More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1732 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  100 
 
 
369 aa  749    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  73.64 
 
 
375 aa  566  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  73.55 
 
 
378 aa  551  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  72.45 
 
 
378 aa  548  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  72.73 
 
 
372 aa  549  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  69.42 
 
 
368 aa  531  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  68.75 
 
 
372 aa  527  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  68.12 
 
 
373 aa  518  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  69.15 
 
 
367 aa  516  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  67.57 
 
 
373 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1233  peptide chain release factor 2  71.79 
 
 
370 aa  512  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1637  peptide chain release factor 2  67.88 
 
 
369 aa  501  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154678  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  66.2 
 
 
367 aa  497  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  68.91 
 
 
368 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4451  peptide chain release factor 2  65.04 
 
 
372 aa  489  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3456  peptide chain release factor 2  65.57 
 
 
371 aa  484  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  63.78 
 
 
371 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  63.78 
 
 
371 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  63.78 
 
 
371 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  63.76 
 
 
368 aa  484  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10410  peptide chain release factor 2  61.1 
 
 
370 aa  479  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.232549  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1034  peptide chain release factor 2  63.74 
 
 
370 aa  475  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3025  peptide chain release factor 2  62.84 
 
 
371 aa  475  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0863  peptide chain release factor 2  65.53 
 
 
369 aa  475  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  66.76 
 
 
366 aa  477  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2401  peptide chain release factor 2  64.53 
 
 
371 aa  472  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0455309 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  60.38 
 
 
378 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  64.39 
 
 
374 aa  468  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.777287 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1243  peptide chain release factor 2  62.13 
 
 
371 aa  466  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2666  peptide chain release factor 2  61.16 
 
 
371 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1865  peptide chain release factor 2  65.94 
 
 
376 aa  464  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00679931  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13122  peptide chain release factor 2  65.55 
 
 
378 aa  455  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.44652 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20340  peptide chain release factor 2  59.29 
 
 
371 aa  456  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0942  peptide chain release factor 2  62.32 
 
 
374 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0440008  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25200  peptide chain release factor 2  59.62 
 
 
372 aa  450  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0337024  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5798  peptide chain release factor 2  66.94 
 
 
386 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07580  peptide chain release factor 2  59.4 
 
 
373 aa  446  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.932102  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1264  peptide chain release factor 2  61.54 
 
 
375 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111402  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  50.82 
 
 
383 aa  364  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  53.37 
 
 
367 aa  361  1e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  50.83 
 
 
366 aa  354  1e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  48.47 
 
 
362 aa  353  4e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  49.57 
 
 
368 aa  350  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  48.19 
 
 
364 aa  350  3e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  48.73 
 
 
367 aa  343  4e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  52.15 
 
 
330 aa  342  5.999999999999999e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  51.8 
 
 
377 aa  341  1e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  50.29 
 
 
356 aa  339  4e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  49 
 
 
372 aa  339  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  49.44 
 
 
372 aa  338  7e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  49.12 
 
 
356 aa  335  7e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  47.4 
 
 
372 aa  335  9e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  46.45 
 
 
357 aa  334  1e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  46.2 
 
 
366 aa  332  5e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  48.42 
 
 
371 aa  330  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  50.92 
 
 
369 aa  331  2e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  45.82 
 
 
373 aa  330  3e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  46.76 
 
 
369 aa  327  2.0000000000000001e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  47.89 
 
 
367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  49.56 
 
 
364 aa  327  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  48.85 
 
 
378 aa  326  5e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  43.91 
 
 
369 aa  325  7e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  46 
 
 
366 aa  325  7e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1904  peptide chain release factor 2  51.95 
 
 
337 aa  323  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.430397  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  46.22 
 
 
361 aa  322  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  48.61 
 
 
341 aa  322  7e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  46.26 
 
 
362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  49.12 
 
 
375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  45.99 
 
 
356 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  49.02 
 
 
372 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  43.98 
 
 
380 aa  319  5e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  44.63 
 
 
375 aa  319  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  44.63 
 
 
365 aa  318  7e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  51.55 
 
 
330 aa  318  1e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  46.92 
 
 
376 aa  318  1e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  48 
 
 
331 aa  318  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  51.23 
 
 
340 aa  318  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  46.63 
 
 
360 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  45.17 
 
 
367 aa  317  2e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3345  peptide chain release factor 2  52.87 
 
 
317 aa  317  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.219994  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  47.35 
 
 
376 aa  316  5e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  43.7 
 
 
380 aa  316  5e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  43.98 
 
 
380 aa  315  6e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  46.24 
 
 
356 aa  315  6e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  43.98 
 
 
380 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  46.53 
 
 
357 aa  314  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  53.74 
 
 
317 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  47.55 
 
 
330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  45.71 
 
 
375 aa  314  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  48.84 
 
 
361 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  43.43 
 
 
367 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  42.57 
 
 
367 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4162  peptide chain release factor 2  53.25 
 
 
317 aa  311  7.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.155408 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  47.19 
 
 
332 aa  311  9e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  45.2 
 
 
375 aa  311  1e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4596  peptide chain release factor 2  47.59 
 
 
372 aa  310  2.9999999999999997e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  44.31 
 
 
334 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  44.94 
 
 
374 aa  309  4e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  52.96 
 
 
322 aa  308  8e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  44.76 
 
 
364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>