More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2575 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2575  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 367 aa  746    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  64.91 
 
 		 376 aa  466  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  64.33 
 
 		 376 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  62.87 
 
 		 375 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  63.79 
 
 		 376 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  61.52 
 
 		 375 aa  444  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  62.24 
 
 		 344 aa  441  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  60.82 
 
 		 375 aa  443  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  64.14 
 
 		 375 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  63.56 
 
 		 375 aa  433  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1305  peptide chain release factor 2  63.16 
 
 		 376 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  59.65 
 
 		 376 aa  430  1e-119  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  62.17 
 
 		 376 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  59.65 
 
 		 375 aa  428  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  65.18 
 
 		 323 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2040  peptide chain release factor 2  64.76 
 
 		 322 aa  424  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2977  peptide chain release factor 2  59.71 
 
 		 375 aa  421  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1623  peptide chain release factor 2  60 
 
 		 375 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622299  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  68.28 
 
 		 322 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4200  peptide chain release factor 2  64.42 
 
 		 323 aa  418  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0868  peptide chain release factor 2  59.36 
 
 		 374 aa  418  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1856  peptide chain release factor 2  59.13 
 
 		 375 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1715  peptide chain release factor 2  64.74 
 
 		 322 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.833664  normal  0.278616 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  63.49 
 
 		 322 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3208  peptide chain release factor 2  65.05 
 
 		 321 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3166  peptide chain release factor 2  64.72 
 
 		 321 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1825  peptide chain release factor 2  64.29 
 
 		 322 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0961  peptide chain release factor 2  61.31 
 
 		 342 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  hitchhiker  0.00626958 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  60.23 
 
 		 402 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2773  peptide chain release factor 2  57.18 
 
 		 355 aa  414  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2982  peptide chain release factor 2  65.05 
 
 		 321 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.186364  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2851  peptide chain release factor 2  65.06 
 
 		 322 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5845  peptide chain release factor 2  63.43 
 
 		 321 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3006  peptide chain release factor 2  64.1 
 
 		 322 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.743846  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5077  peptide chain release factor 2  64.08 
 
 		 321 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30933  normal  0.0341665 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2445  peptide chain release factor 2  63.78 
 
 		 322 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.689282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  55.65 
 
 		 406 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3265  peptide chain release factor 2  56.85 
 
 		 386 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  hitchhiker  0.000000190914 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2248  hypothetical protein  57.6 
 
 		 367 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  55.36 
 
 		 391 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  55.36 
 
 		 391 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2533  peptide chain release factor 2  58.55 
 
 		 375 aa  400  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  55.36 
 
 		 391 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1299  peptide chain release factor 2  67.92 
 
 		 321 aa  398  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0921443  normal  0.567483 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2265  peptide chain release factor 2  60.19 
 
 		 321 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  55.36 
 
 		 391 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2758  peptide chain release factor 2  57.6 
 
 		 367 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1069  peptide chain release factor 2  56.36 
 
 		 347 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  54.65 
 
 		 367 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  54.65 
 
 		 367 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  54.84 
 
 		 349 aa  392  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  54.84 
 
 		 349 aa  392  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1151  peptide chain release factor 2  55.06 
 
 		 381 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  53.53 
 
 		 365 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  52.53 
 
 		 365 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  53.82 
 
 		 365 aa  391  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  52.53 
 
 		 365 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  53.91 
 
 		 349 aa  390  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  54.36 
 
 		 459 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  54.2 
 
 		 349 aa  390  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  52.53 
 
 		 365 aa  389  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  53.82 
 
 		 365 aa  391  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  54.36 
 
 		 367 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3371  peptide chain release factor 2  53.94 
 
 		 378 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518428  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  52.25 
 
 		 365 aa  388  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  54.39 
 
 		 367 aa  386  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  52.25 
 
 		 365 aa  385  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4671  peptide chain release factor 2  62.99 
 
 		 322 aa  388  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  53.24 
 
 		 365 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  53.53 
 
 		 365 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1437  peptide chain release factor 2  53.12 
 
 		 382 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  52.31 
 
 		 359 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  52.77 
 
 		 357 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  51.41 
 
 		 354 aa  384  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  53.06 
 
 		 357 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3791  hypothetical protein  55.2 
 
 		 367 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  53.04 
 
 		 417 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  53.24 
 
 		 365 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  53.82 
 
 		 365 aa  379  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2844  peptide chain release factor 2  56.13 
 
 		 325 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  54.34 
 
 		 349 aa  380  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0725  peptide chain release factor 2  53.21 
 
 		 332 aa  381  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159955  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1216  peptide chain release factor 2  53.94 
 
 		 347 aa  376  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000777998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0840  peptide chain release factor 2  53.74 
 
 		 352 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  54.09 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  54.39 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0939  hypothetical protein  53.24 
 
 		 365 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2878  peptide chain release factor 2  55.23 
 
 		 364 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  51.74 
 
 		 364 aa  371  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1310  peptide chain release factor 2  53.05 
 
 		 329 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.496606  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16510  putative peptide chain release factor 2  53.5 
 
 		 332 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  52.91 
 
 		 379 aa  371  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  50.72 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3297  peptide chain release factor 2  53.08 
 
 		 352 aa  365  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  54.41 
 
 		 374 aa  368  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  51.76 
 
 		 365 aa  363  2e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0826  peptide chain release factor 2  52.79 
 
 		 352 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0335049 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3197  peptide chain release factor 2  52.79 
 
 		 352 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.710234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3128  peptide chain release factor 2  53.37 
 
 		 352 aa  362  6e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0150596  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3615  peptide chain release factor 2  53.37 
 
 		 352 aa  361  9e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.927758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>