More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3208 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2982  peptide chain release factor 2  100 
 
 
321 aa  660    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.186364  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3166  peptide chain release factor 2  97.51 
 
 
321 aa  646    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3208  peptide chain release factor 2  100 
 
 
321 aa  660    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5077  peptide chain release factor 2  95.02 
 
 
321 aa  610  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30933  normal  0.0341665 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5845  peptide chain release factor 2  87.85 
 
 
321 aa  587  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  87.23 
 
 
375 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  77.32 
 
 
376 aa  504  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  76.16 
 
 
322 aa  501  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  74.14 
 
 
344 aa  500  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  77.33 
 
 
376 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1305  peptide chain release factor 2  78.85 
 
 
376 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  72.05 
 
 
376 aa  487  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  74.14 
 
 
322 aa  481  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  70.4 
 
 
375 aa  479  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0961  peptide chain release factor 2  74.92 
 
 
342 aa  478  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  hitchhiker  0.00626958 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2265  peptide chain release factor 2  68.85 
 
 
321 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4200  peptide chain release factor 2  69.35 
 
 
323 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  71.03 
 
 
376 aa  463  1e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  70.72 
 
 
375 aa  460  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1825  peptide chain release factor 2  70.51 
 
 
322 aa  456  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1715  peptide chain release factor 2  70.83 
 
 
322 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.833664  normal  0.278616 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2040  peptide chain release factor 2  66.88 
 
 
322 aa  447  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  67.29 
 
 
375 aa  448  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4671  peptide chain release factor 2  68.63 
 
 
322 aa  450  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3006  peptide chain release factor 2  69.25 
 
 
322 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.743846  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2445  peptide chain release factor 2  69.25 
 
 
322 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.689282  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  68.32 
 
 
376 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  67.6 
 
 
375 aa  441  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2851  peptide chain release factor 2  68.01 
 
 
322 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205155  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  65.16 
 
 
323 aa  427  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1623  peptide chain release factor 2  64.33 
 
 
375 aa  411  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622299  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2575  peptide chain release factor 2  65.05 
 
 
367 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2977  peptide chain release factor 2  64.33 
 
 
375 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1856  peptide chain release factor 2  63.69 
 
 
375 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  63.69 
 
 
402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  61.78 
 
 
375 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0868  peptide chain release factor 2  60.19 
 
 
374 aa  379  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395021  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1299  peptide chain release factor 2  60.87 
 
 
321 aa  374  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0921443  normal  0.567483 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  57.01 
 
 
372 aa  368  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2533  peptide chain release factor 2  60.19 
 
 
375 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  55.8 
 
 
364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  54.58 
 
 
317 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  56.09 
 
 
379 aa  356  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4122  peptide chain release factor 2  56.29 
 
 
304 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  57.19 
 
 
326 aa  354  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4227  peptide chain release factor 2  56.95 
 
 
304 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358427  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  56.07 
 
 
349 aa  353  2e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2274  peptide chain release factor 2  55.34 
 
 
310 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3371  peptide chain release factor 2  56.68 
 
 
378 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518428  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  55.74 
 
 
349 aa  351  1e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1437  peptide chain release factor 2  55.7 
 
 
382 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  56.44 
 
 
371 aa  350  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2271  peptide chain release factor 2  55.41 
 
 
310 aa  350  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  55.08 
 
 
365 aa  349  4e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1100  peptide chain release factor 2  57.28 
 
 
304 aa  349  4e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16510  putative peptide chain release factor 2  56.03 
 
 
332 aa  349  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  54.05 
 
 
367 aa  348  6e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  54.05 
 
 
367 aa  348  6e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  53.72 
 
 
417 aa  348  6e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  54.05 
 
 
367 aa  348  6e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  55.74 
 
 
364 aa  347  1e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  53.09 
 
 
357 aa  345  5e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  53.72 
 
 
349 aa  345  5e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2844  peptide chain release factor 2  53.07 
 
 
325 aa  345  6e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  54.43 
 
 
365 aa  345  6e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  55.13 
 
 
367 aa  345  7e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  57.43 
 
 
366 aa  345  7e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  53.4 
 
 
459 aa  343  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  53.09 
 
 
357 aa  343  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  53.72 
 
 
406 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  54.75 
 
 
364 aa  342  4e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1310  peptide chain release factor 2  54.72 
 
 
329 aa  342  5e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.496606  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  54.43 
 
 
365 aa  341  8e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  54.43 
 
 
365 aa  341  8e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  54.43 
 
 
365 aa  341  8e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  54.43 
 
 
365 aa  341  8e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  53.77 
 
 
325 aa  341  9e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  54.43 
 
 
365 aa  341  9e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1030  peptide chain release factor 2 protein  55 
 
 
300 aa  341  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235991  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  54.05 
 
 
367 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  53.4 
 
 
391 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  53.4 
 
 
391 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  53.4 
 
 
391 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  53.72 
 
 
367 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  56.13 
 
 
375 aa  340  2.9999999999999998e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  53.07 
 
 
391 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  54.05 
 
 
354 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  53.11 
 
 
365 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1500  hypothetical protein  57.29 
 
 
293 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  54.43 
 
 
365 aa  336  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  56.11 
 
 
366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0923  peptide chain release factor 2  54.43 
 
 
310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  54.1 
 
 
365 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0456  peptide chain release factor 2  54.43 
 
 
338 aa  336  2.9999999999999997e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.454858  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  54.46 
 
 
340 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0350  peptide chain release factor 2  49.68 
 
 
335 aa  335  5e-91  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  54.1 
 
 
365 aa  335  7.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0705  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  50.16 
 
 
366 aa  335  7.999999999999999e-91  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0793  peptide chain release factor 2  54.1 
 
 
331 aa  334  1e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  53.77 
 
 
365 aa  334  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>