More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2879 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  741    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4162  peptide chain release factor 2  77.64 
 
 
317 aa  496  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.155408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3345  peptide chain release factor 2  77.32 
 
 
317 aa  488  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.219994  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1904  peptide chain release factor 2  59.76 
 
 
337 aa  417  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.430397  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  53.02 
 
 
367 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  57.78 
 
 
372 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  51.65 
 
 
367 aa  388  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  51.64 
 
 
366 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  51.25 
 
 
372 aa  382  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  52.73 
 
 
377 aa  384  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  51.71 
 
 
366 aa  384  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  56.21 
 
 
330 aa  381  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  49.59 
 
 
380 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  50 
 
 
362 aa  376  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  49.31 
 
 
380 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  49.04 
 
 
380 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  51.17 
 
 
356 aa  375  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  49.59 
 
 
380 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  50.83 
 
 
383 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  49.44 
 
 
357 aa  372  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  50.28 
 
 
368 aa  371  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  57.68 
 
 
330 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  49.86 
 
 
367 aa  370  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  49.18 
 
 
367 aa  369  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  48.85 
 
 
357 aa  365  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  53.04 
 
 
375 aa  366  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  54.09 
 
 
332 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  47.37 
 
 
362 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  46.58 
 
 
364 aa  364  1e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  48.14 
 
 
373 aa  364  1e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  52.39 
 
 
378 aa  360  3e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  51.24 
 
 
368 aa  360  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  53.54 
 
 
369 aa  360  3e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  48.62 
 
 
372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  51.52 
 
 
366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  50.16 
 
 
327 aa  353  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  51.09 
 
 
326 aa  353  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  51.09 
 
 
326 aa  353  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  51.09 
 
 
326 aa  353  4e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  52.16 
 
 
360 aa  351  8.999999999999999e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  47.93 
 
 
364 aa  351  1e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  48.75 
 
 
375 aa  350  2e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  49.72 
 
 
375 aa  349  4e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  50.96 
 
 
368 aa  349  5e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  50.42 
 
 
378 aa  348  6e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  47.12 
 
 
369 aa  348  8e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  50.16 
 
 
326 aa  347  1e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  51.75 
 
 
361 aa  346  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  47.47 
 
 
364 aa  343  2e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  50 
 
 
367 aa  343  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  49.44 
 
 
366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  44.88 
 
 
371 aa  342  4e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  49.03 
 
 
373 aa  342  4e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2401  peptide chain release factor 2  46.93 
 
 
371 aa  342  5e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0455309 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  44.04 
 
 
369 aa  342  9e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  47.92 
 
 
367 aa  341  1e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  49.59 
 
 
365 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  49.59 
 
 
375 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10410  peptide chain release factor 2  47.8 
 
 
370 aa  340  2.9999999999999998e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.232549  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  49.42 
 
 
349 aa  339  5e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  47.06 
 
 
369 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  49.42 
 
 
349 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  46.22 
 
 
365 aa  338  9.999999999999999e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1409  peptide chain release factor 2  54.43 
 
 
330 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0056831  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1243  peptide chain release factor 2  49.3 
 
 
371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1034  peptide chain release factor 2  48.02 
 
 
370 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  48.47 
 
 
334 aa  336  2.9999999999999997e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  47.19 
 
 
365 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  47.19 
 
 
365 aa  336  5e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  44.84 
 
 
371 aa  336  5e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  46.94 
 
 
365 aa  335  5.999999999999999e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0863  peptide chain release factor 2  48.35 
 
 
369 aa  335  5.999999999999999e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  47.22 
 
 
375 aa  335  5.999999999999999e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  46.59 
 
 
379 aa  335  5.999999999999999e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  46.94 
 
 
365 aa  335  7e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  46.94 
 
 
365 aa  335  7e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  50.44 
 
 
368 aa  335  7e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  46.94 
 
 
365 aa  335  7e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  48.06 
 
 
372 aa  335  9e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  48.75 
 
 
373 aa  334  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3456  peptide chain release factor 2  48.63 
 
 
371 aa  334  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  43.92 
 
 
367 aa  334  2e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  47.73 
 
 
374 aa  334  2e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.777287 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2666  peptide chain release factor 2  46.09 
 
 
371 aa  333  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1637  peptide chain release factor 2  51.66 
 
 
369 aa  333  3e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154678  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4451  peptide chain release factor 2  49.04 
 
 
372 aa  332  4e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  47.24 
 
 
372 aa  332  5e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  50.88 
 
 
356 aa  332  6e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  46.67 
 
 
365 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3025  peptide chain release factor 2  48.26 
 
 
371 aa  331  1e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  47.65 
 
 
364 aa  330  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0404  peptide chain release factor 2  55.44 
 
 
304 aa  330  2e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.660682  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  47.41 
 
 
375 aa  330  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07580  peptide chain release factor 2  46.54 
 
 
373 aa  330  2e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.932102  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  46.44 
 
 
372 aa  330  2e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  54.86 
 
 
330 aa  330  3e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  46.35 
 
 
365 aa  330  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1623  peptide chain release factor 2  47.96 
 
 
375 aa  329  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622299  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  46.35 
 
 
365 aa  329  4e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  47.5 
 
 
376 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>