More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0864 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  100 
 
 
366 aa  748    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  57.69 
 
 
367 aa  456  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  58.24 
 
 
367 aa  457  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  59.02 
 
 
369 aa  441  1e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  56.98 
 
 
364 aa  441  9.999999999999999e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  56.55 
 
 
366 aa  411  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  55.87 
 
 
367 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  56.56 
 
 
369 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  55.59 
 
 
372 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  56.84 
 
 
332 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  54.2 
 
 
373 aa  392  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  53.11 
 
 
383 aa  390  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  57.89 
 
 
330 aa  386  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  53.46 
 
 
380 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  51.85 
 
 
362 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  54.85 
 
 
367 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  53.35 
 
 
380 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  51.71 
 
 
367 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  53.19 
 
 
380 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  52.14 
 
 
366 aa  382  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  51.11 
 
 
364 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  52.91 
 
 
380 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  51.27 
 
 
377 aa  380  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  52.75 
 
 
357 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  57.36 
 
 
327 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  58.2 
 
 
331 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  55.01 
 
 
375 aa  379  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  57.67 
 
 
326 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  57.98 
 
 
326 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  57.98 
 
 
326 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  57.36 
 
 
326 aa  375  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  56.92 
 
 
330 aa  375  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  49.72 
 
 
372 aa  375  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  56.53 
 
 
330 aa  373  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  55.8 
 
 
332 aa  369  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  52.4 
 
 
334 aa  368  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  49.01 
 
 
372 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  53.67 
 
 
349 aa  365  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  53.96 
 
 
349 aa  365  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  49.56 
 
 
365 aa  364  1e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  49.72 
 
 
379 aa  364  1e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  49.58 
 
 
368 aa  364  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2216  peptide chain release factor 2 (bRF-2)  55.99 
 
 
344 aa  363  3e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00549966  hitchhiker  0.00000471368 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  50.42 
 
 
367 aa  361  1e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  49.44 
 
 
371 aa  359  3e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  51.96 
 
 
337 aa  359  4e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  49.58 
 
 
367 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  50.99 
 
 
365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  50.99 
 
 
365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  50.99 
 
 
365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  50.99 
 
 
365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  50 
 
 
372 aa  356  2.9999999999999997e-97  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  48.32 
 
 
369 aa  357  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  47.77 
 
 
378 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  50.99 
 
 
365 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  51.12 
 
 
365 aa  355  5.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  49.55 
 
 
364 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  48.59 
 
 
364 aa  355  7.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  48.15 
 
 
371 aa  354  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  50.14 
 
 
365 aa  353  2e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  50.42 
 
 
365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  50.28 
 
 
365 aa  352  5e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  48.31 
 
 
364 aa  352  5e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  53.56 
 
 
326 aa  352  7e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  50.56 
 
 
365 aa  351  1e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  49.72 
 
 
375 aa  350  2e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  49.72 
 
 
375 aa  350  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  49.72 
 
 
365 aa  350  3e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 
356 aa  349  5e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  52.01 
 
 
331 aa  348  7e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  49 
 
 
362 aa  347  2e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  50.14 
 
 
365 aa  347  2e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  49.25 
 
 
357 aa  347  2e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  51.57 
 
 
332 aa  347  2e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  54.46 
 
 
312 aa  347  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  52.78 
 
 
325 aa  345  8e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  48.61 
 
 
402 aa  345  8e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  47.04 
 
 
372 aa  344  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  49.71 
 
 
354 aa  344  1e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  47.49 
 
 
378 aa  344  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  50.44 
 
 
354 aa  343  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  48.34 
 
 
371 aa  344  2e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  48.58 
 
 
376 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  48.42 
 
 
368 aa  342  5e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  50.92 
 
 
344 aa  342  7e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  48.44 
 
 
367 aa  342  9e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  46.29 
 
 
367 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  46.29 
 
 
367 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  45.98 
 
 
371 aa  340  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1305  peptide chain release factor 2  48.86 
 
 
376 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  46.29 
 
 
367 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  53.67 
 
 
323 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  46.58 
 
 
364 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1409  peptide chain release factor 2  57.14 
 
 
330 aa  339  4e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0056831  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  49.69 
 
 
329 aa  339  4e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  46 
 
 
459 aa  339  5e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  47.06 
 
 
375 aa  339  5e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0500  peptide chain release factor 2  47.51 
 
 
364 aa  339  5e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  48.3 
 
 
376 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  46.92 
 
 
391 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.215067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>