More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1031 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 379 aa  780    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  56.98 
 
 		 372 aa  422  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  56.18 
 
 		 367 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  56.18 
 
 		 367 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  56.18 
 
 		 367 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  55.65 
 
 		 459 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  55.8 
 
 		 375 aa  413  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  57.02 
 
 		 354 aa  412  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  56.51 
 
 		 367 aa  413  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  57.56 
 
 		 391 aa  408  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  57.56 
 
 		 391 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  57.56 
 
 		 391 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  57.56 
 
 		 391 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  55.4 
 
 		 371 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  56.7 
 
 		 367 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  54.7 
 
 		 376 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  53.31 
 
 		 375 aa  402  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  56.98 
 
 		 406 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  53.87 
 
 		 375 aa  402  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  56.42 
 
 		 367 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  56.98 
 
 		 359 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  55.88 
 
 		 364 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  53.59 
 
 		 375 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2773  peptide chain release factor 2  56.69 
 
 		 355 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  56.94 
 
 		 364 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  54.14 
 
 		 365 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  55.52 
 
 		 417 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  56.73 
 
 		 365 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2844  peptide chain release factor 2  58.15 
 
 		 325 aa  395  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  55.99 
 
 		 375 aa  395  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  53.63 
 
 		 376 aa  395  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  54.14 
 
 		 365 aa  396  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  54.14 
 
 		 365 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  53.87 
 
 		 365 aa  394  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  55.85 
 
 		 364 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  54.14 
 
 		 365 aa  394  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  53.31 
 
 		 365 aa  394  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  55.85 
 
 		 365 aa  390  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  54.49 
 
 		 365 aa  389  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2758  peptide chain release factor 2  53.89 
 
 		 367 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  55.56 
 
 		 357 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  55.52 
 
 		 349 aa  388  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2248  hypothetical protein  53.89 
 
 		 367 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  52.76 
 
 		 365 aa  388  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  52.22 
 
 		 367 aa  390  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  56.08 
 
 		 364 aa  389  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  52.49 
 
 		 365 aa  388  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  55.85 
 
 		 357 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  54.76 
 
 		 349 aa  390  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  54.65 
 
 		 349 aa  387  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1437  peptide chain release factor 2  55.26 
 
 		 382 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  52.76 
 
 		 365 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0725  peptide chain release factor 2  56.53 
 
 		 332 aa  387  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159955  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2274  peptide chain release factor 2  59.15 
 
 		 310 aa  387  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  51.93 
 
 		 365 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1216  peptide chain release factor 2  57.02 
 
 		 347 aa  387  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000777998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  52.79 
 
 		 376 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3791  hypothetical protein  55.78 
 
 		 367 aa  388  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  52.08 
 
 		 367 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  51.09 
 
 		 375 aa  385  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  56.01 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1305  peptide chain release factor 2  54.55 
 
 		 376 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  53.94 
 
 		 373 aa  382  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  55.59 
 
 		 349 aa  384  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  50.55 
 
 		 369 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2977  peptide chain release factor 2  52.35 
 
 		 375 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  51.93 
 
 		 376 aa  383  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1069  peptide chain release factor 2  54.36 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3371  peptide chain release factor 2  54.39 
 
 		 378 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  55.29 
 
 		 349 aa  382  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  56.33 
 
 		 344 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  58.65 
 
 		 322 aa  381  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  55.3 
 
 		 374 aa  382  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  58.62 
 
 		 325 aa  383  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  53.21 
 
 		 376 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  58.63 
 
 		 317 aa  381  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2040  peptide chain release factor 2  58.65 
 
 		 322 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2575  peptide chain release factor 2  52.91 
 
 		 367 aa  378  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1856  peptide chain release factor 2  50.53 
 
 		 375 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1623  peptide chain release factor 2  52.35 
 
 		 375 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622299  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  51.25 
 
 		 371 aa  377  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  50.56 
 
 		 380 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  50.83 
 
 		 380 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  50.56 
 
 		 380 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  57.05 
 
 		 326 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1151  peptide chain release factor 2  54.97 
 
 		 381 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  50.56 
 
 		 380 aa  376  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  56.06 
 
 		 340 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  56.14 
 
 		 354 aa  375  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16510  putative peptide chain release factor 2  56.35 
 
 		 332 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  53.33 
 
 		 369 aa  377  1e-103  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  51.52 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2271  peptide chain release factor 2  60.2 
 
 		 310 aa  378  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  52.16 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3265  peptide chain release factor 2  53.51 
 
 		 386 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  hitchhiker  0.000000190914 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  50.57 
 
 		 365 aa  375  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  58.2 
 
 		 323 aa  374  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  59.11 
 
 		 322 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  51.39 
 
 		 367 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1766  peptide chain release factor 2  62.33 
 
 		 300 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.015531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>