23 
 
 
356 aa  311  1e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  45.77 
 
 
380 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2538  peptide chain release factor 2  46.9 
 
 
363 aa  310  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  46.09 
 
 
364 aa  310  4e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  46.65 
 
 
357 aa  309  5e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  43.15 
 
 
372 aa  309  5.9999999999999995e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1637  peptide chain release factor 2  47.63 
 
 
369 aa  308  8e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154678  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  45.76 
 
 
369 aa  308  9e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  47.52 
 
 
376 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  47.48 
 
 
326 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10410  peptide chain release factor 2  43.82 
 
 
370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.232549  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2401  peptide chain release factor 2  44.22 
 
 
371 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0455309 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2784  peptide chain release factor 2  46.22 
 
 
363 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.785261  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  46.04 
 
 
369 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  45.77 
 
 
371 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  45.77 
 
 
371 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  45.77 
 
 
371 aa  305  7e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  46.15 
 
 
331 aa  305  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  46.6 
 
 
332 aa  305  9.000000000000001e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  47.52 
 
 
378 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  42.74 
 
 
367 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  46.18 
 
 
368 aa  304  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  43.92 
 
 
371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2031  peptide chain release factor 2  44.84 
 
 
363 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0138456  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4200  peptide chain release factor 2  52.69 
 
 
323 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  44.71 
 
 
367 aa  303  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1243  peptide chain release factor 2  44.12 
 
 
371 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  44.71 
 
 
374 aa  302  5.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.777287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>