More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2666 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2401  peptide chain release factor 2  93.5 
 
 
371 aa  709    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0455309 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2666  peptide chain release factor 2  100 
 
 
371 aa  754    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  79.39 
 
 
374 aa  590  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.777287 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1034  peptide chain release factor 2  77.78 
 
 
370 aa  586  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1243  peptide chain release factor 2  77.96 
 
 
371 aa  587  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07580  peptide chain release factor 2  74.93 
 
 
373 aa  581  1.0000000000000001e-165  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.932102  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25200  peptide chain release factor 2  77.32 
 
 
372 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0337024  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0863  peptide chain release factor 2  77.22 
 
 
369 aa  577  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20340  peptide chain release factor 2  75.14 
 
 
371 aa  569  1e-161  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10410  peptide chain release factor 2  70.92 
 
 
370 aa  557  1e-157  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.232549  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  68.89 
 
 
367 aa  527  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  68.19 
 
 
378 aa  527  1e-148  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0942  peptide chain release factor 2  67.3 
 
 
374 aa  512  1e-144  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0440008  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  66.67 
 
 
373 aa  508  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  66.12 
 
 
373 aa  504  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  65.57 
 
 
367 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  66.85 
 
 
371 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  66.85 
 
 
371 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  66.57 
 
 
371 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  64.38 
 
 
368 aa  494  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4451  peptide chain release factor 2  65.75 
 
 
372 aa  485  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1637  peptide chain release factor 2  66.11 
 
 
369 aa  484  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154678  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  66.02 
 
 
368 aa  487  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1233  peptide chain release factor 2  66.85 
 
 
370 aa  481  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  63.66 
 
 
368 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1264  peptide chain release factor 2  65.41 
 
 
375 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111402  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  61.05 
 
 
375 aa  463  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3025  peptide chain release factor 2  61.81 
 
 
371 aa  461  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  61.05 
 
 
378 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  60.83 
 
 
369 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3456  peptide chain release factor 2  60.6 
 
 
371 aa  454  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  59.39 
 
 
378 aa  454  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  60.77 
 
 
372 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13122  peptide chain release factor 2  63.76 
 
 
378 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.44652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  60.22 
 
 
372 aa  449  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1865  peptide chain release factor 2  63.32 
 
 
376 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00679931  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  58.97 
 
 
366 aa  427  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5798  peptide chain release factor 2  58.73 
 
 
386 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  50.15 
 
 
383 aa  334  1e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  46.09 
 
 
367 aa  333  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  43.85 
 
 
366 aa  328  1.0000000000000001e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  46.02 
 
 
369 aa  324  1e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  48.7 
 
 
366 aa  324  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  46.76 
 
 
369 aa  323  4e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  48.82 
 
 
356 aa  320  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  46.41 
 
 
366 aa  318  7e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  45.72 
 
 
357 aa  318  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  47.94 
 
 
356 aa  317  2e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  44.35 
 
 
373 aa  317  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  45.3 
 
 
377 aa  316  3e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  44.44 
 
 
368 aa  316  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  46.26 
 
 
372 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  44.19 
 
 
361 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  45.56 
 
 
372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  43.73 
 
 
367 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  45.38 
 
 
372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  45.08 
 
 
375 aa  312  5.999999999999999e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  47.22 
 
 
330 aa  310  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  46.15 
 
 
372 aa  309  4e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1904  peptide chain release factor 2  48.37 
 
 
337 aa  309  5e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.430397  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  43.61 
 
 
367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  45.34 
 
 
329 aa  308  1.0000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  44.66 
 
 
364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  44.21 
 
 
332 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  45.62 
 
 
362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  47.46 
 
 
378 aa  306  3e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  44.17 
 
 
367 aa  306  3e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  45.17 
 
 
357 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  46.58 
 
 
330 aa  305  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  45.31 
 
 
374 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  45.32 
 
 
364 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3345  peptide chain release factor 2  49.68 
 
 
317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.219994  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  43.03 
 
 
334 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  47.45 
 
 
356 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  46.08 
 
 
362 aa  302  5.000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  47.24 
 
 
369 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  46.25 
 
 
371 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  44.57 
 
 
367 aa  301  9e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0868  peptide chain release factor 2  46.96 
 
 
374 aa  301  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395021  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  48.76 
 
 
330 aa  301  2e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4162  peptide chain release factor 2  49.84 
 
 
317 aa  300  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.155408 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  42.57 
 
 
356 aa  299  6e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  46.36 
 
 
375 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  45.03 
 
 
379 aa  298  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  42.98 
 
 
375 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  42.98 
 
 
365 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  42.11 
 
 
367 aa  296  3e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4596  peptide chain release factor 2  45.45 
 
 
372 aa  296  3e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  45.37 
 
 
367 aa  296  3e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  43.87 
 
 
364 aa  296  6e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  45.65 
 
 
376 aa  295  8e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  43.91 
 
 
360 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  44.66 
 
 
402 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05470  peptide chain release factor 2  42.77 
 
 
364 aa  295  1e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01981  peptide chain release factor 2  45 
 
 
354 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0513147  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0182  peptide chain release factor 2  44.71 
 
 
354 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  44.13 
 
 
361 aa  292  7e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09020  peptide chain release factor 2  43.73 
 
 
369 aa  291  1e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.140459  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2977  peptide chain release factor 2  43.7 
 
 
375 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1856  peptide chain release factor 2  47.2 
 
 
375 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.892682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>