More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1715 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1715  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 322 aa  659    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.833664  normal  0.278616 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1825  peptide chain release factor 2  93.48 
 
 		 322 aa  609  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4200  peptide chain release factor 2  91.02 
 
 		 323 aa  610  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3006  peptide chain release factor 2  90.68 
 
 		 322 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.743846  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  89.13 
 
 		 376 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2851  peptide chain release factor 2  89.13 
 
 		 322 aa  557  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2445  peptide chain release factor 2  88.82 
 
 		 322 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.689282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4671  peptide chain release factor 2  73.6 
 
 		 322 aa  480  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  67.7 
 
 		 322 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3166  peptide chain release factor 2  70.83 
 
 		 321 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2982  peptide chain release factor 2  70.83 
 
 		 321 aa  463  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.186364  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3208  peptide chain release factor 2  70.83 
 
 		 321 aa  463  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  68.01 
 
 		 344 aa  456  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  66.77 
 
 		 375 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5845  peptide chain release factor 2  66.46 
 
 		 321 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2040  peptide chain release factor 2  67.63 
 
 		 322 aa  448  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  66.77 
 
 		 376 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5077  peptide chain release factor 2  68.94 
 
 		 321 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30933  normal  0.0341665 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  65.53 
 
 		 376 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  69.25 
 
 		 376 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  68.01 
 
 		 322 aa  436  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2265  peptide chain release factor 2  64.42 
 
 		 321 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  64.74 
 
 		 375 aa  432  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0961  peptide chain release factor 2  66.36 
 
 		 342 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  hitchhiker  0.00626958 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1305  peptide chain release factor 2  69.87 
 
 		 376 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  65.11 
 
 		 376 aa  427  1e-118  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2575  peptide chain release factor 2  65.29 
 
 		 367 aa  418  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  63.9 
 
 		 323 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  63.19 
 
 		 402 aa  401  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1623  peptide chain release factor 2  61.46 
 
 		 375 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622299  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2977  peptide chain release factor 2  61.46 
 
 		 375 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  60.19 
 
 		 375 aa  393  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  60.9 
 
 		 375 aa  394  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  61.18 
 
 		 375 aa  392  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  61.49 
 
 		 375 aa  394  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1856  peptide chain release factor 2  60.83 
 
 		 375 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1299  peptide chain release factor 2  64.24 
 
 		 321 aa  391  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0921443  normal  0.567483 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0868  peptide chain release factor 2  57.96 
 
 		 374 aa  375  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  55.13 
 
 		 379 aa  357  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  56.86 
 
 		 372 aa  355  3.9999999999999996e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2533  peptide chain release factor 2  58.28 
 
 		 375 aa  354  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2274  peptide chain release factor 2  53.09 
 
 		 310 aa  352  5e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  56.21 
 
 		 326 aa  347  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  54.1 
 
 		 365 aa  346  3e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  53.42 
 
 		 367 aa  346  3e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0705  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  49.68 
 
 		 366 aa  346  3e-94  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  54.1 
 
 		 365 aa  346  4e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  54.1 
 
 		 365 aa  346  4e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  54.1 
 
 		 365 aa  345  4e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  54.1 
 
 		 365 aa  346  4e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  53.27 
 
 		 317 aa  345  7e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2844  peptide chain release factor 2  54.4 
 
 		 325 aa  344  1e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2271  peptide chain release factor 2  54.43 
 
 		 310 aa  344  1e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  54.43 
 
 		 365 aa  343  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0350  peptide chain release factor 2  48.4 
 
 		 335 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0923  peptide chain release factor 2  53.77 
 
 		 310 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  55.23 
 
 		 364 aa  342  4e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  53.77 
 
 		 365 aa  342  4e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00072  peptide chain release factor 2  55.99 
 
 		 329 aa  342  7e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  51.78 
 
 		 332 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  53.44 
 
 		 365 aa  340  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  52.79 
 
 		 365 aa  339  2.9999999999999998e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  53.11 
 
 		 365 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  54.75 
 
 		 374 aa  339  2.9999999999999998e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  51.6 
 
 		 375 aa  339  4e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  53.11 
 
 		 365 aa  338  5e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  52.46 
 
 		 364 aa  338  5.9999999999999996e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  51.79 
 
 		 459 aa  338  8e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  52.79 
 
 		 365 aa  338  8e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  53.11 
 
 		 325 aa  337  9.999999999999999e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  51.79 
 
 		 367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  51.79 
 
 		 391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  51.79 
 
 		 367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  51.79 
 
 		 367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  52.12 
 
 		 391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  52.44 
 
 		 354 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  51.79 
 
 		 391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  51.79 
 
 		 406 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  51.79 
 
 		 391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2758  peptide chain release factor 2  52.77 
 
 		 367 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2248  hypothetical protein  52.77 
 
 		 367 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1069  peptide chain release factor 2  52.12 
 
 		 347 aa  335  5e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  50.16 
 
 		 417 aa  334  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  53.44 
 
 		 349 aa  334  1e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0604  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  52.41 
 
 		 365 aa  333  2e-90  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  54.22 
 
 		 366 aa  333  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1151  peptide chain release factor 2  53.09 
 
 		 381 aa  333  3e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  53.07 
 
 		 369 aa  333  3e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  53.11 
 
 		 349 aa  332  4e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  52.46 
 
 		 364 aa  332  5e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0456  peptide chain release factor 2  53.77 
 
 		 338 aa  332  5e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.454858  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  50.49 
 
 		 357 aa  332  6e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  51.79 
 
 		 349 aa  332  6e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1216  peptide chain release factor 2  54.61 
 
 		 347 aa  332  6e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000777998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  52.79 
 
 		 364 aa  331  1e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  51.8 
 
 		 366 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0725  peptide chain release factor 2  52.13 
 
 		 332 aa  330  2e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159955  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1847  peptide chain release factor 2  53.56 
 
 		 300 aa  330  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  51.47 
 
 		 357 aa  330  3e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  51.48 
 
 		 365 aa  330  3e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>