More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1762 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 369 aa  738    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  51.65 
 
 		 383 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  47.65 
 
 		 367 aa  361  1e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  52.79 
 
 		 366 aa  360  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  47.37 
 
 		 367 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  49.16 
 
 		 367 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  49.73 
 
 		 375 aa  355  5e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  47.47 
 
 		 364 aa  351  1e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  47.53 
 
 		 380 aa  351  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  47.25 
 
 		 380 aa  349  4e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  51.25 
 
 		 378 aa  348  8e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  46.98 
 
 		 380 aa  348  8e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  46.98 
 
 		 380 aa  348  8e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  51.08 
 
 		 331 aa  347  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  47.16 
 
 		 373 aa  347  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  46.81 
 
 		 366 aa  347  3e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1637  peptide chain release factor 2  50.7 
 
 		 369 aa  346  3e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154678  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  49.72 
 
 		 378 aa  345  6e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  47.34 
 
 		 372 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  51.69 
 
 		 330 aa  342  5.999999999999999e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  50.42 
 
 		 372 aa  342  9e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  47.37 
 
 		 367 aa  341  9e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  52.91 
 
 		 368 aa  339  5e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  47.9 
 
 		 357 aa  338  8e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  48.2 
 
 		 368 aa  338  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  49.05 
 
 		 372 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  49.59 
 
 		 367 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  49.23 
 
 		 327 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  48.35 
 
 		 371 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  48.35 
 
 		 371 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  46.58 
 
 		 366 aa  333  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  46.11 
 
 		 373 aa  333  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  48.35 
 
 		 371 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 		 332 aa  333  4e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  48.83 
 
 		 367 aa  333  4e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  45.48 
 
 		 369 aa  332  5e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  46.76 
 
 		 373 aa  332  6e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  50.93 
 
 		 330 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  47.49 
 
 		 372 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  49.84 
 
 		 326 aa  332  8e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  49.84 
 
 		 326 aa  332  8e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3456  peptide chain release factor 2  48.88 
 
 		 371 aa  332  8e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  49.16 
 
 		 368 aa  331  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  48.77 
 
 		 375 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  49.84 
 
 		 326 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  49.72 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  49.43 
 
 		 369 aa  331  2e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  47.92 
 
 		 372 aa  330  3e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  50.14 
 
 		 366 aa  330  3e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  45.4 
 
 		 362 aa  330  3e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  51.25 
 
 		 332 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 326 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  49.25 
 
 		 367 aa  329  6e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  48.34 
 
 		 375 aa  328  8e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1233  peptide chain release factor 2  52.31 
 
 		 370 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 		 344 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  49.02 
 
 		 374 aa  326  4.0000000000000003e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.777287 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  48.32 
 
 		 377 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  44.83 
 
 		 364 aa  326  4.0000000000000003e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4451  peptide chain release factor 2  47.53 
 
 		 372 aa  326  5e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3025  peptide chain release factor 2  46.07 
 
 		 371 aa  325  6e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  50.14 
 
 		 378 aa  325  6e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  48.71 
 
 		 364 aa  325  7e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  48.47 
 
 		 376 aa  324  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  46.13 
 
 		 376 aa  321  9.999999999999999e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  44.88 
 
 		 371 aa  321  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  48.31 
 
 		 341 aa  320  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  45.84 
 
 		 371 aa  320  3e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  46.67 
 
 		 376 aa  319  5e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  48.93 
 
 		 356 aa  319  6e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  45.43 
 
 		 369 aa  318  7e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  44.08 
 
 		 371 aa  318  9e-86  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0863  peptide chain release factor 2  47.79 
 
 		 369 aa  318  1e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  50.62 
 
 		 330 aa  318  1e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  47.35 
 
 		 375 aa  317  2e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  47.31 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  47.59 
 
 		 332 aa  317  2e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  42.82 
 
 		 369 aa  317  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1243  peptide chain release factor 2  48.25 
 
 		 371 aa  315  6e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  49.38 
 
 		 329 aa  315  6e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1865  peptide chain release factor 2  47.41 
 
 		 376 aa  315  7e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00679931  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  46.33 
 
 		 369 aa  315  7e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10410  peptide chain release factor 2  45.3 
 
 		 370 aa  315  8e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.232549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2265  peptide chain release factor 2  52.48 
 
 		 321 aa  314  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05470  peptide chain release factor 2  45.3 
 
 		 364 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  47.94 
 
 		 364 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  45.83 
 
 		 368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4596  peptide chain release factor 2  48.01 
 
 		 372 aa  313  3.9999999999999997e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  53.09 
 
 		 322 aa  312  4.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0961  peptide chain release factor 2  49.23 
 
 		 342 aa  312  5.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  hitchhiker  0.00626958 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  46.88 
 
 		 343 aa  312  5.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  48.93 
 
 		 356 aa  312  6.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  45.14 
 
 		 372 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  47.88 
 
 		 374 aa  311  7.999999999999999e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  49.54 
 
 		 376 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  46.22 
 
 		 378 aa  311  9e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1305  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 		 376 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  48.82 
 
 		 354 aa  311  1e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  47.66 
 
 		 334 aa  311  1e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07580  peptide chain release factor 2  45.32 
 
 		 373 aa  311  1e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.932102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>