More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4980 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  97.55 
 
 		 380 aa  667    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  97.24 
 
 		 326 aa  661    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  97.55 
 
 		 326 aa  663    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  97.55 
 
 		 326 aa  663    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  96.01 
 
 		 327 aa  660    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  97.24 
 
 		 380 aa  665    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 326 aa  680    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  97.55 
 
 		 380 aa  665    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  97.55 
 
 		 380 aa  667    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  80.06 
 
 		 367 aa  559  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  80.67 
 
 		 367 aa  552  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  69.75 
 
 		 369 aa  481  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  69.75 
 
 		 331 aa  480  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  69.72 
 
 		 371 aa  473  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  67.9 
 
 		 383 aa  462  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  60.99 
 
 		 332 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  61.32 
 
 		 372 aa  422  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  60.25 
 
 		 366 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  60.25 
 
 		 330 aa  411  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  59.69 
 
 		 330 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  58.33 
 
 		 362 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  60.5 
 
 		 368 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  58.33 
 
 		 364 aa  404  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  58.68 
 
 		 373 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  56.92 
 
 		 365 aa  395  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  58.28 
 
 		 332 aa  397  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  57.59 
 
 		 332 aa  393  1e-108  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  57.68 
 
 		 357 aa  388  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  56.66 
 
 		 377 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  59.38 
 
 		 331 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  57.28 
 
 		 367 aa  381  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  58.99 
 
 		 364 aa  384  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  55.59 
 
 		 367 aa  379  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  54.43 
 
 		 372 aa  380  1e-104  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  55.25 
 
 		 372 aa  381  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  57.36 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  58.26 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  55.28 
 
 		 369 aa  376  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  54.26 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  55.76 
 
 		 337 aa  366  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  58.99 
 
 		 330 aa  364  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  54.6 
 
 		 375 aa  364  1e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  56.04 
 
 		 369 aa  363  2e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2216  peptide chain release factor 2 (bRF-2)  58.1 
 
 		 344 aa  360  1e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00549966  hitchhiker  0.00000471368 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  53.7 
 
 		 326 aa  360  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0257  peptide chain release factor 2  57.23 
 
 		 333 aa  358  9e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000258105  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  53.29 
 
 		 374 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  51.55 
 
 		 372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  51.08 
 
 		 329 aa  355  5.999999999999999e-97  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  51.99 
 
 		 341 aa  355  5.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  52.96 
 
 		 379 aa  353  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  50.16 
 
 		 367 aa  347  1e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  52.65 
 
 		 375 aa  347  1e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  52.17 
 
 		 375 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  51.86 
 
 		 364 aa  346  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  51.39 
 
 		 372 aa  346  4e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  53.56 
 
 		 361 aa  345  5e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  52.83 
 
 		 371 aa  344  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  51.09 
 
 		 376 aa  344  1e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  50.63 
 
 		 371 aa  344  1e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1409  peptide chain release factor 2  53.48 
 
 		 330 aa  344  1e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0056831  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  52.05 
 
 		 364 aa  343  2e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  52.63 
 
 		 367 aa  343  2e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  51.4 
 
 		 367 aa  342  7e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  49.84 
 
 		 376 aa  340  2e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  53.27 
 
 		 375 aa  340  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1938  hypothetical protein  50.16 
 
 		 370 aa  339  5e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374727  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  53.2 
 
 		 312 aa  338  5e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1805  peptide chain release factor 2  50.63 
 
 		 358 aa  338  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.361195  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  51.39 
 
 		 365 aa  337  9.999999999999999e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2265  peptide chain release factor 2  52.58 
 
 		 321 aa  337  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  52.05 
 
 		 371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  52.83 
 
 		 340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5845  peptide chain release factor 2  53.27 
 
 		 321 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  52.76 
 
 		 366 aa  335  5.999999999999999e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  49.1 
 
 		 371 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  51.71 
 
 		 376 aa  335  9e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  50.62 
 
 		 343 aa  333  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  50.31 
 
 		 344 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  50.31 
 
 		 376 aa  332  4e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  52.52 
 
 		 322 aa  332  5e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  50.47 
 
 		 362 aa  332  6e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  50.49 
 
 		 317 aa  331  9e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  51.26 
 
 		 369 aa  330  2e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  49.69 
 
 		 369 aa  330  2e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1305  peptide chain release factor 2  52.34 
 
 		 376 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3166  peptide chain release factor 2  51.94 
 
 		 321 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 369 aa  328  6e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  49.53 
 
 		 356 aa  328  8e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2982  peptide chain release factor 2  51.94 
 
 		 321 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.186364  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3208  peptide chain release factor 2  51.94 
 
 		 321 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2575  peptide chain release factor 2  48.6 
 
 		 367 aa  326  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  48.58 
 
 		 417 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  49.21 
 
 		 459 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  49.06 
 
 		 361 aa  325  5e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  50.46 
 
 		 375 aa  325  6e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  52.37 
 
 		 372 aa  325  6e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2031  peptide chain release factor 2  51.74 
 
 		 363 aa  325  7e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0138456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0584  peptide chain release factor 2  51.1 
 
 		 366 aa  323  2e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  51.28 
 
 		 322 aa  323  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>